作为机器学习的小白和matlab的小白自己参照 python的 《机器学习实战》 写了一下分类回归树,这里记录一下。
关于决策树的基础概念就不过多介绍了,至于是分类还是回归。。我说不清楚。。我用的数据集是这个http://archive.ics.uci.edu/ml/datasets/Abalone 就是通过一些属性来预测鲍鱼有多少头,下面看一下
Length / continuous / mm / Longest shell measurement
Diameter / continuous / mm / perpendicular to length
Height / continuous / mm / with meat in shell
Whole weight / continuous / grams / whole abalone
Shucked weight / continuous / grams / weight of meat
Viscera weight / continuous / grams / gut weight (after bleeding)
Shell weight / continuous / grams / after being dried
Rings / integer / -- / +1.5 gives the age in years
这些属性除了最后的Rings是整数,可以看做是离散的,其他都是浮点数,是连续的。所以还是用cart中二分的思想,就是小于等于分一边,大于分一边。但是没有用gini指数,因为熵还是好一点。
代码在github:https://github.com/jokermask/matlab_cart
参照《机器学习实战》代码有5个部分:getEnt(获取信息熵),splitDataset(通过属性和阈值分割数据集),chooseBestFeatureToSplit(寻找最佳分割点和阈值),createTree(建树),predict(预测)。
我按流程梳理一下,首先函数脚本来将数据集划分成,训练集和测试集,然后用训练集建树,用测试集测试,(更改后变成bootstrap sampleing)
dataset = importdata('abalone.data.txt') ;
origin_data = dataset.data ;
labels = {'Length';'Diam';'Height'; 'Whole';'Shucked';'Viscera';'Shell';'Rings'} ;
test_runtimes = 50 ;
ae = 0 ;
rr = 0 ;
for i=1:test_runtimes
data = sampleWithReplace(origin_data) ;%bootstrap sampling
len = floor(length(data)/4*3) ;
train_data = data(1:len,:) ;
test_data = data(len:end,:) ;
test_y_truth = test_data(:,end) ;
% tree = createTree(train_data,labels,0) ;
% predict_y = predict(tree,test_data,labels) ;
% com_matrix = [predict_y,test_y_truth] ;
% count = sum(predict_y==test_y_truth) ;
% disp(com_matrix) ;
% disp(mae) ;
% disp(rr) ;
%plot single runtime
% x = 1:1:size(test_y_truth,1) ;
% plot(x,predict_y,'-b',x,test_y_truth,'-r') ;
ae = ae+sum(abs(predict_y-test_y_truth))/size(test_y_truth,1) ;
rr = rr+count/size(test_y_truth,1) ;
%trian with office tools fitctree
std_tree = fitctree(train_data(:,1:7),train_data(:,end)) ;
% view(std_tree) ;
std_y = predict(std_tree,test_data(:,1:7)) ;
% disp([std_y,y]) ;
ae = ae+sum(abs(std_y-test_y_truth))/size(test_y_truth,1) ;
rr = rr+sum(std_y==test_y_truth)/size(test_y_truth,1) ;
end
mae = mae / test_runtimes ;
mrr = rr / test_runtimes ;
disp('mae') ;
disp(mae) ;
disp('mrr') ;
disp(mrr) ;
createTree函数:由于matlab没有指针,所以只能写成嵌套结构,就像tree{tree{tree}}这样。我们是递归实现的,但怎么样才会停止建树?条件是当前节点所有标签的类别一样,比如rings都为10,那说明这一个子集已经纯了,或者是这颗树的高度已经超出了我们设的阈值,就停止,第二种情况很可能当前节点下的数据集不纯,我们就找一个出现频率最高的类别代表该节点
function [ tree ] = createTree( dataset,labels,heightcount )
len = size(dataset,1) ;
templabel = dataset(1,end) ;
tree = templabel ;
max_depth = 5 ;%最大树高
flag = 1 ; %判断是否数据集中所有标签都一致了(纯的),是则返回
for i=1:len
if templabel~=dataset(i,end) ;
flag = 0 ;
end
end
if flag==1
return ;
end
if heightcount>max_depth
labelVec = dataset(:,end) ;
disp(labelVec) ;
element = 1:max(labelVec) ;
counts = histc(labelVec,element) ;
[~,max_idx] = max(counts) ;
tree = element(max_idx) ;
return ;
end
[bestFeat,bestT] = chooseBestFeatureToSplit(dataset) ;
bestFeatLabel = labels{bestFeat} ;
tree = struct ;%struct储存树结构
tree.bestFeatLabel = bestFeatLabel ;
tree.bestT = bestT ;
tree.greaterthan = createTree(splitDataset(dataset,bestFeat,bestT,1),labels,heightcount+1) ;%大于阈值部分的子树
tree.lessthan = createTree(splitDataset(dataset,bestFeat,bestT,2),labels,heightcount+1) ;%小于阈值部分的子树
end
chooseBestFeatureToSplit函数:在createTree时,每次递归都要找那个当前最佳的特征和阈值,也就是调用chooseBestFeatureToSplit函数,所以两层循环,第一层遍历每个属性,第二层本应该遍历每个属性下的值,但是那样计算量太大了,所以我就将值排序之后分成10端取中位数遍历,在里面找阈值,如果当前节点的数据子集已经不足10个里,那就把所有属性都遍历一哈
function [ bestFeat,bestT ] = chooseBestFeatureToSplit( dataset )
[~,numFeats] = size(dataset) ;
numFeats = numFeats-1 ;%除去标签那一列
baseEnt = getEnt(dataset) ;
baseInfoGain = 0 ;
bestFeat = -1 ;
for i=1:numFeats
featVec = dataset(:,i) ;
%由于值是连续的,所以对于特征向量组排序分成n段取中位数
sortedFeatVec = sort(featVec,'ascend') ;
lengthofT = floor(sqrt(length(sortedFeatVec))) ; %取向量长度开根号来确定阈值的个数
if lengthofT<10
lengthofT = length(sortedFeatVec) ;
selectedFeat = sortedFeatVec ;
else
step = floor(length(sortedFeatVec)/lengthofT) ;
selectedFeat = zeros(lengthofT,1) ;
for j=1:lengthofT
head = (j-1)*step+1 ;
tail = j*step ;
subSortedFeatVec = sortedFeatVec(head:tail) ;
selectedFeat(j) = median(subSortedFeatVec) ;
end
end
for k=1:lengthofT
newEnt = 0 ;
for l=1:2
subDataset = splitDataset(dataset,i,selectedFeat(k),l) ;
prob = size(subDataset,1)/size(dataset,1) ;
newEnt = newEnt + prob*getEnt(subDataset) ;
end
infoGain = baseEnt - newEnt ;
% disp('infoGain') ;
% disp(infoGain) ;
if(infoGain>baseInfoGain)
baseInfoGain = infoGain ;
bestFeat= i ;
bestT = selectedFeat(k) ;
end
end
end
end
计算信息增益(infoGain)的时候需要用到getEnt(获取信息熵),splitDataset(通过属性和阈值分割数据集)函数
splitDataset:
function [ retDataset ] = splitDataset(dataset,axis,value,arg )
%axis 代表键值的位置 value表示阈值 返回划分后的dataset,arg表示取大于的部分(1)还是小于等于的部分
if arg==1
retDataset = dataset(dataset(:,axis)>value,:) ;
else
retDataset = dataset(dataset(:,axis)<=value,:) ;
end
end
View Code
getEnt:
function [ ent ] = getEnt( data )
%index present the label
[datalen,~] = size(data) ;
maxLabel = max(data(:,end)) ;
labelCountsMap = zeros(maxLabel,1) ;%rings are all numbers
for i=1:datalen
label = data(i,end) ;
if labelCountsMap(label)~=0
labelCountsMap(label) = labelCountsMap(label) + 1 ;
else
labelCountsMap(label) = 1 ;
end
end
ent = 0 ;
% disp('labelMap') ;
% disp(labelCountsMap) ;
for i=1:maxLabel
if labelCountsMap(i)~=0
prob = labelCountsMap(i)/datalen ;
ent = ent - prob*log2(prob) ;
end
end
end
View Code
最后预测函数:
function [ classVec ] = predict( tree , dataset , labels)
%tree应由createTree函数生成
len = size(dataset,1) ;
classVec = zeros(len,1) ;
for i=1:len
dataVec = dataset(i,1:end-1) ;
tempnode = tree ;
while(isstruct(tempnode))
[~,tempFeatIdx] = ismember(tempnode.bestFeatLabel,labels) ;
if(dataVec(tempFeatIdx)>tempnode.bestT)
tempnode = tempnode.greaterthan ;
else
tempnode = tempnode.lessthan ;
end
end
classVec(i) = tempnode ;
end
end
View Code
更新了一下代码,加入了boostrap采样,就是有放回的采样,我是这样采用的,有多少个样本就进行多少次有放回采样,然后这个过程进行50次求均值。用了之后,官方的库正确率道理44%,而我的还在30%。。差距一下突显,还需继续学习。。
补充一下那个sampleWithReplace函数
function [ sample_data ] = sampleWithReplace( dataset )
len = size(dataset,1) ;
randidx = randsample(len,len,true) ;
sample_data = dataset(randidx,:) ;
end