Java web 开发最经典的是MVC模式，即Model-View-Controller。
用户通过视图层发出请求，控制器接收用户的请求，决定调用哪个模型来进行处理，然后模型调用业务逻辑来处理用户的请求并返回数据，控制器将处理后的数据传递给视图层，通过视图层展现给用户。
MVC框架主要有View层、Controller层、model层和持久层的技术实现。
view层有JSP、velocity、freemarker、sitemesh、JSF2等。
controller 层和model层主要是structs2和spring3。
持久层主要是hibernate3。
关于项目包结构：
com.系统名.action ：用来存放控制器类
com.系统名.domain ：用来存放实体类
com.系统名.service ：用来存放业务逻辑接口类
com.系统名.service.impl ：用来存放业务逻辑实体类
com.系统名.dao ：用来存放DAO接口类
com.系统名.dao.impl ：用来存放DAO的实体类
