cora数据集- 下载地址https://linqs-data.soe.ucsc.edu/public/lbc/cora.tgz

内容介绍:

样本特征,标签,邻接矩阵
该数据集共2708个样本点,每个样本点都是一篇科学论文,所有样本点被分为8个类别

类别分别是1)基于案例;2)遗传算法;3)神经网络;4)概率方法;5)强化学习;6)规则学习;7)理论

每篇论文都由一个1433维的词向量表示,所以,每个样本点具有1433个特征。词向量的每个元素都对应一个词,且该元素只有0或1两个取值。取0表示该元素对应的词不在论文中,取1表示在论文中。所有的词来源于一个具有1433个词的字典。

每篇论文都至少引用了一篇其他论文,或者被其他论文引用,也就是样本点之间存在联系,没有任何一个样本点与其他样本点完全没联系。如果将样本点看做图中的点,则这是一个连通的图,不存在孤立点(?)。

文件格式

下载的压缩包中有三个文件,分别是cora.cites,cora.content,README。

数据集两个文件:

1个是cora.content   节点的特征

1个是cora.cires       边的信息

README是对数据集的介绍;cora.content是所有论文的独自的信息;cora.cites是论文之间的引用记录。

cora.content共有2708行,每一行代表一个样本点,即一篇论文。

如下所示,每一行由三部分组成,分别是论文的编号,如31336;论文的词向量,一个有1433位的二进制;论文的类别,如Neural_Networks。

Cora数据集的边加权重 cora数据集介绍_ci

Cora数据集的边加权重 cora数据集介绍_邻接矩阵_02

 

 cora.cites共5429行, 每一行有两个论文编号,表示第一个编号的论文先写,第二个编号的论文引用第一个编号的论文。如下所示:

Cora数据集的边加权重 cora数据集介绍_Cora数据集的边加权重_03

           

Cora数据集的边加权重 cora数据集介绍_词向量_04

cora数据集- 用python处理

  • 用python导入数据,并分离样本特征,标签,创建邻接矩阵

1.导入数据

import pandas as pd
import numpy as np
# 导入数据:分隔符为空格
raw_data = pd.read_csv('data/cora/cora.content',sep = '\t',header = None)
num = raw_data.shape[0] # 样本点数2708

2.将论文的编号转化为[0,2707]

# 将论文的编号转[0,2707]
a = list(raw_data.index)
b = list(raw_data[0])
c = zip(b,a)
map = dict(c)

3.提取词向量,成为特征矩阵

# 将词向量提取为特征,第二行到倒数第二行
features =raw_data.iloc[:,1:-1]
 # 检查特征:共1433个特征,2708个样本点
print(features.shape)

4.提取标签,进行独热编码

labels = pd.get_dummies(raw_data[1434])
print(labels.head(3))

  标签的前3行如下

Case_Based  Genetic_Algorithms  Neural_Networks  Probabilistic_Methods  \
0           0                   0                1                      0   
1           0                   0                0                      0   
2           0                   0                0                      0   

   Reinforcement_Learning  Rule_Learning  Theory  
0                       0              0       0  
1                       0              1       0  
2                       1              0       0

5.导入论文引用数据

raw_data_cites = pd.read_csv('data/cora/cora.cites',sep = '\t',header = None)

6. 创建邻接矩阵

# 创建一个规模和邻接矩阵一样大小的矩阵
matrix = np.zeros((num,num))
# 创建邻接矩阵
for i ,j in zip(raw_data_cites[0],raw_data_cites[1]):
    x = map[i] ; y = map[j]  #替换论文编号为[0,2707]
    matrix[x][y] = matrix[y][x] = 1 #有引用关系的样本点之间取1
# 查看邻接矩阵的元素和(按每列汇总)
print(sum(matrix))