用过网页版本 BLAST 的童鞋都会发现,提交的序列比对往往在几分钟,甚至几十秒就可以得到比对的结果;而通过调用 API 却要花费几十分钟或者更长的时间!这到底是为什么呢?
NCBIWWW 基本用法首先,我们来看一下提供了基于 API 在线比对的 BiopythonBiopython 中的 BLAST 提供了 over the Internet 和 locally 两种选择:Bi
转载
2024-10-28 18:42:39
233阅读
## ab1文件 Python批量读取
在生物学研究中,常常需要读取DNA测序结果。DNA测序结果通常以AB1文件的形式保存,包含了测序仪输出的原始数据。在本文中,我们将介绍如何使用Python编写代码,批量读取AB1文件并提取所需信息。
### AB1文件的结构
AB1文件是Applied Biosystems公司开发的一种二进制文件格式,用于存储DNA测序的结果。AB1文件包含了以下几个
原创
2023-10-27 10:28:39
1448阅读
1. 元组的元素不可修改,但元组的元素的元素可以被修改。2. name="eric" print(name.center(20, "*")3. list=['a', 'b', 'c', 'd'] str = '-'.join(list) 4. sys.argv 处理参数maketrans()
语法
maketrans()方法语法:
st
文章目录工具分析解包 工具1.java 2.rar 3.C32Asm分析第一次拿到.ab后缀的文件,不知道是什么,直接丢进C32Asm里去看文件头魔数。如图:1. 其中可以看到ANDROID BACKUP.2.1.none字样,说明是一个安卓备份文件(我查资料了的!不是看到backup所以就乱说哈) 2.其中的 .2 和 .1 分别是两个参数,表示版本和是否压缩,具体哪个对应哪个,还有版本是指什
转载
2023-08-07 12:06:35
1915阅读
1. MIME type 声明首先,因为manifest文件必须是一个MIME type为text/cache-manifest类型的存在。文件后缀名可以自定义(建议为.appcache)所以我们需要现在服务端将.appcache后缀的文件类型声明为text/cache-manifest。以apache为例,我们需要在httpd.conf中加上:AddType text/cache-ma
转载
2024-02-11 08:44:26
100阅读
# 如何在Python中打开和处理PK1文件
PK1文件通常是特定应用程序生成的数据文件,尤其是在地理信息系统(GIS)和其他多媒体处理领域。由于PK1文件并没有一个统一的格式规范,因此处理它们的方法取决于文件的实际格式及其内容。本文将为您介绍如何使用Python打开和处理PK1文件,包括必要的库、示例代码以及整个过程的逻辑结构。
## 表示PK1文件结构
在深入代码之前,我们需要了解PK1
原创
2024-11-01 04:24:41
133阅读
ibtmp1是个什么东西呢?查看官方文档后发现这是非压缩的innodb临时表的独立表空间。通过innodb_temp_data_file_path参数指定文件的路径,文件名和大小,默认配置为ibtmp1:12M:autoextend,也就是说在支持大文件的系统这个文件大小是可以无限增长的。
原创
2018-08-28 11:56:19
10000+阅读
点赞
1 log4net日志文件的使用步骤内容1下载、安装、及引用log4net.dll。可通过NuGet搜索安装完成。2添加配置文件。--建议公司定义自己的日志格式,在项目中循环使用。《日志文件内容的配置说明》。3添加日志配置文件使用的说明。《日志配置文件的使用说明》。4建议的一般使用方式。 1.
转载
2024-05-09 13:41:46
64阅读
这些问题将让你熟悉Python的文件操作,包括如何读取、修改和写入文件,以及如何处理大文件和分割文件。
原创
2023-05-27 00:02:19
924阅读
1、模块介绍:Python 模块(Module),是一个 Python 文件,以 .py 结尾,包含了 Python 对象定义和Python语句。模块让你能够有逻辑地组织你的 Python 代码段。把相关的代码分配到一个模块里能让你的代码更好用,更易懂。模块能定义函数,类和变量,模块里也能包含可执行的代码。简单介绍:如果你从Python解释器退出并再次进入,之前的定义(函数和变量)都会
小白能看懂的IO入门教程 之File
原创
2022-07-11 22:59:42
156阅读
一、读取MDF/MF4文件1.1 从 *.mdf 文件中读取所有数据mdfObj = mdf('CANape.mdf'); % 打开*.mdf/*.mf4文件
data1 = read(mdfObj); % 读取所有可用的数据
mdfds = mdfDatastore({'CANape1.MF4','CANape2.MF4','CANape3.MF4'}); %
转载
2024-01-15 11:58:02
1078阅读
目的:主机系统/var目录快满了,经查询最大的文件是mysql的ibdata1文件,有17G大小,故需要迁移这个文件到其他目录下,以释放/var目录空间。1.先备份下数据库是个好习惯# mysqldump -q -uuser -ppassword --add-drop-table --all-dat...
转载
2014-10-13 11:37:00
275阅读
2评论
# MySQL ibdata1文件损坏问题解析与解决
MySQL是当前使用极为广泛的关系型数据库管理系统,而ibdata1文件是InnoDB存储引擎的重要组成部分。它存储了InnoDB表的数据和索引信息,因此一旦这个文件损坏,就可能导致数据库无法正常工作。本文将探讨ibdata1文件损坏的原因及解决方法,包括代码示例,帮助您更好地理解和处理这一问题。
## 一、ibdata1文件简介
在My
原创
2024-08-10 05:30:55
952阅读
open()方法 Python open()方法永于打开一个文件,并返回文件对象,并对文件进行处理过程中都需要用到这个方法,如果该文件无法被打开,则抛出OSError 注意:使用open()方法一定要保证关闭文件对象,即调用close()方法。 open()函数常用形式就是接受两个参数:文件名和模式
转载
2019-09-12 10:07:00
188阅读
2评论
在Matlab操作HDF5文件中已经详细介绍了HDF5文件已经利用Matlab对其进行操作的方法。这篇文章总结一下如何在Python下使用HDF5文件。我们仍然按照Matlab操作HDF5文件的顺序进行,分别是创建HDF5文件,写入数据,读取数据。Python下的HDF5文件依赖h5py工具包创建文件和数据集使用`h5py.File()方法创建hdf5文件h5file = h5py.File(fi
转载
2023-09-18 20:14:41
426阅读
# 如何使用Python生成777文件
## 一、流程概述
首先我们需要明确生成777文件的目的。777文件是一种在Linux系统下具有最高权限的文件,即可读、可写、可执行。接下来我将向你展示生成777文件的详细步骤:
| 步骤 | 操作 |
|------|---------------------|
| 1 | 导入os模块 |
| 2
原创
2024-03-27 03:16:48
42阅读
二进制文件和文本文件都是0,1组成,但文件系统对他们的解释不一样,一般系统调用(或
原创
2022-11-11 07:23:58
316阅读
6.2无关性的基础:1 虚拟机的设计与实现是考虑了支持多种语言的。 2 虚拟机不绑定任何包括java在内的语言,只与class文件关联。 3 任何一种功能性语言都可以使用编译器把程序编译为一个被虚拟机接受的有效class文件 4 多条字节码命令组成一个java语言的变量,关键字,运算符,所以字节码命令所能提供的语义描述能力比java语言本身强,这为实现一些有别于java语言特性提供了基础。6
转载
2023-07-01 12:38:11
49阅读
我知道我在两个流中使用了这个,我认为mp3文件,不记得如何或在哪个项目中,可能需要查看这个.认为这是咕噜咕噜……无论如何……
如果你完全没有使用像pyglet这样的前端代码(这是我所听到的),你需要一些选项和一些代码来尽可能地工作.
转载
2023-08-03 17:16:02
535阅读