Image J是一款功能强大的图像处理软件，在生物数据分析中应用极为广泛，重点是该软件是免费开源的！Fiji是包含了很多不同功能插件的Image J，即加强版的Jmage J，因此为了使用方便，建议大家直接下载Fiji。
在我们利用荧光显微镜获得一张图像后，该如何更漂亮的、更专业的给老板和同实验室的小伙伴展示呢，今天我想跟大家分享一套常规操作～～
1第一步 调节图像亮度和对比度
在用显微镜拍摄图像的时候，有时候因为仪器激光强度和曝光时间等参数设置的不太合适，或者信号本身表达量比较低导致获得的荧光图像偏弱、比较暗，看不清信号；亦或有一些背景信号，这也会影响图像的展示，因此为了方便和清楚的观察信号，适当的调节图像的亮度是必要的。
1.打开图像之后，选择Image-Adjust-Color balance
2. 即可调出如下调整框，拉动滑条进行亮度的调节，第一个滑条Minimum向右拉是扣除背景；第二个滑条向左拉是调亮；第三个滑条大家自己试一试就知道是干啥的啦；在Channel 1下拉框选择需要调节的通道。所有通道调节完毕后，如果点击Apply则会将调节之后的灰度值应用到图像上，进而更改图像，在这里小编不建议大家点击Apply
2第二步 添加标尺
如果打开的图像是显微镜原始格式的文件，例如尼康的nd2、蔡司的czi\lsm\zvi、奥林巴斯的oir\oib\oif、徕卡lif等显微镜原始格式文件，则直接调出标尺即可。
1.选择Analyze-Tools-Scale bar
2.显示如下Scale Bar界面，进行参数设置，其中Width in um 和Height in pixels 设置标尺条的长度和高度；Font size 设置字体的大小；Color设置标尺和字的颜色；Background设置是否有背景色或选择何种背景色；Location 下拉键中选择把标尺放到图片中哪个位置，如右图，可以选择四个位置；Overlay 勾选表示标尺会嵌在图片中，不能再修改。
3.其实也可以自由设定标尺放置的位置，打开图像后先点击矩形选择工具(菜单栏File按钮下方的灰色矩形框)在图像上画出一个想放标尺的框，然后按照上述操作进行就好了
3第三步 保存图像
同时保存单通道和merge图像，最后将这些图像排版成一张图像进行展示，利用montage功能进行多图排版。
1. 保存单通道图像. 打开一张包含多个通道的图像后，选择Image-Color-Split Channels… 即可将一张多通道图拆分成多张单通道图，然后分别选中这几张图点击File-Save as-Tiff即可保存并用于展示。
2. 保存多个通道merge图像. 首先按照上述方法进行通道拆分，拆分成单通道单张图像后，同时打开这几张图，选择Image-Color-Merge Channels… 进行通道merge
3. 最后我们大多数时候会选择在ppt中同时显示这一组单通道和merge图片，那么在这里我们可以利用montage功能完成
A.首先在软件中同时打开保存好的单通道和merge图像，如下图
B.然后选择 Image-Stacks-Image to stacks 制作成一个stack图
C.即可生成一个如下包含三张图片的图，
D.然后选择Image-Stacks-Make Montage… 排版
E.即可显示如下界面并进行设置，Columns 和 Rows表示这三张图像以几列几行的方式排版；Scale factor表示新生成的图片在原始图像的基础上放大缩小的比例；First slice和Last slice表示stack图像中的哪几张需要排版展示；Increment表示选择的连续图像是否间隔展示；Border width 表示排版出来的相邻图片之间留白的长度，单位是pixel；Lable slices勾选上会给图像进行编号，Font size表示编号号码的字体大小；全部设置好之后点击ok
F.即可生成一张如下所示图像，注意，是一张哦！保存后直接在ppt展示就好啦
