大家好,我是小马老师。
对于一些金属体系的变形模拟,在lammps运算完成后,通常需要将轨迹文件导入到ovito进行分析。
ovito分析晶体变形的方法有很多,比如DXA、CNA等。
在一些论文中,会使用下图的方法分析晶内变形情况:
下面介绍一下这种图像的绘制方法。
(1)ovito打开轨迹文件
以Ni的拉伸模拟结果为例,拉伸轨迹文件导入到ovito中如下图所示:
(2)调用位错分析DXA
“Add modification”-“Dislocation analysis”
调用DXA后,主界面会以不同的颜色显示不同的相,并标出位错线位置。
下面通过删除部分相观察晶内变形情况,如删除FCC相。
(3)添加公式选择要删除的原子
“Add modification”-“Expression selection”
在下面的公式输入框中输入:
(StructureType ==1 || StructureType ==0) && (Position.X <= 105 && Position.X >= 0)
StructureType对应不同的相,例如1为绿色fcc相,0为白色other。
Position.X设置为只选择x坐标位于[0,105]之间的原子,这个根据个人需要设置,可用也可以不用。
(4)删除选定原子
“Add modification”-“Delete selected”
删除选定原子,为显示方便,可关闭“Simulation cell"、“Defect mesh”。
如果显示不清晰,可添加阴影渲染"Ambient occlusion"
这个案例给大家提供一种后处理思路,至于需要删除哪些原子以及保留哪部分数据,要根据模型具体情况具体分析,模型不同或者分析侧重点不同,处理方法可能会不同。
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