大家好，我是小马老师。本文根据Lammps官方案例写了一个氢气燃烧的lammps in文件，使用fix reax/c/species对氢气燃烧后的反应物进行分析。主要模拟过程：（1）
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2022-04-29 15:00:54
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大家好，我是小马老师。在绝大多数的lammps模拟过程中，两个原子之间只要产生了键连接（bond），这个bond默认“永久”存在。在模拟过程中，这个键是不允许断裂的，当然，也不会有新的键生成。当键连接的两个原子距离过大，超出势函数允许的范围，就会产生“bond missing“错误，此时，模拟就会中止
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2022-04-29 15:27:18
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大家好，我是小马老师。在绝大多数的lammps模拟过程中，两个原子之间只要产生了键连接（bond），这个bond默认“永久”存在。在模拟过程中，这个键是不允许断裂的，当然，也不会有新的键生成。当键连接的两个原子距离过大，超出势函数允许的范围，就会产生“bond missing“错误，此时，模拟就会中止。既然键不能断裂也不能重新生成，也就不能模拟体系的化学反应过程。但反应势是一个例外，这个势允许键的
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2022-01-06 16:58:05
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本文介绍如何从构建模型到模拟有机物（以葡萄糖分子为例）在高温下裂解过程和最终产物。有如下步骤： 初始化结构; 1.1 建模input一个葡萄糖分子（图1），然后module AC caculation，我这里写500个分子（如图2），run之后得到图3.（备注： energy 是选择力场，后期用反应力场，这里现在通用
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2023-05-18 09:45:20
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一、rename 模拟结果文件路径结构大概是：/当前目录/模型名/字模型名模拟/模拟温度/模拟结果文件。 模拟结果文件命名时相同的。模拟结果文件需要修改模拟结果文件的后缀名。 附shell脚本： find -type f|grep 'bonds.reax'|xargs rename 's/\.reax$/\.bof/' //该目录及子目录下所有'bonds.reax'文件重命名为'
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2015-01-30 15:45:23
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