欢迎关注”生信修炼手册”!

对于蛋白质功能研究而言，亚细胞定位是非常重要的分析内容。蛋白质在细胞中是流动的，所以一个蛋白可以具有一个到多个的亚细胞定位信息。比如转录因子等蛋白，其亚细胞定位是动态变化的，在不同亚细胞中产生不同的细胞功能。

了解蛋白质的亚细胞定位信息，可以对预测其生物学功能提供帮助。Euk-mPLOC是一个在线软件，可以预测真核生物蛋白的亚细胞定位。网址如下

​​http://www.csbio.sjtu.edu.cn/bioinf/euk-multi-2/​​

将亚细胞定位分成了以下22种不同区域

  1. Acrosome
  2. Cell wall
  3. Centriole
  4. Chloroplast
  5. Cyanelle
  6. Cytoplasm
  7. Cytoskeleton
  8. Endoplasmic reticulum
  9. Endosome
  10. Extracell
  11. Golgi apparatus
  12. Hydrogenosome
  13. Lysosome
  14. Melanosome
  15. Microsome
  16. Mitochondrion
  17. Nucleus
  18. Peroxisome
  19. Plasma membrane
  20. Spindle pole body
  21. Synapse
  22. Vacuole

    图示如下：

Euk-mPLOC:预测真核生物蛋白的亚细胞定位_xx

软件的用法也非常简单，输入FASTA格式的蛋白质序列就可以了

Euk-mPLOC:预测真核生物蛋白的亚细胞定位_xx_02

预测的结果如下

Euk-mPLOC:预测真核生物蛋白的亚细胞定位_xx_03

对于每条输入的蛋白序列，都会给出预测到的多个亚细胞定位信息。

·end·

—如果喜欢，快分享给你的朋友们吧—


扫描关注微信号，更多精彩内容等着你！

Euk-mPLOC:预测真核生物蛋白的亚细胞定位_xx_04