常用的分子生物学实验技术:离心技术: 是分离纯化蛋白质、酶、核酸(DNA、RNA)、细胞的最常用方法之一。 电泳(electrophoresis):带电粒子在电场中向着与其所带电荷相反方向电极移动的现象。 可用于分离不同分子量的生物大分子。 1.蛋白质的电泳: 用途:蛋白质的定量。 2.核酸的电泳: 用途:用于核酸的分离、鉴定、纯化、回收。
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2024-07-02 21:30:38
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瑞典Attana公司制造的Attana Cell 200蛋白互作分析仪,是一种无需标记、可直接在细胞表面测量分子相互作用的生物传感器,其填补了传统生物传感器与基于细胞的分析方法之间的空白。 Attana蛋白互作分析仪依托于石英晶体微天平(Quartz Crystal Microbalance,简称QCM)技术,外加的交流电势使石英晶体在共振频率下震动,当分子流经晶体并与表面结合,振动频率
导言构建生信分析流程是生物信息学从业人员必备的技能之一,对该项能力的评估常常是各大公司招录人员的参考项目之一。在进行 ngsjs 项目时,我做了一张示意图来表示一些高通量测序数据分析项目重现性的要点(图一)。ngsjs: A set of command line tools, NGS data analysis workflows, and R shiny p
生物信息分析:从入门到精(fang)通(qi)结语:入门生信一时爽,一直分析一直爽生信小白:服务器、超算、运维…这些词经常挂在生信专家嘴边,为什么需要这些东西呢?西克孚肉:我们之前讲过,二代测序技术就像碎纸机,我们要用这些碎纸片段完成拼图。这个过程并没有想象中那么简单!首先拼图数目巨大,有好几十幅拼图凑在一起,存在大量重复的片段…这意味着处理数据需要比较大的计算量。生信小白:难怪我说要跑全基因组数
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2024-01-31 03:23:20
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最近接到实验室的导师交给我的一个任务,就是他们手头有很多smile表达式,格式类似这种:C(=C(c1ccccc1)c1ccccc1)c1ccccc1(这是生物信息学中表达小分子结构的一种常用表达式),他们需要对每个smile表达式在ZINC网站(生物信息学数据网站)上进行搜索,然后找到对应的ZINC号、小分子供应商、构象预测等信息。基本步骤如下:点击查找之后网页就会跳转到详细信息,我们需要获取它
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2023-11-02 10:04:15
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# 生物数据分析 Python
## 介绍
生物数据分析是生物学研究中非常重要的一环,通过对生物数据的分析,可以帮助科研人员更好地理解生物体内的各种生命过程。Python是一种非常流行的编程语言,具有丰富的生态系统和强大的数据分析工具,因此在生物数据分析中得到了广泛应用。
本文将介绍如何使用Python进行生物数据分析,并给出相应的代码示例。
## 数据获取
在进行生物数据分析之前,首先
原创
2023-08-13 18:49:40
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《Python生物信息学数据管理》这是我两三年前学习过的一本书,我觉得这本书挺好,把生物学的问题直接在python学习中解决了,推荐给大家,之前还整理了习题代码,分享一下。之前分享在了github上,收获了10颗星,惭愧,已经是我最多星的一个。还有一两个习题记得没有解答出来,如果你解答出来了,欢迎交流!代码有的肯定不是最优的,只是一种解答方法,可能有错误,也欢迎指正,谢谢!我坚信分享使我们快乐,加
根据我总结的经验,一个合格的、高级的大数据分析师必须要掌握以下9种技能:统计分析:大数定律、抽样推测规律、秩和检验、回归、预测;可视化辅助工具:excel、BI工具、python大数据处理框架:Hadoop、storm、spark数据库:SQL、MySql、DB数据仓库:SSIS、SSAS数据挖掘工具:Matlab、R语言、python人工智能:机器学习挖掘算法:数据结构、一致性编程语言:Java
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2023-10-17 16:10:13
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相信会看到这篇文章的每一位朋友,都是想通过各种方式找到易生信Python处理生物信息数据和作图这个课程来努力学习、提升自我的想法。怎么样更低成本找到这个课程进行学习变成了很多人的难题?那么就让我来帮你吧。那么今天的正题就是我们怎么样才能低成本找到课程?(当然首选渠道2_(:з」∠)_)1、有经济条件的当然是选择直接找到官方平台去购买了。这样的好处是音质好也有对应的服务提供2、在朋友圈找到分享网课的
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2023-07-28 21:08:34
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近日,美国著名的《麻省理工科技评论》评选出了全球最聪明(创造力)的50家公司。这50个名单不仅包含了亚马逊、谷歌、微软等互联网巨头,也包含了创立于2013年的Editas Medicine这一类新型公司。在这50家公司里,生物医疗相关的公司总共有15家。在这15家公司中,有10家公司与基因相关;4家公司市值已经超过百亿美元;12家公司在美国。涵盖基因测序、基因检测、基因治疗、转基因、肿
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2024-01-15 23:13:49
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摘要 物种多样性的丧失与增加都会影响生态稳定性以及生态系统功能和服务的可持续性。已有实验数据和理论模型表明,多样性对生态稳定性的单一组分(诸如时间变化、抵抗力和恢复力等)会产生积极、负面甚至零影响。然而,对这些稳定性组分之间如何协变的问题,我们仍然知之甚少。同样地,多样性是如何影响整个生态系统稳定性(概念上类似于生态系统多功能性(Ecosystem Multifunction
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2023-12-30 21:12:59
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产生了大量的微生物组学数据,想进行数据分析不知道使用什么工具?不会使用Linux系统?不会写代码?没有合适的参考数据库?计算资源不足?现在这些问题都可以通过国家微生物数据中心推出的一站式生物信息分析云平台解决。 国家微生物科学数据中心面向微生物领域的科学家,提供免费的一站式生物信息分析云平台。
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2023-12-30 21:03:28
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最近接到实验室的导师交给我的一个任务,就是他们手头有很多smile表达式,格式类似这种:C(=C(c1ccccc1)c1ccccc1)c1ccccc1(这是生物信息学中表达小分子结构的一种常用表达式),他们需要对每个smile表达式在ZINC网站(生物信息学数据网站)上进行搜索,然后找到对应的ZINC号、小分子供应商、构象预测等信息。基本步骤如下: 点击查找之后网页就会跳转到详细信息
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2023-07-04 19:44:40
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目录一、准备数据1.查看数据二、数据探索性分析1.数据描述型分析2.各特征值与结果的关系a)研究各个特征值本身类别b)研究怀孕次数特征值与结果的关系c)其他特征值3.研究各特征互相的关系三、数据预处理1.去掉唯一属性2.处理缺失值a)标记缺失值b)删除缺失值行数 c)用合理值代替缺失值3.异常值处理四、机器学习(分类模型)1.决策树a)建立决策树模型b)模型评估c)参数优化d)重新建立模
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2024-01-30 07:26:54
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# 生物python数据分析代码示例
## 介绍
在生物数据分析领域,Python是一门非常强大的编程语言。本文将向刚入行的开发者介绍如何使用Python进行生物数据分析,并提供一个代码示例。
## 流程
下面是实现生物python数据分析代码示例的整体流程:
| 步骤 | 描述 |
| ------ | ------ |
| 1 | 数据预处理 |
| 2 | 数据探索和可视化 |
| 3
原创
2023-08-24 18:03:20
184阅读
## Python生物学数据分析流程
### 整体流程图
```mermaid
flowchart TD
A(开始)
B(获取数据)
C(数据清洗)
D(数据分析)
E(结果展示)
F(结束)
A --> B
B --> C
C --> D
D --> E
E --> F
```
### 步骤及代码实现
原创
2023-08-27 12:38:09
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# Python实现生物多样性分析
生物多样性是指在特定区域内,包括生态系统、物种和遗传变异的多样性。生物多样性的重要性不言而喻,因为它为生态系统提供了稳定性,促进了生态服务,从而影响人类的生存质量。近年来,利用Python进行生物多样性分析逐渐受到关注。本文将介绍如何使用Python进行生物多样性的数据分析,绘制饼状图和关系图,以帮助理解生物多样性的重要性。
## 数据准备
在进行生物多样
以下为文章全文:Python开发的方向太多了,有机器学习,数据挖掘,网络开发,爬虫等等。其实在生信领域,Python还显现不出绝对的优势,生信的大部分软件流程都是用shell或Perl写的,而且已经足够好用了。我选Python是因为我想顺便学点数据挖掘和机器学习的东西,而且Python这些年越来越火,发展势头远超其他脚本语言,所以学它肯定是没错的。一、入门标准入门比较难定义,什么程度才算入门呢?掌
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2023-08-09 09:24:08
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Python开发的方向太多了,有机器学习,数据挖掘,网络开发,爬虫等等。其实在生信领域,Python还显现不出绝对的优势,生信的大部分软件流程都是用shell或Perl写的,而且已经足够好用了。我选Python是因为我想顺便学点数据挖掘和机器学习的东西,而且Python这些年越来越火,发展势头远超其他脚本语言,所以学它肯定是没错的。图片一、入门标准入门比较难定义,什么程度才算入门呢?掌握基本的语法
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2023-08-09 10:14:42
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最近接到实验室的导师交给我的一个任务,就是他们手头有很多smile表达式,格式类似这种:C(=C(c1ccccc1)c1ccccc1)c1ccccc1(这是生物信息学中表达小分子结构的一种常用表达式),他们需要对每个smile表达式在ZINC网站(生物信息学数据网站)上进行搜索,然后找到对应的ZINC号、小分子供应商、构象预测等信息。基本步骤如下: 点击查找之后网页就会跳转到详细信息
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2023-12-20 23:25:49
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