qizok的博客_R语言

R语言复制文件，复制目录

file.infofile.createdir.createfile.copy if(!dir.exists("Result_Dir")){ dir.create("Result_Dir") } setwd("Result_Dir") # F

R

rename

dir

file.info

原创 2017-03-07 17:07:28 8770 阅读

R语言调整ggplot2的颜色

首先是官方的教程http://www.cookbook-r.com/Graphs/Colors_(ggplot2)/ 然后是一个非官方的http://www.sthda.com/english/wiki/ggplot2-colors-how-to-change-colors-automatically-and-manually 关于线条的颜色http://4byte.cn/question/738

R tree ggplot2 color

转载 2017-03-02 10:16:47 4331 阅读

R语言常用的软件包

> update.packages() &n

R package remove hel

原创 2017-02-28 16:02:30 1834 阅读

R语言选取某一行的最大值

可以先自定义函数，也可以用的时候再定义。> mat <- matrix(c(1:3,7:9,4:6), byrow = T, nc = 3) > mat [,1] [,2] [,3] [1,]

R max row function

原创 2017-02-20 14:47:44 10000+阅读

R的基本绘图包-plot函数

R的plot 既可以绘制点，也可以绘制直方图，还可以绘制箱线图，感觉的确很智能。> b <- c("P", "P", "P" ,"Q", "Q", "Q") > c <- c("TQ","AQ","CQ","BQ","XQ", "XQ") >&nbs

R

plot

barplot

boxplot

原创 2017-01-17 17:19:24 2111 阅读

python查找指定数据，用R绘图

python 查找指定字符串，找出相应的数据行def get_target_Lines(fr, s): f_handle = open(fr, "r") targets = []

R barplot sprintf fl

原创 2017-01-17 14:09:52 1485 阅读

R语言移除缺失值 NA

有三种方法 !is.na , na.omit, complete.cases > d <- read.table("GWAS_s2.qassoc", header=T, stringsAsFactors=F) // 文件行数 > nrow(d) [1]

R NA 缺失值 na.omit

原创 2017-01-10 09:44:39 6438 阅读

R语言RColorBrewer设置调色板

> library(RColorBrewer) > display.brewer.all()可以显示所有 RColorBrewer 里的调色板比如，Set1 中只有9个颜色， Set3中有12个颜色，Paired 中有12个颜色如果要使用Paired这个板> gbr<-colorRampPalette(c("green","blu

R Color Brewer 颜色调色

原创 2016-08-05 14:36:37 7813 阅读

R语言聚类分析

聚类分析有很多种，效果好不好大概要根据数据特征来确定。最常见的是kmeans法聚类> setwd("D:\\R_test") > data_in <- read.delim("tmp_result.txt", header=T) > fit <- kmeans(data_in,

R

cluster

聚类

kmeans

plot

原创 2016-06-28 13:13:16 2953 阅读

R语言ggplot2绘图设置X轴刻度，字体大小及绘图区大小

> colnames(data1)[seq(2,ncol(data1), 15)] [1] "AAAA" "AAGG" "ATGC" "ACGT" "AGGA" "TACG" "TTCC" "TCCT" "TGCA" "CATG" [11] "CTTC

R

axis

label

background

ggplot2

原创 2016-06-27 20:23:46 10000+阅读 1点赞

R语言移除缺失值 NA.RM

> a <- 2:12 > b <- seq(2,23,2) > c <- c(1:11)^3 > d <- c(5:8, 30:36) > df <- data.frame(a

R

NA

complete.cases

原创 2016-06-21 09:22:23 2982 阅读

R语言字符串写入文件

out_con <- file("out.txt", "w") write(sprintf("This is line %d.\n",1),out_con,append=T) write("This is line 2.",out_con,append=T) close(out_con)或者printe

R

写入

文件

sink

writeLines

原创 2016-06-20 18:15:57 3982 阅读

R语言读取大数据 data.table包 fread函数

> setwd("D:\\R_Tardy") > library(data.table) // data.table 1.9.6 // For help type ?data.table or // https://github.com/R

R

data.table

fread

data.frame

原创 2016-06-20 10:12:47 10000+阅读

bug of Alphahull in R package

I have define an area with alphahullbut I can't get the right point in the area.for example:> z.def$x [,1] &n

R

position

package

alphahull

points

原创 2016-06-19 21:04:51 744 阅读

R语言的几何平均数，调和平均数，平方平均数

平方平均数最容易实现a <- c(5:15) root.mean.square <- sqrt(sum(a^2))几何平均数实现算法，要考虑到NA或负值geometry.mean <- exp(mean(log(x))) geo_mean <- function(data) { &nb

R

平均数

调和平均数

几何平均数

转载精选 2016-06-19 16:00:59 10000+阅读

R中选择数据框中特定的行

> setwd("/Users/qiao/Documents/R_test_two/new_test") // 读取所有数据 > allData <- read.delim("all.test.tab.txt", header = T) > colnames(allData)[1]&n

R

write

which

scan

subset

原创 2016-06-17 10:20:42 10000+阅读

Home-brew 安装 R R包的安装

ruby -e "$(curl -fsSL https://raw.githubusercontent.com/Homebrew/install/master/install)"brew tap homebrew/science brew install r==> Installing r from homebr

R

install

homebrew

MacOS

转载精选 2016-06-15 17:11:35 2302 阅读

R语言选择特定的行，对某一列排序

R语言的数据框跟MySQL 中的表很像根据某一列的特定值选择相应的行d是个数据框，有一列的名字是named[d$name=="95",] 这样就选中了 name为“95”的所有行m 是个数据框，第三列的名字是heightm[order(m$height),] 这样就根据第三列的值对 m 进行了排序也可以用以下方法m[order(m[,3]),] m[o

选择

R语言

排序

原创 2016-06-15 14:36:04 10000+阅读

R语言merge数据框并写入文件

text1 <- read.csv("file1.txt", header = T) text2 <- read.delim("file2.txt", heade=T) data_1 <- merge(text1, text2, by

R

merge

写入文件

原创 2016-05-20 16:24:51 1106 阅读 1收藏

R语言执行脚本的几种命令

R CMD BATCH 和 Rscript 使用前都要先添加环境变量把 C:\Program Files\R\R-3.3.0\bin; 加到"系统变量"的Path 值的最开始可以用 R CMD BATCH *.r也可以用 Rscript *.r args0 args1 这个可以跟一定的参数当然也可以进入R交互环境 > source("*.r")

R

source

CMD

环境变量

Rscript

原创 2016-05-15 10:45:21 8546 阅读

R语言读取大数据

普通情况下使用scan读取数据x <- scan("D:\\test.txt")按列读入，指定数据类型x <- scan("test2dat.txt", what=list("",0,0)) #读取三列数据，第一列是字符，第二和第三列是数值 #以下写法也可以 x2 <- scan("tes

python

R

big Data

text File

原创 2016-05-08 13:20:22 5878 阅读 1收藏

R语言学习第一课

最早2010年6月17日建立的这个博客，开始学习R语言也是在4年前，读过Robert I. Kabacoff著的《R语言实战》，从中学到了不少R语言的实践技能。最近开始关注统计学，运筹学以及控制论，发现要学习的东西还有很多，打算从应用统计学这个方向学起，找来了王斌会老师的《多元统计分析与R语言建模》第二版来读。R语言的特点：免费，功能包众多面向对象编程，灵活，代码可重用前景广阔，一直在不断提升

R

矩阵

plot

原创 2016-05-07 10:38:48 3136 阅读

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R中选择数据框中特定的行

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