不管是经典的 Java EE 架构，还是轻量级 Java EE 架构，大致都可分为如下几层：
Domain Object（领域对象）层。此层由一系列的 POJO（Plain Old Java Object，普通的、传统的Java对象）组成，这些对象是该系统的 Domain Object（领域对象），往往包含了各自所需实现的业务逻辑方法。
DAO（Data Access Object，数据访问对象）层。此层由一系列的 DAO 组件组成，这些DAO 实现了对数据库的创建、查询、更新和删除（CRUD）等原子操作。
Service（业务逻辑）层。此层由一系列的业务逻辑对象组成，这些业务逻辑对象实现了系统所需要的业务逻辑方法。这些业务逻辑方法可能仅仅用于暴露 Domain Object 对象所实现的业务逻辑方法，也可能是依赖 DAO 组件实现的业务逻辑方法。
Controller（控制器）层。此层由一系列控制器组成，这些控制器用于拦截用户请求，并调用业务逻辑组件的业务逻辑方法，处理用户请求，并根据处理结果向不同的表现层组件转发。
View（表现）层。此层由一系列的 JSP 页面、Velocity 页面、PDF 文档视图组件组成，负责收集用户请求，并显示处理结果。
大致上，Java EE 应用的架构如下图所示。
各层的 Java EE 组件之间以松耦合的方式耦合在一起，各组件之间并不以硬编码方式耦合，这种方式是为了应用以后的扩展性。从上向下，上面组件的实现依赖于下面组件的功能；从下向上，下面组件支持上面组件的实现。
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