nginx是一款非常流行的开源Web服务器软件，它在Linux系统中被广泛使用。在Linux系统中，root目录权限是非常重要的，因为root目录是整个系统的最高目录，对root目录的权限管理将直接影响系统的安全性和稳定性。

nginx在Linux系统中通常以root用户身份运行，因为它需要监听80端口等一些需要root权限的操作。然而，如果nginx的配置不正确或者被黑客攻击，就可能导致系统的root目录权限遭到破坏，从而危及整个系统的安全。

为了保护系统的root目录权限，我们可以采取一些措施。首先，要确保nginx的配置文件和日志文件的权限设置正确，最好将这些文件的所有者设置为nginx用户或者其他普通用户，而不是root用户。这样可以降低被攻击导致系统root目录权限被破坏的风险。

其次，我们还可以通过限制nginx的权限来保护系统的root目录。可以通过修改nginx的配置文件，使用user指令将nginx的用户从root用户改为其他用户，这样即使nginx被攻击也不会影响到系统的root目录权限。

此外，定期检查nginx的配置文件和日志文件的权限设置，及时发现问题并及时解决，也是保护系统root目录权限的重要措施。当发现nginx的配置文件或者日志文件的权限出现问题时，及时更正并排查原因，避免进一步危及系统的安全。

总的来说，要保护系统的root目录权限，需要从多个方面着手，包括正确设置nginx的配置文件和日志文件权限、限制nginx的权限、及时发现并解决问题等。只有全面做好这些措施，才能保障系统root目录权限的安全，确保系统的稳定性和安全性。