目录
- 1.数据倾斜
- 2.TopN
- 3.Join优化
- 预排序的join
- cross join
- 考虑Join顺序
- 4.根据HashMap、DF等数据集进行filter
- 5.Join去掉重复的列
- 6.展开NestedDF
- 7.计算session/组内时间差
- 8.用flatMap替代map + filter
- 9.分层抽样
- 10.SQL与DF API
- 11.Shuffle后的分区
- 12.多维分析的优化
1.数据倾斜
后果:大部分task和小部分task完成时间相差很大、OOM(也有可能时异常数据的问题,需要完善代码)。
分析:用sample + countBykey -> 除以count判断key的分布情况。
解决方法:
- 采用map-side聚合的算子
- 提高并行度repartition
- 先估计分布,确定哪些key导致倾斜,如果单个key数据不是太大,可以自定义partition为其分区;如果单个key数据很大,就多key进行改造。
- join类倾斜:
- 过滤掉业务无关null再join
- 其中一个表小时,广播join
- 倾斜数据分离:分离出倾斜部分的表,这个表通常不大,此时再广播join
- 如果单个key过大,那只能对该key进行改造了,即为key添加一个随机后序,如0、1、2中的一个,而另一个表则要扩大3倍,每条数据的key分别加上0、1、2的后缀(为保证所有key都被分配0后缀,从而另一个表没有足够的数据join)。这里可以自定义一些UDF来实现对数据分布的估计和改造key中n,即打散程度,的选择。
- 数据源:尽量用可分割文件保存数据、repartition
2.TopN
TopN问题可分为4种
- 已有可比较数据的总体TopN。例如从一个班的语文成绩表中找前5名的学生,只是这个表的数据在不同的节点上。
- DF转pairRDD后用takeOrdered()。优点:不需要全排;缺点:结果为聚合到Driver的Array,所以不适合N较大的情况。
- DF -> sort -> rdd -> zipWithIndex -> filter(index < n) 。优点:适合N较大的情况,结果仍然是分布式的;缺点:全排,N较小时比上面慢
- DF的sort后take。优点:简单;缺点:全排,N较大时很慢,甚至会OOM(take会将结果都shuffle到一个partition中)
- 已有可比较数据分组TopN。例如从两个班的语文成绩表中找各班前5名的学生。
- Aggragator。优点:快;缺点:较复杂
- window function。优点:简单,适合N较大或者数据量较小;缺点:数据量大时稍慢(window function并不进行map-side聚合,所以shuffle量较大)
- 未有可比较数据,需要分组聚合后才能比较的总体TopN。例如一个班每名学生各科成绩都在一个表上,求总分前5名的学生。
- DF.groupBy().agg()然后接上面的“总体TopN”
- 未有可比较数据,需要分组聚合后才能比较的分组TopN。例如两个班每名学生各科成绩都在一个表上,求各班总分前5名的学生。
- DF.groupBy().agg()然后使用windowFunction。因为经过前面的groupBy的shuffle后,数据已经有了partitioner。所以此处的windowfunc操作并不会shuffle
// Aggragator例子
class TopNAggregator[K1: TypeTag, K2: TypeTag, V: TypeTag](num: Int, ord: Ordering[(K2, V)])
extends Aggregator[(K1, K2, V), mutable.PriorityQueue[(K2, V)], Array[(K2, V)]] {
override def zero: mutable.PriorityQueue[(K2, V)] = new mutable.PriorityQueue[(K2, V)]()(ord)
override def reduce(q: mutable.PriorityQueue[(K2, V)],
a: (K1, K2, V)): mutable.PriorityQueue[(K2, V)] = {
if (q.size < num) {
q += ((a._2, a._3))
} else {
q += ord.min((a._2, a._3), q.dequeue)
}
}
override def merge(q1: mutable.PriorityQueue[(K2, V)],
q2: mutable.PriorityQueue[(K2, V)]): mutable.PriorityQueue[(K2, V)] = {
q1 ++= q2
while (q1.length > num) {
q1.dequeue()
}
q1
}
override def finish(r: mutable.PriorityQueue[(K2, V)]): Array[(K2, V)] = {
r.toArray.sorted(ord.reverse)
}
override def bufferEncoder: Encoder[mutable.PriorityQueue[(K2, V)]] = {
Encoders.kryo[mutable.PriorityQueue[(K2, V)]]
}
override def outputEncoder: Encoder[Array[(K2, V)]] = ExpressionEncoder[Array[(K2, V)]]()
}
// 使用
val topNAggregator = new TopNAggregator[Int, Int, Float](10, Ordering.by(-_._2))
df.groupByKey()
.agg(topNAggregator.toColumn)
3.Join优化
预排序的join
针对SortMergeJoinExec,在mapper端提前sort。原代码在Reducer端进行排序,但reducer端的数据不及mapper端均匀,所以排序工作量不一,会导致尾部延迟放大。Map阶段会按照key的哈希值对数据进行重分区并按key排序。Reducer只需对来自不同Mapper的数据进行归并排序。这种机制相当于把Reducer排序的任务分流给Mapper。而由于Mapper的数据量往往是比较均匀的,所以排序的性能会优于Reducer。
待考证:如果直接处理RDD,对两个需要join的RDD调用 repartitionAndSortWithinPartitions 然后join
cross join
当每条数据都需要和其余的每条数据进行计算时,例如计算相似度矩阵,下面的方法进行crossjoin能够大大减小其中间结果。实验时直接crossjoin能产生3G以上的数据,应用此方法则只有几十M。
val ready2Crossjoin = movieFeatures.as[(Int, Array[Float])]
.mapPartitions(_.grouped(4096))
implicit val ordering = new Ordering[(Int, Float)] {
def compare(x: (Int, Float), y: (Int, Float)): Int = {
val compare2 = x._2.compareTo(y._2)
if (compare2 != 0) return -compare2
0
}
}
val ratings = ready2Crossjoin.crossJoin(ready2Crossjoin)
.as[(Seq[(Int, Array[Float])], Seq[(Int, Array[Float])])]
.flatMap {
case (mf1Iter, mf2Iter) =>
val m1 = mf1Iter.size
val m2 = math.min(mf2Iter.size, 100)
var i = 0
val output = new Array[(Int, Int, Float)](m1 * m2)
val pq = mutable.PriorityQueue[(Int, Float)]()
val vectorOp = new F2jBLAS
mf1Iter.foreach { case (m1Id, mf1Factor) =>
mf2Iter.foreach { case (m2Id, mf2Factor) =>
if (m1Id == m2Id) {
// do nothing
} else {
val simScore = consinSim(ALSRank, vectorOp, mf1Factor, mf2Factor)
if (pq.length < m2) {
pq.enqueue((m2Id, simScore))
} else {
val temp = pq.dequeue()
pq += (if (temp._2 > simScore) temp else (m2Id, simScore))
}
}
}
pq.foreach { case (mf2Id, score) =>
output(i) = (m1Id, mf2Id, score)
i += 1
}
pq.clear()
}
output.toSeq
}
private def consinSim(rank: Int, operator: F2jBLAS, movie1: Array[Float], movie2: Array[Float]): Float = {
operator.sdot(rank, movie1,1, movie2, 1) / operator.snrm2(rank, movie1,1) * operator.snrm2(rank, movie2,1)
}
考虑Join顺序
Spark SQL的CBO尚未成熟,不能对SQL中的join的顺序做智能调整。顺序的确定需要对数据表的分布有所了解,从而推断某些顺序能够产生更少的中间数据,进而提高效率。
4.根据HashMap、DF等数据集进行filter
在HashMap、DF等数据集较小的情况下:
- HashMap:广播map,然后根据contain来filter。适合数据集较小的情况。
- DF:提取相应的列后,然后用left_anti。适合比上面数据集稍大的情况。
当数据集很大时,同样利用上面DF的方法,但去掉broadcast,然Spark自行决定如何join。
// HashMap filter
val BCMap = sc.broadcast(mapForFilter)
val filteredDF = df.filter($"col_name" isin (BCMap.value: _*))
// DF filter
val DFForFilter = df1.select("id")
val filteredDF = df0.join(broadcast(filteredDF), Seq("id"), "left_anti"))
5.Join去掉重复的列
val df = left.join(right, Seq("name"))
6.展开NestedDF
+---+-----------+
| _1| _2|
+---+-----------+
| 1|[2, [3, 4]]|
+---+-----------+
+---+-----+--------+--------+
| _1|_2._1|_2._2._1|_2._2._2|
+---+-----+--------+--------+
| 1| 2| 3| 4|
+---+-----+--------+--------+
implicit class DataFrameFlattener(df: DataFrame) {
def flattenSchema: DataFrame = {
df.select(flatten(Nil, df.schema): _*)
}
protected def flatten(path: Seq[String], schema: DataType): Seq[Column] = schema match {
case s: StructType => s.fields.flatMap(f => flatten(path :+ f.name, f.dataType))
case other => col(path.map(n => s"`$n`").mkString(".")).as(path.mkString(".")) :: Nil
}
}
veryNestedDF.flattenSchema.show()
7.计算session/组内时间差
val timeFmt = "yyyy-MM-dd HH:mm:ss"
val sessionid2ActionsRDD2 = UserVisitActionDF
.withColumn("action_time", unix_timestamp($"action_time", timeFmt))
.groupBy("session_id")
.agg(min("action_time") as "start",
max("action_time") as "end",
.withColumn("visitLength", $"start" - $"end")
8.用flatMap替代map + filter
df.flatMap(if (filter_condition) Some(result) else None)
9.分层抽样
// 各种类型抽取10%
val fractions = HashMap(
TYPE1 -> 0.1,
TYPE2 -> 0.1,
TYPE3 -> 0.1
)
val randomSeed = 2L
df.stat.sampleBy("col_name", fractions, randomSeed)
// 如果col_name的数据种类未知,用下面方式得出fractions
df.select("time_period")
.distinct
.map(x=> (x, 0.1))
.collectAsMap
10.SQL与DF API
SQL作为声明式语言,即只需要指定所需数据的模式就能得到结果。这种语言的编程思路容易让人忽略代码的执行顺序,从而写出一些执行效率低的代码。尽管Spark有Optimizer优化,但尚未完全成熟,部分SQL语句无法实现filter、aggregation等下推。
DF API是一种函数式的语言,能让编程者注意到执行顺序,减小写出低效代码的可能。
11.Shuffle后的分区
使用DF时,开启自动分区。
如果适用RDD,则有些shuffle是可以输入partitioner参数的,这就可以控制shuffle后的分区数,一些情况还能避免shuffle。如下面代码,rdd2执行reduceByKey的shuffle时使用rdd1的partitioner,那么之后的rdd3和rdd1的join就不需要shuffle了。
val rdd1Partitioner = rdd1.partitioner match {
case Some(p) => p
case None => new HashPartitioner(rdd1.partitions.length)
}
val rdd3 = rdd2.reduceByKey(rdd1Partitioner, (x, y) => if (x > y) x else y)
rdd3.join(rdd1)
12.多维分析的优化
多维分析,如rollup、cube等的算子,在Spark内置的是Expand方式,根据选用的算子一次性开辟足够的内存。如果实现Union方式的二次开发,即读取一次计算一个维度的结果,然后不断union这些结果,能在某些情况提升效率。
总体来说,Expand方式适合维度小的多维分析,Union方式适合维度大的多维分析。这是因为Expand方式读取数据的次数只有一次,但数据会膨胀2n倍,而Union方式会读取数据2n次。