SOM聚类python实现

介绍

自组织映射(Self-Organizing Map,SOM)是一种无监督学习算法,常用于聚类和降维。它能够将高维的输入数据映射到一个低维的空间中,从而发现数据中的隐含结构。在本文中,我将教会你如何使用Python实现SOM聚类算法。

步骤

下面是实现SOM聚类算法的基本步骤:

步骤 描述
1 导入必要的库
2 准备数据
3 初始化SOM网络
4 训练SOM网络
5 可视化聚类结果

接下来,我会逐步详细说明每个步骤需要做什么,以及所需的代码。

1. 导入必要的库

首先,我们需要导入一些必要的库,包括NumPy、Matplotlib和sklearn:

import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
from sklearn.datasets import make_blobs

2. 准备数据

我们可以使用make_blobs函数生成一些合成数据来进行实验。这个函数可以生成具有指定中心数量和标准差的高斯分布数据。

X, y = make_blobs(n_samples=100, centers=4, random_state=42)

3. 初始化SOM网络

接下来,我们需要初始化SOM网络。SOM网络由一个二维的网格组成,每个网格点都有一个权重向量。我们可以通过随机选择一些样本作为初始权重向量来初始化网络。

grid_size = (10, 10)  # 网格大小
input_dim = X.shape[1]  # 输入数据的维度

# 初始化权重向量
weights = np.random.randn(grid_size[0], grid_size[1], input_dim)  

4. 训练SOM网络

在这一步中,我们将使用输入数据来训练SOM网络。训练过程包括以下几个步骤:

  1. 首先,选择一个输入样本。
  2. 然后,计算输入样本与所有权重向量之间的距离,找到最近的权重向量。
  3. 对于最近的权重向量以及其邻居,更新它们的权重向量,使其更接近于输入样本。
learning_rate = 0.1

# 迭代训练
for i in range(X.shape[0]):
    # 选择一个输入样本
    input_sample = X[i]
    
    # 计算输入样本与所有权重向量之间的距离
    distances = np.linalg.norm(weights - input_sample, axis=2)
    
    # 找到最近的权重向量的索引
    winner_index = np.unravel_index(np.argmin(distances), distances.shape)
    
    # 更新最近的权重向量以及其邻居
    for x in range(grid_size[0]):
        for y in range(grid_size[1]):
            distance_to_winner = np.linalg.norm(np.array([x, y]) - np.array(winner_index))
            influence = np.exp(-distance_to_winner / (2 * learning_rate))
            weights[x, y] += influence * (input_sample - weights[x, y])

5. 可视化聚类结果

最后,我们将使用Matplotlib库将聚类结果可视化。我们可以在二维空间中绘制SOM网络的权重向量,并根据输入数据的类别对其进行着色。

# 绘制SOM网络的权重向量
plt.figure(figsize=(8, 8))
for x in range(grid_size[0]):
    for y in range(grid_size[1]):
        plt.scatter(weights[x, y, 0], weights[x, y, 1], color='k')
plt.xlabel('Feature 1')
plt.ylabel('Feature 2')

# 根据输入数据的类别对SOM网络的权重向量进行着色
for i in range(X.shape[0]):
    input_sample = X[i]
    distances = np.linalg.norm(weights - input_sample, axis=2)
    winner_index = np.unravel_index(np.argmin(distances