GenomeStudio 是 illumina 公司开发的分析 illumina 芯片数据的软件, 该软件最新版为v2, 是收费的。其v1 版本部分功能可以免费使用。对于450K和850K甲基化芯片的数据而言，可以使用这个软件进行分析。本篇介绍下这个软件的安装过程。

软件的下载地址

​​https://support.illumina.com/array/array_software/genomestudio/downloads.html​​

illumina 官方提供的甲基化芯片分析软件 GenomeStudio - 安装篇_下载地址

下载之后解压缩，会有两个文件

illumina 官方提供的甲基化芯片分析软件 GenomeStudio - 安装篇_数据_02
双击​​​GenomeStudioV2011.1.exe​​​ 文件进行安装， 这个软件支持多种芯片类型，这里我们只选择DNA甲基化芯片，勾选​​Framework​​​ 和 ​​Methylation Module​​​ 两个模块，然后在​​Serial Number​​​ 中输入license, 这个lincense 可以从license kyes 这个文件中找到，然后点击​​Install​​ 进行安装。

illumina 官方提供的甲基化芯片分析软件 GenomeStudio - 安装篇_安装过程_03

当提示​​Install Complete​​​的时候，安装就完成了。 然后点击​​Exit​​ 退出即可。

总结

软件的安装过程比较简单，需要注意的是要下载V2011.1 版本，在安装时，对应的license 可以在​​license kyes​​ 文件中找到。