1) Android 和WINCE 都是操作系统，和支持几个USB口没有直接关系， 你的设备能接几个USB口通讯，要看你使用的主芯片支持几个USB接口的。 对于芯片对USB支持能力差的，你可以使用SDIO接口转换为USB接口。 

2）WINCE的移植相对比较成熟，有成熟的SDK，比较容易。 Android 虽然是开源的，但是源程序代码相信你也没有能力通读一遍，这里的源代码大部分还都没有注释。 放到外面的接口都不是很成熟的。

3）画图程序开发，关键看你做什么用，Android 用的是java， WINCE用的是C++， 看你那个语言熟悉一点了，算法都是一样的，就是实现的函数，封装的类不一样罢了。 

补充一句： android 用于手机，平板电脑居多，但是WINCE还是嵌入式系统的老大，大量的自动化设备，工业设备，嵌入式系统还是用的WINCE。