一、分子表征分子表征形式： 1D：SMILES、Fingerprints (ECFP)、molecular access system (MACCS)、mathematical representationSMILES：字符串虽然简单、快速，但仍然不能全面捕捉原子之间的空间关系。如图1所示，在C = C5苯环上，5个碳原子被分组为C5;然而，不同的碳原子与其他原子有不同的关系，并且位于分
【此系列文章基于熔融沉积( fused depostion modeling, FDM )成形工艺】
从这一篇文章開始，就開始说填充。在3D打印切片技术中，填充算法是最核心的部分。3D打印技术的经常使用的指标包含：打印速度，稳固性，柔韧性，逼真度，密度（关系着使用打印材料的多少）。都与填充算法有着直接的关系。能够说衡量一个切片引擎的优劣主要看它的填充算法是否优越。
ChemOffice是一款化学绘图套件，主要是ChemDraw 化学结构绘图，Chem3D 分子模型及仿真，ChemFinder 化学信息搜寻整合系统组成的。其中Chem3D是专门用于绘制与立体结构相关的所有图形，其界面与大家常用的ChemDraw存在较大差别，所以掌握了ChemDraw的使用方法并不代表就熟练掌握Chem 3D了。下面来给大家分享一下用Chem
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2024-04-29 20:20:39
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Chem3D是专门用于绘制化学三维模型和进行计算化学数据的ChemOffice组件，在三维模型中每个原子都有众多属性，比如原子类型、原子符号、原子编号以及原子颜色等等。掌握Chem 3D模型的原子属性修改方法有助于绘制者创建出具有自己特色的三维立体模型，下面就跟着小编一起来学这篇ChemDraw绘制技巧吧！Chem3D模型的原子属性的修改方法在修改Chem3D模型的某个原子属性之前要在这个原子上右
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2024-07-23 11:34:09
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图片文件合成器背景初学C语言，突然接触到这个功能，发现这个功能有很多用途。所以，写个博客记录一下。原理图片、文件合成的原理其实就是将文件的二进制代码加载到图片的二进制代码后面，合成一个二进制文件；
windows加载器在进行加载时只结合文件的后缀名，检索文件的标志头和结束标志的位置读取。也就是因为如此，我们有了可改造的空间。为了更加清楚的了解其原理，根据自己的理解，绘制如下原理图。 为了
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2024-09-26 07:54:03
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1、下载安装Chimera软件，这是下载地址，笔者用的是1.11.2版本，Windows7平台2、打开对应的结构，如下图所示，点击Tools——Structure Editing——AddH，为蛋白质结构进行加氢处理，这步也可以通过PDB2PQR网站进行加氢处理3、为蛋白质结构加电荷，点击Tool——Structure Edit——Add Charge，可以选择应用的蛋白质氨基酸的力场，点击OK即
Chem3D是专门用于绘制化学三维模型和进行计算化学数据的ChemOffice组件，在三维模型中每个原子都有众多属性，比如原子类型、原子符号、原子编号以及原子颜色等等。掌握Chem 3D模型的原子属性修改方法有助于绘制者创建出具有自己特色的三维立体模型，下面就跟着小编一起来学这篇ChemDraw绘制技巧吧！
Chem3D是专门用于绘制化学三维模型和进行计
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2024-04-30 18:08:22
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参见www.extremetech.com新型的3D打印技术 2015.3.17一种由Slicon Valley startup,Carbon3D Inc研发的3D打印技术能够使物体不停地由液体介质中生成而不是和过去的25年那样一层一层地打印，这代表了一种根本上的新的3D打印方法。这个技术，将作为在3.20号印刷的Science的封面文章出现，使要准备使用的产品能比用其他方法加工快25~
通过对ChemDraw进行首选项配置和文档设置，以适应自己的使用习惯。在首选项中进行更改的设置将应用于所有文档。在文档设置中进行的更改仅应用于当前文档，并不会应用于其他文档。在对象设置中进行的更改只应用于选定对象。3.1 设置首选项（Setting Preferences）首选项决定ChemDraw如何运行，无论现在编辑的是什么文档。对首选项进行设置，请按照以下步骤：⑴打开Prefe
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2024-07-02 20:00:59
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一、初级篇1.氢原子显示与隐藏正常情况下，分子在rdkit中存储时，氢以隐式氢的形式存储，即不会在图片中显示出来。当需要加入氢原子时，例如要生成和优化立体结构，可以通过函数加上氢原子。加氢：AddHs()去氢：RemoveHs()>>> from rdkit import Chem
>>> m = Chem.MolFromSmiles('CCO')
>&g
自然界中往往存在一些对PH值敏感的蛋白，当我们想要探究这些蛋白在不同PH条件下构象变化时自然离不开MD的辅助。遗憾的是Gromacs暂不支持恒定PH条件下的模拟，因为这涉及到了蛋白表面残基质子化状态需要时刻改变。一种折衷的方法是：用propka等预测工具预测蛋白极性/可质子化残基的pka值（因为实际蛋白表面的pka值可能受到邻近残基的影响而发生偏移），然后根据想要模拟的PH环境，自主确定各个可质子
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2024-07-25 08:03:26
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利用Cartes构造二茂铁结构
2004-9-23
在为量化计算构造分子模型时，我们时常为构造具有一定的对称性的分子结构而烦恼，本文介绍如何用
Cartes
软件轻松构造具有D
5h点群对称性的二茂铁（Ferrocene
， Fe(C
5H
5)
2）分子的坐标。我们将看到Cartes
不仅仅是处理
AutoCAD2019是一款非常专业的制图软件，那有很多用户表示自己不知道怎么通过这款软件把工具栏调出来，下面就通过这篇文章给大家介绍一下，一起往下看吧！方法一、1.在打开的CAD图纸文件中点击上方工作空间的三角形(这个是切换工作空间的下拉菜单)，直接用左键点击2.在工作空间的下拉菜单中，首先可以看到有系统默认的几种工作空间；分别是“草图与注释”、“三维基础”、“三维建模”、“ Auto CAD
Autodesk平台BIM 道路建模展示所使用的软件为Infraworks 360，在此软件里可导入Civil 3d路线及模型。对于一般简单道路，没有多级边坡或复杂交叉口，可直接导入Civil3d路线，甚至不需要在Civil 3d中定义路线纵断面。对于稍微复杂道路，则建议主线在Civil 3d建好模型再导入。路线、纵断面及装配定义好后可生成Civil3d模型，条件允许时，建议步长选择小一点，这样生
计算机在化学分子绘图中的应用第一章 计算机在化学分子绘图中的应用1.1 简介Microsoft Office Word是一款非常强大的图文编辑软件，但没有提供绘制化学分子结构式的工具。 现在微机上经常使用的绘制 2D 分子结构的软件为 ChemWindow、C S ChemDraw、I SISDraw&nb
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2024-07-09 06:44:53
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1. 紫外可见吸收光谱产生的原理紫外可见吸收光谱是由于分子（或离子）吸收紫外或者可见光（通常200-800 nm）后发生价电子的跃迁所引起的。由于电子间能级跃迁的同时总是伴随着振动和转动能级间的跃迁，因此紫外可见光谱呈现宽谱带。紫外可见吸收光谱的横坐标为波长（nm）,纵坐标为吸光度。紫外可见吸收光谱有两个重要的特征：最大吸收峰位置（λmax）以及最大吸收峰的摩尔吸光系数（κmax）。最大吸收峰所对
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2024-07-23 20:49:57
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ASMS 2019，赛默飞重磅推出三合一系列的创新巅峰之作——Thermo Scientific™ Orbitrap Eclipse™ 质谱仪，旨在解决生物学研究中的分析难题，轻松应对蛋白质组学，生物制药与蛋白质高级结构分析研究中的各项挑战。正可谓是高手过招，招招精彩。在2019年的ASMS会议上，赛默飞推出了两款超高分辨质谱仪，分别是：从这期开始继续Orbitrap的创新之旅，重磅推出三合一超高
前 言三维数据绘制到三维坐标系中，通常称其为三维散点图，即用在三维X-Y-Z图上针对一个或多个数据序列绘出三个度量的一种图表。软件包安装R 中scatterplot3d包的scatterplot3d()函数、rgl包的plot3d()函数、plot3D包的scatter3D()函数等都可以绘制三维散点图。下面将从 plot3D 包的函数scatter3D()入手，一步步带你完成三维散点图的绘制。本
3dmax文件图标变成白色背景颜色的原因是因为软件损坏或者系统设置出现障碍导致。通常可以使用一些修复插件，或者重新安装3dmax来解决。解决方法①我们演示使用FileTypesMan这个软件进行修复3dmax文件图标变成白色背景颜色往下拖动找到M开头的max，然后双击。 ②我们找到默认图标，点击那三个小点的，点击浏览，开始进行3dmax默认文件图标设置。 ③找
CorelDRAW 2019工具栏消失不见了怎么办？方法步骤：方法一：软件恢复出厂默认配置首先按住键盘上的F8，双击桌面上的CorelDRAW 2019的快捷方式，弹出恢复出厂默认值窗口，点击“是”，就可以将CorelDRAW恢复成最开始使用时候的样子。这个方法可以用来解决大多数软件设置上的问题，比如工具栏、菜单栏隐藏，以及工具栏窜位置等等。图1.恢复出厂默认值方法二：在窗口菜单中设置点击窗口选项
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2024-04-21 19:09:34
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