Python 与脑电地形图(EEG Topography)

脑电图(Electroencephalogram, EEG)是一种常用的技术用于记录脑电波活动,从而帮助我们理解大脑的工作状态。脑电图可以通过电极在头皮表面捕获脑电信号,以此监测精神状态、癫痫发作和其他神经系统病症等。而脑电地形图(EEG Topography)则是通过可视化方式展示这些电活动的空间分布,有助于分析和理解大脑在不同状态下的表现。

在这篇文章中,我们将介绍如何用 Python 创建脑电地形图,具体使用MNE库来处理 EEG 数据,并利用Matplotlib进行可视化。

安装必要的库

在开始之前,确保已安装以下库。你可以使用以下命令安装:

pip install mne matplotlib numpy

加载和处理EEG数据

首先,我们需要加载一些EEG数据,MNE库支持多种格式。以下是加载数据的一些基本步骤:

import mne

# 加载样本数据,这里使用 MNE 附带的内置示例数据
data_path = mne.datasets.sample.data_path()
raw = mne.io.read_raw_fif(data_path + '/MEG/sample/sample_audvis_raw.fif', preload=True)

# 显示原始数据的简介
print(raw)

创建脑电地形图

一旦数据加载完成,我们可以选择感兴趣的时间段和通道。然后,使用 mne.viz.plot_compare_evokeds 函数来可视化地形图。下面是一个示例代码片段,展示如何做到这一点:

# 定义时间段
time_slice = (0.1, 0.3)  # 例如,0.1s到0.3s的时间段

# 创建脑电地形图
evoked = raw.copy().filter(1, 40).average()  # 平均化并进行滤波
evoked.plot_topomap(times='auto', ch_type='eeg', time_unit='s', title='EEG Topography')

在这个代码示例中,我们首先对信号进行了1到40Hz的带通滤波处理,然后计算了平均值。这种方法能够强调整个时间段的关键特征。

展示结果

通过以上代码,我们最终可以生成脑电地形图。这种可视化可以清楚地字段脑电活动在不同通道间的分布情况,进而为其后续的分析提供直观支持。例如,可以观察到额头区域(尤其是 Fz、Fpz 通道)在特定刺激下的电活动增强。

import matplotlib.pyplot as plt

plt.figure()
evoked.plot_topomap(times='auto', title='EEG Topography', show=True)
plt.show()

结论

通过使用 Python 和 MNE 库,我们可以轻松地处理 EEG 数据并创建脑电地形图。这种方法为我们理解和分析大脑活动提供了有力工具。不论是研究神经科学还是临床医学,这种可视化方法都将极大地推动我们对大脑功能的探索。但值得指出的是,以上代码只是一个简单的示例,深度分析还需结合特定实验条件与数据处理步骤。

希望这篇文章能够帮助您初步了解如何使用 Python 创建脑电地形图,进而揭示大脑的神秘世界。如果您对脑电图感兴趣,不妨动手实践一下!