DNA甲基化作为表观遗传的一种标记，在生长发育和疾病发生过程中扮演着重要角色。随着大规模甲基化研究的进行，积累了大量疾病相关的甲基化数据，​​DiseaseMeth​​就是一个保存了人类疾病相关的甲基化信息的数据库。

官网地址如下

​​http://bio-bigdata.hrbmu.edu.cn/diseasemeth/​​

在​​DiseaseMeth​​数据库中，甲基化数据的类型包括两大类别

  1. 芯片


    对于DNA甲基化芯片，除了​​27K​​和​​450K​​这两种常见的illuminaDNA甲基化芯片，还有其他定制的芯片，比如​​illumina GoldenGate Methylation Cancer Panel I​​。
  2. NGS


    高通量测序主要就是包含​​WGBS​​和​​RRBS​​两种数据。

详细的信息如下：

DiseaseMeth 人类疾病相关的甲基化信息数据库_sed
​​​Array-based​​​主要包括了​​27K​​​和​​450K​​​，其中​​27K​​​为8.6， ​​450K​​​为9.3；​​NGS-based​​​主要包括了​​WGBS​​​和​​RRBS​​​,​​WGBS​​​为3.9，​​RRBS​​为4.3。

对于疾病，包含下列7种类型：

  1. Cancer
  2. Genetic Disorder
  3. Metabolic Disorder
  4. Autoimmune Disease
  5. Neurolobical Disease
  6. Imflammation
  7. Others

其中​​Cancer​​类型的数据最多，详细信息如下：

DiseaseMeth 人类疾病相关的甲基化信息数据库_数据_02

利用这个数据库，我们可以根据疾病或者基因检索相关信息。以基因​​DEFB119​​为例，该基因相关疾病的检索结果如下

DiseaseMeth 人类疾病相关的甲基化信息数据库_数据库_03

从检索结果中，我们可以得到该基因相关的疾病，以及在该疾病中，这个基因的甲基化水平是上升还是降低。

对于相关疾病，还有热图数据可以下载

DiseaseMeth 人类疾病相关的甲基化信息数据库_数据库_04

通过这个数据库，我们可以检索已有的对于某种疾病或者某个基因甲基化的研究结果。