DNA序列
一个 DNA 序列由 ACGT 四个字母的排列组合组成。 G 和 C 的比例(定义为 GC-Ratio )是序列中 G 和 C 两个字母的总的出现次数除以总的字母数目(也就是序列长度)。在基因工程中,这个比例非常重要。因为高的 GC-Ratio 可能是基因的起始点。 给定一个很长的 DNA 序列,以及限定的子串长度 N ,请帮助研究人员在给出的 DNA 序列中从左往右找出 GC-Ratio 最高且长度为 N 的第一个子串。 DNA序列为 ACGT 的子串有: ACG , CG , CGT 等等,但是没有 AGT , CT 等等 数据范围:字符串长度满足,输入的字符串只包含 ACGT 字母
数据范围:字符串长度满足 1≤n≤1000 ,输入的字符串只包含 A/C/G/T 字母
输入描述:
输入一个string型基因序列,和int型子串的长度输出描述:
找出GC比例最高的子串,如果有多个则输出第一个的子串示例1
输入
ACGT
2输出
CG说明
ACGT长度为2的子串有AC,CG,GT3个,其中AC和GT2个的GC-Ratio都为0.5,CG为1,故输出CG示例2
输入
CGACC
4输出
GCAC说明
虽然CGACC的GC-Ratio也是最高,但它是从左往右找到的GC-Ratio最高的第2个子串,所以只能输出GCACG。Java 编程
package cn.net.javapub.demo2.demo;
/**
* @author: shiyuwang
*/
import java.io.BufferedReader;
import java.io.InputStreamReader;
import java.io.IOException;
public class Main {
public static void main(String[] args) throws IOException {
BufferedReader br = new BufferedReader(new InputStreamReader(System.in));
String str;
while ((str = br.readLine()) != null) {
int len = Integer.parseInt(br.readLine());
char[] c = str.toCharArray();
int max = 0;
int start = 0;
for (int i = 0; i < c.length - len; i++) {
int count = 0;
for (int j = 0; j < len; j++) {
if (c[i + j] == 'G' || c[i + j] == 'C')
count++;
}
if (count > max) {
start = i;
max = count;
}
}
StringBuilder builder = new StringBuilder();
for (int i = start; i < start + len; i++) {
builder.append(c[i]);
}
System.out.println(builder.toString());
}
}
}展示效果:


















