【教程】基于GNN的药物相互作用网络中的链接预测

关注 小锋学长生活大爆炸

【教程】基于GNN的药物相互作用网络中的链接预测

原创

小锋学长生活大爆炸 2025-09-03 13:40:44 ©著作权

文章标签 #网络 #图神经网络 #GNN #PyG sed 文章分类 Python 后端开发

©著作权归作者所有：来自51CTO博客作者小锋学长生活大爆炸的原创作品，请联系作者获取转载授权，否则将追究法律责任


使用PyG进行图机器学习简介

【教程】基于GNN的药物相互作用网络中的链接预测_sed

https://medium.com/stanford-cs224w/gnn-based-link-prediction-in-drug-drug-interaction-networks-c0e2136e4a72

【教程】基于GNN的药物相互作用网络中的链接预测_#GNN_02

  • 赞
  • 收藏
  • 评论
  • 分享
  • 举报

上一篇：【教程】强制关闭Windows防火墙的自启动

下一篇：【踩坑】HuggingFace在Spaces中安装torch-scatter

提问和评论都可以，用心的回复会被更多人看到 评论
发布评论
全部评论 () 最热 最新
相关文章
  • 图神经网络（GNN）

    图神经网络（Graph Neural Networks，GNN）是一类专门处理图结构数据的深度学习模型。与传统的深度学习模型不同，GNN能够直接处理节点和边之间的关系，捕捉图的结构信息。其核心思想是通过消息传递机制，使节点能够聚合其邻居节点的信息，从而更新自身的表示。GNN的基本原理：节点表示更新： 每个节点通过聚合其邻居节点的特征来更新自身的表示。这种聚合通常是加权求和，权重可以是固定的，也可以
    建模 社交网络 深度学习
  • 池化（Pooling）在卷积神经网络中的作用

    池化（Pooling）是卷积神经网络（CNN）中的一种下采样操作，旨在减少特征图的尺寸，从而降低计算量、减少参数数量，并增强模型的平移不变性。池化的主要类型：最大池化（Max Pooling）： 在每个池化窗口内，取最大值作为输出。平均池化（Average Pooling）： 在每个池化窗口内，取平均值作为输出。池化的作用：降维： 通过减少特征图的尺寸，降低计算复杂度。增强不变性： 提高模型对平移
    池化 过拟合 卷积
  • ComfyUI工具中【触发词】的作用

    本文归纳在ComfyUI工具中【触发词】的概念、作用及意义。
    ComfyUI 触发词 大模型 Lora FLUX
  • 【分子相互作用】基于MATLAB的分子相互作用的表征模型仿真

    分子在永不停息地作无规则运动。扩散现象是分子作无规则运动的例证。所谓扩散是指两种不用；当分......
    matlab 算法 开发语言 分子相互作用 连线
  • Nature | 基于多层图注意力神经网络的药物-靶点相互作用预测模型研究

    AI大模型作为人工智能领域的重要技术突破，正成为推动各行各业创新和转型的关键力量。抓住AI大模型的风口，掌握A
    神经网络 人工智能 深度学习 大模型 ai
  • 基于MATLAB的分子相互作用的表征模型

    分子在永不停息地作无规则运动。扩散现象是分子作无规则运动的例证。所谓扩散是指两种不同的物质相互接触时，彼此进入对方的现象。分子之间既有引力
    分子 表征模型 子函数 建模 数据
  • 基于Gromacs的蛋白质与小分子配体相互作用模拟教程

    随后，我们将详细阐述模拟的具体步骤，包括结构准备（如蛋白质结构预测、小分子结构优化等）、相互作用模拟（如
    gromacs 蛋白 小分子 分子动力学 径向分布
  • DAO、NFT与DeFi的相互作用

    随着互联网技术的快速发展，我们正步入Web3.0时代，一个包含分布式计算、区块链、人工智能等多种技术的全新时代。在这个时代，互联网将更加去中心化、安全、隐私保护和智能化。与此同时，共产主义作为一种社会制度，一直以来都是对未来社会的一种设想。那么，在Web3.0时代，共产主义是否能够与现
    区块链 人工智能 区块链技术
  • KG4MM：融合知识图谱与多模态数据预测药物相互作用

    知识图谱（Knowledge Graph, KG）作为表示不同实体间复杂关系的有效工具，已得到广泛应用。通过将信息编码为节点（实体
    知识图谱 人工智能 深度学习 模态 数据
  • 梯度下降与集成学习：奇妙的相互作用

    1.背景介绍梯度下降（Gradient Descent）和集成学习（Ensemble Learning）都是机器学习领域中的重要技术，它们各自在不同场景下发挥
    大数据 人工智能 语言模型 AI LLM
  • 研究多个基因间相互作用的频域方法

    课题名称：研究多个基因间相互作用的频域方法 --------------------------------------------------------------------------------
    频域 数据 时间序列
  • 基于Materials Studio计算胆碱类低共熔溶剂的相互作用

    通过图3可以看出氯离子与氧、碳原子发生强烈共振,最高占据态内是由Cl-3s、Cl-3p、O-2s、O-2p、
    MS dmol3 氢键 低共溶溶剂 径向分布
  • 为什么在线性模型中相互作用的变量要相乘

    在这篇文章中,我将解释为什么当建立一个线性模型,我们添加一个x₁₂术语如果我们认为变量x₁和x₂互动和添加交互条款订立原则方法。我假设读
    机器学习 线性回归 数学建模 斜率 线性模型
  • 多变量相互作用 特征选择 python

    # 多变量相互作用与特征选择：Python 实现指南在机器学习中，多变量相互作用和特征选择是提升模型性能及减少过拟合的重要步骤。对于刚入行的小白来说，了解整个流程至关重要。在本文中，我们将通过几个步骤来实现多变量相互作用的特征选择。## 流程概述以下是实现多变量相互作用特征选择的步骤：| 步骤 | 描述 ||------|---
    特征选择 python 特征工程
  • 新人工智能工具预测突变对蛋白质相互作用的影响

    来自克利夫兰诊所和康奈尔大学的科学家开发了一种公开可用的计算工具，可以预测DNA中与疾病相关的突变如何影响癌症和其他复杂疾病中的蛋白质-蛋白质相互作用。在人类中，数百种蛋白质在一个被称为相互作用组的复杂网络中相互作用。当致病突变被引入编码这些蛋白质的基因时，这些相互作用变得更加复杂。一些基因可以以不同的方式发生突变，导致相同的疾病，这意味着一种疾病可能与多个相互作用组有关。这对药物开发人员提出了挑
    人工智能 数据库 数据 开发人员
  • Rx Strategist：智能体实现处方验证的方方面面，如适应症、剂量、药物相互作用

    在验证一个复杂的多药处方时，系统首先使用知识图谱快速检索每种药物的基本信息（子解法1和2），然后通过多阶段LLM管道分析药物
    人工智能 数据 结构化 搜索策略
  • 高效且准确，郑州大学团队开发新AI工具识别药物-靶标相互作用 | 最新快讯

    随着训练轮数的增加，正例和反例逐渐被区分开来，这证明了 MIDTI 所学习的嵌入具有良好的区分力和解释性，从而提高了 DTI 预测的准确性
    团队开发 人工智能 异构 机器学习 基线
  • STRING:蛋白质相互作用(PPI网络)数据库简介

    欢迎关注”生信修炼手册”!研究蛋白之间的相互作用网络，有助于挖掘核心的调控基因，目前已经有很多的蛋白质相互作
    数据库 数据 连线
  • 振弦采集仪岩石桩基施工相互作用监测中的几个方面

    它可以实时监测桩基的位移、振动频率和振动幅值等重要参数，从而评估施工过程中的力学行为和变形状况，提供科学依
    岩土工程 测量仪器 工程监测 科学技术
  • lammps教程：compute group/group原子组相互作用计算方法

    大家好，我是小马老师。本文介绍lammps计算原子组之间相互作用的一个命令：compute group/group。在lammps模拟中，经常需要计算原子组之间的相互作用，如摩擦球与基体之间、流体与壁面之间等等。lammps提供compute group/group命令可完成此功能。compute group/group命令既可以计算原子组之间的作用能
    lammps 分子动力学模拟 lammps培训 分子动力学 公众号
  • 【JavaSE】JVM

    摘要 JVM是Java程序的运行环境，负责将编译后的Class文件加载到内存中执行。其核心组件包括类加载器（启动类、扩展类、应用加载器）、方法区（存储类信息、常量池）、堆内存（分为新生代、老年代和永久代/元空间）以及栈（线程私有，存储方法调用）。JVM通过双亲委派机制确保类加载安全，并采用垃圾回收机制管理内存。堆内存调优和OOM排查是重要实践，可通过工具（如JProfiler）分析内存问题。从JDK1.8起，永久代被元空间替代，与JVM分离。
    jvm java 方法区 System JVM
  • Python网络测速工具speedtest-cli实战指南

    speedtest-cli 是一个基于 Python 构建的轻量级命令行网络测速工具，其核心功能是通过与 Speedtest.net 的 API 交互，精准测量网络的上传速度、下载速度及延迟（ping）等关键性能指标。该工具无需图形界面，适用于服务器环境、自动化运维脚本及网络质量监控系统。
    服务器 Python 上传
  • RecyclerView使用-涂鸦智能App的首页和添加效果-从0到1过程

    本周作业本篇仅为了完成作业， 三选一，选个最bt的，开始 由于压根没做过，绝对大量踩坑 边写边更新，越写越头疼页面分析首页布局分析如何实现两列摆放利用上一个最简使用的Recycler进行测试，加上下面的代码可以实现两列摆放// 使用 GridLayoutManager，每行两列GridLayoutManager gridLayoutManager = new GridLayoutManager(t
    参考资料 右键 ico
  • 基于小波变换的图像特征提取与畸变校正实现

    一、技术实现 1. 小波多尺度特征提取 % 使用db4小波进行三级分解 [cA,cH,cV,cD] = wavedec2(I,3,'db4'); % 提取各尺度特征 level1 = appcoef2(cA,1); % 低频特征 level2 = detcoef2('all',cH,1); % 水平 ...
    角点 特征匹配 图像特征
  • 为什么display的子项目设置宽为百分比就会导致echart的resize失效

    前端CSS每日一姿势——display属性的使用一、display 的作用CSS 的 display 属性是用来指定 HTML 元素应该生成的框的类型。它可以控制元素的外观、布局和行为。通过修改 display 属性，我们可以将元素显示为块级元素、行内元素、行内块级元素、列表项、表格等不同的类型。二、display 的基本用法display 属性可以在 CSS 中直接使用。例如：div { d
    #css #css3 #html #前端 #js
小锋学长生活大爆炸
    关注
    分类列表 更多
    • # 干货81篇
    • # 技术文章48篇
    • # 学习之旅208篇
    • # 爬坑之旅72篇
    • # 论文文献11篇
    精品课程领资料
    免费资料>
    2025软考
    系统架构设计师 系统规划与管理师 软件设计师 系统集成项目管理工程师
    信创认证
    系统架构师 信创集成项目管理师 信创规划管理师 系统开发工程师
    厂商认证
    CKA/CKS架构师 红帽认证工程师 Oracle-OCP认证 Oracle-OCM认证
    IT技术
    数据库高级工程师 AIGC大模型实战 Linux云计算架构师 Python全栈开发
    华为认证
    数通HCIP认证 云计算HCIE认证 华为存储HCIE认证 HCIP安全认证
    近期文章
    • 1.H5 混合应用加密实战，多工具组合完成 IPA 混淆、资源扰动与发布治理（H5混合应用加固 IPA混淆 IpaGuard实操）
    • 2.如何在不同的构建环境中使用不同的API地址？
    • 3.AI超级智能体教程（七）---RAG实战本地知识库和云端知识库
    • 4.组成原理--指令&&指令集&&寻址方式的介绍
    • 5.基于Springboot + vue3实现的数字资源共享平台
    新人福利
    • 意见
      反馈
    • 训练营训练营

    举报文章

    请选择举报类型

    内容侵权 涉嫌营销 内容抄袭 违法信息 其他

    具体原因

    包含不真实信息 涉及个人隐私

    原文链接（必填）

    补充说明

    0/200

    上传截图

    格式支持JPEG/PNG/JPG，图片不超过1.9M

    已经收到您得举报信息，我们会尽快审核
    • 赞
    • 收藏
    • 评论
    • 分享
    如有误判或任何疑问，可联系 「小助手微信：cto51cto」申诉及反馈。
    我知道了
    51CTO首页
    AI.x社区
    博客
    学堂
    精品班
    软考社区
    免费课
    企业培训
    鸿蒙开发者社区
    信创认证
    公众号矩阵
    移动端
    视频课 免费课 排行榜 短视频 直播课 软考学堂
    全部课程 软考 信创认证 华为认证 厂商认证 IT技术 PMP项目管理 免费题库
    在线学习
    文章 资源 问答 课堂 专栏 直播
    51CTO
    鸿蒙开发者社区
    51CTO技术栈
    51CTO官微
    51CTO学堂
    51CTO博客
    CTO训练营
    鸿蒙开发者社区订阅号
    51CTO软考
    51CTO学堂APP
    51CTO学堂企业版APP
    鸿蒙开发者社区视频号
    51CTO软考题库
    51CTO博客

    51CTO博客

    • 首页
    • 关注
    • 排行榜
    • 精品课程升职加薪
    • 免费资料领资料
    • 软考题库软考题库
      软考题库
      科目全、试题精、讲解专业，扫码免费刷
    • 搜索历史 清空
      热门搜索
      查看【 】的结果
    • 写文章
    • 创作中心
    • 登录注册
    51CTO博客

    Copyright © 2005-2025 51CTO.COM 版权所有 京ICP证060544号

    关于我们
    官方博客 全部文章 热门标签 班级博客
    了解我们 网站地图 意见反馈
    友情链接
    鸿蒙开发者社区 51CTO学堂
    51CTO 软考资讯