Kubernetes安装GPU支持插件
- Kubernetes1.10.x可以直接支持GPU的容器调度运行了,通过安装该插件即可。
- 这里的方法基于NVIDIA device plugin,仅支持Nvidia的显卡和Tesla计算卡。
- 主要步骤:
- 安装图形卡的Nvidia Drivers。
- 安装Nvidia-Docker2容器运行时。
- 启用Nvidia-Docker2为容器引擎默认运行时。
- 启用Docker服务的GPU加速支持。
- 安装NVIDIA device plugin。
- 启用Kubernetes的GPU支持。
一、安装NVidia支持的Docker引擎
安装NVidia支持的Docker引擎,就可以在容器中使用GPU了。具体步骤如下:
# If you have nvidia-docker 1.0 installed: we need to remove it and all existing GPU containers
docker volume ls -q -f driver=nvidia-docker | xargs -r -I{} -n1 docker ps -q -a -f volume={} | xargs -r docker rm -f
sudo apt-get purge -y nvidia-docker
# Add the package repositories
curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/gpgkey | \
sudo apt-key add -
distribution=$(. /etc/os-release;echo $ID$VERSION_ID)
curl -s -L https://nvidia.github.io/nvidia-docker/$distribution/nvidia-docker.list | \
sudo tee /etc/apt/sources.list.d/nvidia-docker.list
sudo apt-get update
# Install nvidia-docker2 and reload the Docker daemon configuration
sudo apt-get install -y nvidia-docker2
sudo pkill -SIGHUP dockerd
# Test nvidia-smi with the latest official CUDA image
docker run --runtime=nvidia --rm nvidia/cuda nvidia-smi
注意,现在像上面运行 Docker 可以直接支持GPU了,不用再单独运行Docker-Nvidia命令了,大大增强了与各种容器编排系统的兼容性,Kubernetes目前也已经可以支持Docker容器运行GPU了。
- 参考
目前版本依赖Docker 18.03版,如果已经安装了其它版本,可以指定安装的版本,如下:
sudo apt install docker-ce=18.03.1~ce-0~ubuntu
二、安装Nvidia的Kubernetes GPU插件
Kubernetes的NVIDIA device plugin是Daemonset,允许自动地:
- 公开集群中每一个节点的GPU数量。
- 对GPU运行健康状况保持跟踪。
- 在Kubernetes中运行支持的GPU容器实例。
Kubernetes device plugin 项目包含Nvidia的官方实现。
2.1 环境要求
运行NVIDIA device plugin的环境要求如下:
- NVIDIA drivers ~= 361.93,安装参考
- nvidia-docker version > 2.0 (参考上面第一部分)
- docker 配置 nvidia-docker为 default runtime.
- Kubernetes version = 1.10,安装参考
- The
DevicePlugins
feature gate enabled
2.2 准备 GPU Nodes
下面的步骤需要在所有的GPU节点上执行。此外,在此之前 NVIDIA drivers 和 nvidia-docker 必须已经成功安装。
首先,检查每一个节点,启用 nvidia runtime为缺省的容器运行时。我们将编辑docker daemon config文件,位于/etc/docker/daemon.json
{
"exec-opts": ["native.cgroupdriver=systemd"],
"default-runtime": "nvidia",
"runtimes": {
"nvidia": {
"path": "/usr/bin/nvidia-container-runtime",
"runtimeArgs": []
}
}
}
上面的这一行("exec-opts": ["native.cgroupdriver=systemd"])是在Ubuntu16.04+DockerCE上面必须要的,否则kubelet无法成功启动(参考 )。
如果
runtimes
没有, 到nvidia-docker 参考,首先进行安装。
第二步,启用 DevicePlugins
feature gate,在每一个GPU节点都要设置。
如果你的 Kubernetes cluster是通过kubeadm部署的,并且节点运行systemd,需要打开kubeadm 的systemd unit文件,位于 /etc/systemd/system/kubelet.service.d/10-kubeadm.conf
然后添加下面的参数作为环境变量:
Environment="KUBELET_GPU_ARGS=--feature-gates=DevicePlugins=true"
If you spot the Accelerators feature gate you should remove it as it might interfere with the DevicePlugins feature gate
完整的文件如下(/etc/systemd/system/kubelet.service.d/10-kubeadm.conf
):
[Service]
Environment="KUBELET_KUBECONFIG_ARGS=--bootstrap-kubeconfig=/etc/kubernetes/bootstrap-kubelet.conf --kubeconfig=/etc/kubernetes/kubelet.conf"
Environment="KUBELET_SYSTEM_PODS_ARGS=--pod-manifest-path=/etc/kubernetes/manifests --allow-privileged=true"
Environment="KUBELET_NETWORK_ARGS=--network-plugin=cni --cni-conf-dir=/etc/cni/net.d --cni-bin-dir=/opt/cni/bin"
Environment="KUBELET_DNS_ARGS=--cluster-dns=10.96.0.10 --cluster-domain=cluster.local"
Environment="KUBELET_AUTHZ_ARGS=--authorization-mode=Webhook --client-ca-file=/etc/kubernetes/pki/ca.crt"
Environment="KUBELET_CADVISOR_ARGS=--cadvisor-port=0"
Environment="KUBELET_CERTIFICATE_ARGS=--rotate-certificates=true --cert-dir=/var/lib/kubelet/pki"
Environment="KUBELET_CGROUP_ARGS=--cgroup-driver=systemd"
Environment="KUBELET_EXTRA_ARGS=--fail-swap-on=false"
Environment="KUBELET_GPU_ARGS=--feature-gates=DevicePlugins=true"
ExecStart=
ExecStart=/usr/bin/kubelet $KUBELET_KUBECONFIG_ARGS $KUBELET_SYSTEM_PODS_ARGS $KUBELET_NETWORK_ARGS $KUBELET_DNS_ARGS $KUBELET_AUTHZ_ARGS $KUBELET_CADVISOR_ARGS $KUBELET_CERTIFICATE_ARGS $KUBELET_CGROUP_ARGS $KUBELET_EXTRA_ARGS $KUBELET_GPU_ARGS
重新载入配置文件,然后重新启动服务:
$ sudo systemctl daemon-reload
$ sudo systemctl restart kubelet
In this guide we used kubeadm and kubectl as the method for setting up and administering the Kubernetes cluster, but there are many ways to deploy a Kubernetes cluster. To enable the
DevicePlugins
feature gate if you are not using the kubeadm + systemd configuration, you will need to make sure that the arguments that are passed to Kubelet include the following--feature-gates=DevicePlugins=true
.
2.3 在Kubernetes中启用GPU支持
完成所有的GPU节点的选项启用,然后就可以在在Kubernetes中启用GPU支持,通过安装Nvidia提供的Daemonset服务来实现,方法如下:
$ kubectl create -f https://raw.githubusercontent.com/NVIDIA/k8s-device-plugin/v1.10/nvidia-device-plugin.yml
2.4 运行需要GPU的工作负载
NVIDIA GPUs 调用可以通过容器级别资源请求来实现,使用resource name为 nvidia.com/gpu:
apiVersion: v1
kind: Pod
metadata:
name: gpu-pod
spec:
containers:
- name: cuda-container
image: nvidia/cuda:9.0-devel
resources:
limits:
nvidia.com/gpu: 2 # requesting 2 GPUs
- name: digits-container
image: nvidia/digits:6.0
resources:
limits:
nvidia.com/gpu: 2 # requesting 2 GPUs
⚠️注意: 如果未指定GPU资源请求,在使用 device plugin 的 NVIDIA images,将使用容器中公开的所有GPU资源。
2.5 文档
⚠️请注意:
- device plugin feature is still alpha which is why it requires the feature gate to be enabled.
- the NVIDIA device plugin is still considered alpha and is missing
- Security features
- More comprehensive GPU health checking features
- GPU cleanup features
- ...
- support will only be provided for the official NVIDIA device plugin.
下面将重点介绍如何构建device plugin和运行。
2.6 通过Docker
构建-Build
选项 1, 拉取预先编译的容器镜像,到 Docker Hub:
$ docker pull nvidia/k8s-device-plugin:1.10
选项 2, 不拉取代码库自行构建容器镜像:
$ docker build -t nvidia/k8s-device-plugin:1.10 https://github.com/NVIDIA/k8s-device-plugin.git#v1.10
选项 3, 拉取代码库自行构建,可以修改:
$ git clone https://github.com/NVIDIA/k8s-device-plugin.git && cd k8s-device-plugin
$ docker build -t nvidia/k8s-device-plugin:1.10 .
本地运行
$ docker run --security-opt=no-new-privileges --cap-drop=ALL --network=none -it -v /var/lib/kubelet/device-plugins:/var/lib/kubelet/device-plugins nvidia/k8s-device-plugin:1.10
部署为DaemonSet:
$ kubectl create -f nvidia-device-plugin.yml
2.7 不用Docker
构建-Build
$ C_INCLUDE_PATH=/usr/local/cuda/include LIBRARY_PATH=/usr/local/cuda/lib64 go build
本地运行
$ ./k8s-device-plugin