大家好，我是小马老师。
Lammps模拟完成后，一般需要进行图像后处理，因为lammps不带后处理功能，这些图像后处理需要借助第三方软件实现，比如vmd、ovito等。
本文主要介绍在Ovito中如何标记原子的内部运动。
比如，在下面的剪切模拟中，中间部分原子被标记为绿色，在后续的剪切过程中，可以明显地观察到这些原子的运动轨迹。
下面介绍一下具体实现的过程。
1. 导入数据文件
打开Ovito软件，导入dump.xyz轨迹文件，如下图所示。
2. 选择中间原子
点击Ovito右上角菜单“Add modification”，选择“Expression selection”
在“Boolean expression”窗口内输入：
Position.X >25 && Position.X < 32
选择x坐标处于（25，32）之间的原子，被选定的原子显示为红色。
3. 冻结属性
点击Ovito右上角菜单“Add modification”，选择“Freeze property”：
在“Property to freeze”栏目下选择“Selection”作为要冻结的属性。
4. 指定颜色
点击Ovito右上角菜单“Add modification”，选择“Assign color”指定一种颜色即可。
这样，在观察各帧的原子图像时，原子的着色会被保留下来，可以看到中间原子的运动轨迹。
END
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