我们时常在各类生物科研公众号上看到鼓励大家学习python的广告,编程对于生命科学研究者来说确实是一项加分技能,能帮助他们完成许多关键的研究任务。然而,对于生命科学领域的研究者和学生来说,学习编程需要耗费极大的时间和精力, Python的语法也需要一定的时间来学习和理解。

例如,缩进、冒号以及变量声明等都是Python独特的语法,在编写代码时极易在这些细微之处出错。Python支持多种数据类型,如字符串、列表、元组、字典等。初学者对于不同数据类型的使用场景和特点还不够清楚,需要花费一些时间来学习。虽然Python拥有丰富的库和模块,但是,初学者可能不知道应该使用哪些库和模块来解决问题,

最后编写代码时,难免会出现错误。调试和处理错误也是学习Python过程中非常耗时的过程。那么有没有更加适合生物科研工作者的计算机技术呢,可以不用费力学习枯燥的代码,也能极高的提高科研效率,飞鱼自动化机器人就可完美解决这个问题。

这里举一个常见的案例,相信每一位研究生物学的同学都用过NCBI,NCBI是美国国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information)的缩写。主要负责收集、存储和分配生物科学领域的基因组、蛋白质序列等各种生物学信息资源,并为科学家们提供免费的访问和使用这些资源的服务。NCBI网站上提供了一系列生物信息学工具,包括BLAST、Entrez检索系统、RefSeq基因库、GenBank和PubMed等数据库,这些工具和数据库对于生命科学和医学研究都非常重要。大家用的也很频繁,以往我们想查看一段基因序列的资料,都需要到NCBI上进行数据比对。

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这些步骤是固定的,无非是打开网页—输入网址—选择核酸序列数据库——输入序列——点击按钮——等待——提取数据,看上去很简单,但当我们需要一次性分析几百条核酸序列时,这工作量就极大了。

而飞鱼可以模拟人的操作,并用模块化代码的形式将其自动化,继而解放科研人员的双手,节省大量的时间,并且工作效率是人的数倍,可 24小时不间断工作。下面我们就来看看如何用飞鱼来完成这项工作。

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可以看到飞鱼能够自动打开网页,输入序列,并将数据写入Excel文件中,那么程序是如何编写的呢?

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可以看到,每一步的指令都对应了人的操作,清晰明了,不需要学习复杂的编程语言即可完成。那么飞鱼是什么,为什么它有如此神奇的魔力?

飞鱼属于RPA机器人,RPA是机器人流程自动化(Robot Process Automation)的缩写,与Python相比,飞鱼具有以下优点:

更加易于使用

飞鱼可以通过图形用户界面(GUI)来创建工作流程,而不需要编写代码。这意味着,即使没有编程经验的生物信息学家也可以轻松地使用它们来完成任务。对于那些需要集中精力于生物信息学研究的人员,RPA自动化机器人可能是更加适合的选择。

更高效且可靠

飞鱼通过模拟人类行为来执行任务。它们可以在多个应用程序之间自由移动,并且可以准确地模仿人类行为,包括点击、滚动、输入和检查数据等操作。这使得它们比手工操作更快、更精确,同时也更具可靠性。

降低错误率

生物信息学领域中的许多任务都需要进行繁琐的数据输入和检查,这容易引起人为的错误。使用飞鱼可以有效地降低这些错误的概率,从而提高数据质量和分析结果的准确性。

支持无监督任务

对于一些需要长时间运行或者在非工作时间完成的任务,飞鱼可以在没有人类干预的情况下运行。这意味着,生物学家可以在完成任务后离开实验室,而不必等待任务完成。

总之,RPA自动化机器人在生物信息学领域中的应用不断扩大。由于其易用性、效率和可靠性等优点,它们可以帮助生物信息学家更加高效、准确地完成各种重复性任务,减少了繁琐的手工操作,从而让生物学家有更多的时间专注于数据分析和解释。