方案:str = input()target_len = int(input
原创 2022-09-23 13:34:39
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#include<iostream>#include<string>#include<vector>using namespace std;int main(){ string s
原创 2022-08-11 10:23:07
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对于每一个进入生物领域的人,基本都避免不了分子克隆(认知的同胞除外),当然就需要一个称手的 DNA 比对软件。今天给大家强烈推荐一款 DNA 比对软件,APE(a plasmid editor)。这款软件不仅能做 DNA 序列比对,DNA 序列翻译,还能够做引物设计,酶切位点设计,质粒图谱构建(这个还是 snapgene 更好用,不过人家是收费的),ORF 查找等非常多的实用功能,下面我来详细介绍
DNA Consensus StringTime limit: 3.000 secondsFigure 1.DNA (Deoxyribonucleic Acid) is the
原创 2022-11-28 23:02:26
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题目描述DNA分子是人类遗传信息的载体,它间接地指导蛋白质的合成。DNA分子是由四种核苷酸组成的长链,这四种核苷酸分别是腺嘌呤核苷酸(用A代表)、鸟嘌呤核苷酸(用G代表)、胞嘧啶核苷酸(用C代表)和胸腺嘧啶核苷酸(用T代表)。习惯上用一个字符集为{A,T,C,G}的字符串来表示一个DNA分子序列,如CGTTAGA。在生物进化过程中,DNA分子可能发生各种各样的突变。这种突变形成了生物遗传信息的改变
# 如何实现 Python 经典案例:DNA序列分析 在现代生物信息学中,DNA序列分析是一个重要的主题。如果你是刚入行的小白,可能会对如何开始感到困惑。本文将详细指导你如何实现一个简单的DNA序列分析程序,并通过分步解读代码助你理解。 ## 整体流程 我们将通过以下几个主要步骤完成DNA序列分析: | 步骤 | 描述 | |------|------| | 1 | 定义函数来获取D
原创 8月前
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如何实现DNA序列聚类 在实现DNA序列聚类的过程中,我们可以采用以下步骤来完成。下面是一个简单的流程表格,展示了整个过程的步骤和需要做的事情。 | 步骤 | 描述 | 代码 | | ---- | ---- | ---- | | 步骤1 | 读取DNA序列数据 | `sequences = read_sequences()` | | 步骤2 | 计算序列相似性 | `similarity_ma
原创 2024-01-05 08:43:45
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相关背景DNA结构 DNA分子的一级结构:A, C, G, T四种核苷酸的线性多聚体; DNA分子由两条互相平行的脱氧核苷酸长链盘绕而成; DNA分子中的脱氧核糖和磷酸交替连接,排在外侧,碱基排列在内侧; 两条链上的碱基通过氢键想结合,形成碱基对于腺膘呤(A)总是与胸腺嘧啶(T)配对、鸟膘呤(G)总是与胞嘧啶©配对,这说明两条链的碱基顺序是彼此互补的中心法则 遗传信息从DNA传递给RNA,再从RN
转载 2023-06-14 18:49:34
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题目链接https://www.nowcoder.com/practice/e8480ed7501640709354db1cc4ffd42a?tpId=37
原创 2022-08-10 15:27:48
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DNA 测序技术用以分析特定DNA 片段的碱基序列(腺嘌呤(A)、胸腺嘧啶(T)、胞嘧啶(C)与鸟嘌呤(G))的排列方式.图2 DNA 测序及拼接过程示意图 Fig. 2 Diagram of DNA sequencing and assembly测序完成后的第一步也是最重要的一步就是根据读序拼接回贴成完整的序列,其测序与拼接过程如图2 所示.拼接算法用于将测出的读序拼接成完整的染色体序列(chr
Python内建了6中序列:列表、元组、字符串、Unicode字符串、buffer对象和xrange对象。序列样式举例:seque1=['Joe',42],seque2=[['Joe',42],['Bob',38]]。本章主要介绍下序列的通用操作,包括:索引indexing,分片slicing,加adding,乘multiplying,成员检查in,计算序列长度len,找最大max和最小值min。
转载 2024-04-10 20:44:53
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基于主成分分析与Fisher判别的DNA序列分类【摘要】:  特征提取:对于DNA序列,首先将其分为编码DNA特征与非编码DNA特征。对于非编码DNA,统计A,T,C,G各个碱基以及A+T在其中出现的频率,由此构建DNA序列所对应的5维向量空间。对于编码DNA,根据DNA转录与表达的中心法则,氨基酸与密码子的对应关系,统计21类氨基酸的出现频率,由此构建了DNA序列所对应的21维向量空间。最终,针
        在python中,最基本的数据结构是序列序列中的每个元素被分配一个序号--即元素的位置,也称为索引。第一个索引是0,第二个则是2。序列中最后一个元素是-1,倒数第二个元素为-2。         python包含6种内建的序列:列表、元组、字符串、Uni
# Python最长公共序列 DNA DNA(脱氧核糖核酸)是一种生物分子,它包含遗传信息并决定生物体的遗传特征。在生物学研究中,常常需要对DNA序列进行比对和分析。其中一个重要的问题是找到两个DNA序列中的最长公共子序列(LCS),即它们之间的相似部分。 在Python中,我们可以使用动态规划算法来解决最长公共子序列问题。动态规划是一种解决问题的方法,通过将问题分解成更小的子问题,并记录子问
原创 2024-04-17 03:55:22
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【POJ No. 2778】DNA 序列 DNA Sequence北大OJ 题目地址【题意】DNA序列是一个只包含A、C、T和G的序列。分析DNA序列片段非常有用,若动物的DNA序列包含片段ATC,则意味着该动物可能患有遗传病。给定m 个遗传病片段,求有多少种长度为n 的DNA序列不包含这些片段。【输入输出】输入:第1行包含两个整数m (0≤m ≤10)和n (1≤n ≤2×109)。m 是遗传病
重复的dna序列DNA序列 由一系列核苷酸组成,缩写为 ‘A’, ‘C’, ‘G’ 和 ’T’.。 例如,”ACGAATTCCG” 是一个 DNA序列 。 在研究 DNA 时,识别 DNA 中的重复序列非常有用。给定一个表示 DNA序列 的字符串 s ,返回所有在 DNA 分子中出现不止一次的 长度为 10 的序列(子字符串)。你可以按 任意顺序 返回答案。输入:s = “AAAAACCCCCAA
原创 2022-12-25 23:21:13
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输入描述:输入一个string型基因序列,和int型子串的长度输出描述:找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一只能输出GCACG。
原创 2022-07-13 18:07:33
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% ------------------------------------------------------------------ %% -------------- Prepared by : Ismail M. El-Badawy ----------
原创 2022-10-10 16:12:27
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DNA测序(A,T,C,G),DNA一级结构。核苷酸序列测定的两种方法第一代DNA测序:1、Snager双脱终止法(双脱氧链末端合成终止法)2、Gibert化学降解法3、荧光自动化测序测序的机理??DNA测序:(最初的测序仪一次只能测4个样,且分四个用到进行)在DNA合成的基础上,采用高分辨率的聚丙烯酰胺凝胶电泳(PAGE)【 聚丙烯酰胺凝胶电泳( polyacrylamide gel elect
转载 2024-05-07 15:06:42
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所有DNA由一系列缩写为A,C,G和 T 的核苷酸组成,例如:“ACGAATTCCG”。在研究DNA时,识别DNA中的重复序列有时非常有用。编写一个函数来查找DNA分子中所有出现超多一次的10个字母长的序列(子串)。 详见:https://leetcode.com/problems/repeated
转载 2018-04-07 17:07:00
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