导语

前前后后找了不少方法途径,最后还是“通过充值解决问题”。使用奶牛快传来分发 TBtools 软件以及相关数据库,可以确保每个人都快速获得文件,经过国内国外多地多点测试,一般速度可以有 3Mb/s 以上。后续所有 TBtools 相关文件,都会通过这一通道提供。

软件快速下载通道

通过奶牛快传下载,打开链接可以看到(注意,数字越大,版本就越新)。

TBtools的meme进行motif分析 tbtools做go分析_数据库

双击该文件夹,并在其中下载电脑操作系统对应平台的安装器即可

TBtools的meme进行motif分析 tbtools做go分析_linux_02

其他文件下载如大型插件/数据库链接

GO 富集分析 - go-basic.obo

请自行注意文件更新日期

## 高速通道
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045
## 官方最新
http://purl.obolibrary.org/obo/go/go-basic.obo

GO 注释相关

注意,一般现在推荐直接使用 eggNOG-mapper 注释,无需下载数据,详细见教程https://www.yuque.com/go/doc/61378880

## idmapping.tb.gz ~10Gb
## 高速通道
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045

KEGG 富集分析 - XXX.TBtoolsKeggBackEnd

使用 TBtools 进行 KEGG 富集分析,往往建议用户使用 TBtools 自行生成 BackEnd 文件,但是国内访问KEGG网站网速感人,故准备系列文件,放在此处,用户可自行按照需要下载

## 高速通道
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045

内容包括:

  1. Plants.20211129.TBtoolsKeggBackEnd
  2. Animals.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
  3. Archaea.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
  4. Bacteria.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
  5. Eukaryotes.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
  6. Fungi.20211128.TBtoolsKeggBackEnd
  7. Prokaryotes.20211129.TBtoolsKeggBackEnd
  8. Protists.20211129.TBtoolsKeggBackEnd

KEGG 注释相关

注意,一般现在推荐直接使用 eggNOG-mapper 注释,详细见教程https://www.yuque.com/go/doc/61378880

KEGG Pathway Mapp Illustrator - 通路着色数据库

KEGG 通路图稿上色并提供交互,一般建议用户使用 TBtools 自行准备好数据库文件,但是国内访问KEGG网站网速感人,故准备系列文件,放在此处,用户可自行按照需要下载

## TBtoolsKEGGMap.DB
https://tbtools.cowtransfer.com/s/566e88227a0045

使用方式请参考

TBtools的meme进行motif分析 tbtools做go分析_python_03

R插件相关

Rserver.plugin

所有 TBtools R 插件运行前均需要安装此插件

https://tbtools.cowtransfer.com/s/68df33e849a84c

DESeq2 Win64 Meta Package

为 Windows 用户准备的 DESeq2 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

https://tbtools.cowtransfer.com/s/436dba652f434b

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137

DESeq2 MacOS Meta Package

为 MacOS 用户准备的 DESeq2 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

https://tbtools.cowtransfer.com/s/64c985fce6e84f

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137

CHeatmapShiny Win64  Meta Package

为 Windows 用户准备的 CHeatmapShiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

https://tbtools.cowtransfer.com/s/2f8d3738f06c4e

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137

CHeatmapShiny MacOS Meta Package

为 MacOS 用户准备的 CHeatmapShiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

https://tbtools.cowtransfer.com/s/271a7df578d646

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137

注意,如果安装后还运行失败,那么报错很可能是 ComplexHeatmap 依赖的 Cario包需要 X11 环境,通过链接 https://www.xquartz.org/ 下载安装即可

WGCNAshiny Win64 Meta Package

为 Windows 用户准备的 WGCNAshiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

https://tbtools.cowtransfer.com/s/ed68de62d8c748

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137

WGCNAshiny MacOS Meta Package

为 MacOS 用户准备的 WGCNAshiny 插件全家桶,下载后加载进去,即可确保功能正常运行

https://tbtools.cowtransfer.com/s/06bef979c3c44a

使用方法参考:https://www.yuque.com/go/doc/56330137

注意,如果安装后还运行失败,那么报错很可能是 ComplexHeatmap 依赖的 Cario包需要 X11 环境,通过链接 https://www.xquartz.org/ 下载安装即可

事实上,上述内容,从《TBtools Cookbook》照搬。