linux系统为centos7.0一、linux安装AutoDockTools（MGLTools）按照下面操作安装AutoDockTools（MGLTools）1. 下载安装包，链接（https://ccsb.scripps.edu/mgltools/downloads/），我的linux系统是64位，下载红色标记，拷贝入linux目标文件夹下（建议在桌面或者Home目录下新建一个放软
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2024-05-13 20:06:02
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# AutoDock 安装指南：是否需要安装 Java？
作为一名前端开发者，了解如何安装和测试各类软件工具是一个基本技能。在这篇文章中，我们将讨论如何安装 AutoDock 并了解它是否需要 Java 进行运行。
## 流程概述
首先，我们需要理清安装 AutoDock 的步骤。以下是一个逐步的流程表格，帮助你快速概览整个安装过程。
| 步骤 | 任务描述
分子对接一、题目要求自己寻找一个受体+药物分子复合物体系（不同配体结合3-4个），然后拿复合物结构作为起始，做对接实验。 软件自选，Dock, AutoDock…二、操作过程记录及结果1、软件下载与安装AutoDock下载安装进入AutoDock官网下载安装http://autodock.scripps.edu/downloads/autodock-registration/autodock-4-
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2024-08-06 14:20:23
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主题简述AutoDock是一款广泛用于分子对接的自动化软件，其安装十分简单，但在有些情况下，用户在进行打开和使用AutoDock的时候会遇到闪退问题。问题分析AutoDock在打开过程中会加载许多资源，因此如果安装过程中有文件或组件缺失或损坏，就有可能导致AutoDock打开失败和闪退。此外，AutoDock还可能会因为兼容性问题或操作系统配置问题而闪退。解决方法1.检查文件完整性AutoDock
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2024-07-09 22:30:12
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autotools是个系列工具，首先确认你的Ubuntu系统是否安装了以下工具（可以通过which命令查看）： aclocal
autoscan
autoconf
autoheader
automake 安装方法： ro
autoconf/automake主要用于创建Makefile，本文主要介绍一下automake的简单用法。Ubuntu下安装automake:sudo apt-get install automake即可安装automake的相关工具。 使用automake主要会用到aclocal、autoscan、autoconf、autoheader和automake这几个命令。autoheader主要用来
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2024-08-06 12:28:13
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一．首先安装MGLtools，autogrid4,和autodock41）安装MGLtools：下载mgltools_Linux-x86_1.5.6_Install（这个是32位的，mgltools_Linux-x86_64_1.5.6_Install则是64位的）双击mgltools_Linux-x86_1.5.6_Install弹出如下窗口 然后按照提示下一步即可（如果在32位lin
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2024-02-23 14:21:41
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接下来图文式介绍安装过程使用windows系统首先，大家需要该软件的基本上是生物分子类专业的同学，可能对代码指令行不够了解。大家遇到报错时，可以直接在csdn网站直接进行搜索，或者可以询问博主?另外，该版本相关软件久不更新，望各位小伙伴慎重考虑1.Auto+MGLTools安装Autodock安装连接：Download AutoDock4 – AutoDock (scripps.edu)https
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2024-05-13 10:37:41
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AutoDock安装及使用AutoDock 4.2.6 在Windows7中文版下的安装及运行 注意事项： 1、所有安装文件及后续处理文件的存储、安装、读取目录均不可有中文文件夹出现，文件名中除字母，数字及“_”外均不可使用。 2、建议安装时使用程序默认的安装路径，不要更改。 3、同一批次处理的文件存放在默认目录中，建议每次处理完毕后将其存放在另外位置。&n
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2024-01-11 09:50:27
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下载相关软件包：一个python2.5版本(用conda下载不了，最低是2.7版)配置./python2.5/Tools/Scripts到环境变量path里windows下配置临时的环境变量，这里必须是大写的PATH：#配置临时的环境变量：
set PATH=D:\Program Files\autodock4\python2.5;%PATH%
set PATH=D:\Program Files\
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2024-03-30 19:51:58
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工欲善其事必先利其器。在做分子对接之前，我们首先要安装好分子对接的工具，现在市场已经有很多有代表性的分子对接软件，如DOCK、AutoDock、GOLD、Affinity等等。其中AutoDock是最常用的分子对接软件。简介AutoDock其实是一个安装包，包含AutoDock和AutoGrid两个程序。AutoDock主要负责构象搜索和评价，AutoGrid主要负责格点中相关能量的计算。Auto
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2024-04-22 16:05:27
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AutoDock安装及AutoDockTools闪退问题AutoDockTools安装AutoDock安装检查ADT闪退问题解决方案 先非常抱歉关于回复慢的问题，我的确是没怎么关注这边博客上的回复，之后我会尽量及时回复的。autodock不是我本人平时工作中常用的软件，但有时小伙伴会用到，并遇到bug。发布出来之后就没再维护过任何一次的老代码出问题这不是挺正常的。。。所以 如题，之前我万万没
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2023-10-16 18:57:12
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这里写目录标题一、Autodock vina安装与配置下载vina安装包下载AutodockTools安装下vina提升版本（选看）二、分子对接流程受体预处理配体预处理设置对接盒子进行对接对接结果分析 一、Autodock vina安装与配置首先，简单提下Autodock vina 和 Autodock4的区别，可以这么理解，Autodock vina 是Autodock4的提升改进版本，vin
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2024-03-13 12:31:27
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注意：服务器 linux系统选用ubuntu登录系统，如果没有图形化见面可以先安装图形化界面 可以参考该视频 --> linux安装图形化界面
非阿里云ubuntu 依次执行以下命令sudo apt-get update
sudo apt-get install gnome
sudo reboot阿里云ubuntu 需多执行几条命令sudo apt-get -f install
sudo r
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2024-08-07 15:37:22
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1.文件准备 在进行对接前，我们必须保证在工作目录中有这五个文件。其中hsg表示受体，ind表示配体。2.导入作为受体分子的pdb文件、去游离O原子(水)、加H原子，保存为pdbqt文件 1>选择File-->Rea
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2024-08-14 13:48:18
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AutoDock, AutoDock-vina等对接工具安装AutoDock-GPU安装下载地址： https://autodock.scripps.edu/downloads/将压缩包传送至安装目录中，并解压到当前路径unzip AutoDock-GPU-develop.zip找到服务器的cuda的路径，cuda的路径一般默认为“/usr/local/cuda/”，然后将以下调用语句写入环境变量
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2024-02-23 22:33:56
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1 研究背景通过文献调研已经人凝血酶蛋白有四个潜在的结合位点，分别为位
原创
2023-05-18 09:46:00
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Autodock是一款开源的分子模拟软件，最主要应用于执行配体—蛋白分子对接。它由Scripps研究所的Olson实验室开发与维护，官方网址是http://autodock.scripps.edu/，目前最新的版本是AutoDock 4.2.6，包括AutoDock和AutoGrid两个模块，AutoDock软件包下载地址为http://autodock.scripps.edu/do
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2024-08-16 17:09:55
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AutoDock Vina 1.2.0 对接计算（大批量）AutoDockVina 1.2.0 的示例应用：A) 对接多个配体 (PDB 5x72)；B) 使用 AutoDock4 (PDB 4ykq) 的水合对接方案与水分子对接；C)在锌存在的情况下使用 AutoDock4Zn 力场 (PDB 1s63)； D) 柔性大环化合物。1. AutoDock Vina 1.2.0 简介AutoDock
Linux Linux：开源的红帽操作系统
在计算机领域，操作系统是软件系统中最为重要的组成部分之一。而Linux操作系统以其开源的特点，以及其灵活性和安全性而闻名于世。在众多Linux发行版本中，红帽（Red Hat）无疑是最为知名和受欢迎的一个。本文将以“Linux Linux”为关键词，探讨红帽操作系统在Linux领域中的重要性和影响。
首先，我们需要了解什么是Linux操作系统。Lin
原创
2024-02-02 14:05:31
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