ImageJ支持计算机全平台：ImageJ是用Java编写的，它允许它在32位和64位模式下在Linux，Mac OS X和Windows上运行。
开源：ImageJ及其 Java源代码 可在公共领域免费获得 。无需许可证。
用户社区：ImageJ拥有庞大且知识渊博的全球用户社区。超过1700名用户和开发人员订阅了 ImageJ邮件列表。
宏：使用宏自动执行任务并创建自定义工具 。使用命令记录器生成宏代码 并使用宏调试器对其进行 调试。 ImageJ网站上提供了300多个宏 。
插件：通过使用ImageJ的内置文本编辑器和Java编译器开发插件来扩展ImageJ。超过500个插件可用。
工具包：使用ImageJ作为图像处理工具包(类库)来开发 applet，servlet或应用程序。
速度：ImageJ是世界上最快的纯Java图像处理程序。它可以在0.1秒(*)内过滤2048x2048图像。那是每秒4000万像素！
数据类型：8位灰度或索引颜色，16位无符号整数，32位浮点和RGB颜色。
文件格式：打开并保存所有支持的数据类型，如TIFF(未压缩)或原始数据。打开并保存GIF，JPEG，BMP，PNG，PGM，FITS和ASCII。打开DICOM。使用URL打开TIFF，GIF，JPEG，DICOM和原始数据。使用插件打开并保存许多其他格式 。
图像显示：工具提供了用于缩放(1:32到32：1)和滚动图像。所有分析和处理功能均可在任何放大倍数下工作。
选择：创建矩形，椭圆形或不规则区域选择。创建线和点选择。编辑选择并使用棒工具自动创建它们。绘制，填充，清除，过滤或测量选择。保存选择并将其传输到其他图像。
图像增强：支持8位灰度和RGB彩色图像的平滑，锐化，边缘检测，中值滤波和阈值处理。交互式调整8,16和32位图像的亮度和对比度。
几何操作：裁剪，缩放，调整大小和旋转。垂直或水平翻转。
分析：测量选区或整个图像的面积，平均值，标准偏差，最小值和最大值。测量长度和角度。使用真实世界的测量单位，如毫米。使用密度标准进行校准。生成直方图和剖面图。
编辑：剪切，复制或粘贴图像或选择。使用AND，OR，XOR或“混合”模式粘贴。向图像添加文本，箭头，矩形，椭圆或多边形。
色彩处理：将32位彩色图像分割为RGB或HSV组件。将8位组件合并为彩色图像。将RGB图像转换为8位索引颜色。将伪彩色调色板应用于灰度图像。
栈：在单个窗口中显示相关图像的“堆栈”。使用单个命令处理整个堆栈。以堆栈形式打开图像文件夹。将堆栈保存为多图像TIFF文件。
