一般来说,基于Hadoop的MapReduce框架来处理数据,主要是面向海量大数据,对于这类数据,Hadoop能够使其真正发挥其能力。对于海量小文件,不是说不能使用Hadoop来处理,只不过直接进行处理效率不会高,而且海量的小文件对于HDFS的架构设计来说,会占用NameNode大量的内存来保存文件的元数据(Bookkeeping)。另外,由于文件比较小,我们是指远远小于HDFS默认Block大小(64M),比如1k~2M,都很小了,在进行运算的时候,可能无法最大限度地充分Locality特性带来的优势,导致大量的数据在集群中传输,开销很大。
但是,实际应用中,也存在类似的场景,海量的小文件的处理需求也大量存在。那么,我们在使用Hadoop进行计算的时候,需要考虑将小数据转换成大数据,比如通过合并压缩等方法,可以使其在一定程度上,能够提高使用Hadoop集群计算方式的适应性。Hadoop也内置了一些解决方法,而且提供的API,可以很方便地实现。
下面,我们通过自定义InputFormat和RecordReader来实现对海量小文件的并行处理。
基本思路描述如下:
在Mapper中将小文件合并,输出结果的文件中每行由两部分组成,一部分是小文件名称,另一部分是该小文件的内容。
编程实现
我们实现一个WholeFileInputFormat,用来控制Mapper的输入规格,其中对于输入过程中处理文本行的读取使用的是自定义的WholeFileRecordReader。当Map任务执行完成后,我们直接将Map的输出原样输出到HDFS中,使用了一个最简单的IdentityReducer。
现在,看一下我们需要实现哪些内容:
- 读取每个小文件内容的WholeFileRecordReader
- 定义输入小文件的规格描述WholeFileInputFormat
- 用来合并小文件的Mapper实现WholeSmallfilesMapper
- 输出合并后的文件Reducer实现IdentityReducer
- 配置运行将多个小文件合并成一个大文件
接下来,详细描述上面的几点内容。
- WholeFileRecordReader类
输入的键值对类型,对小文件,每个文件对应一个InputSplit,我们读取这个InputSplit实际上就是具有一个Block的整个文件的内容,将整个文件的内容读取到BytesWritable,也就是一个字节数组。
01 package org.shirdrn.kodz.inaction.hadoop.smallfiles.whole;
02
03 import java.io.IOException;
04
05 import org.apache.hadoop.fs.FSDataInputStream;
06 import org.apache.hadoop.fs.FileSystem;
07 import org.apache.hadoop.fs.Path;
08 import org.apache.hadoop.io.BytesWritable;
09 import org.apache.hadoop.io.IOUtils;
10 import org.apache.hadoop.io.NullWritable;
11 import org.apache.hadoop.mapreduce.InputSplit;
12 import org.apache.hadoop.mapreduce.JobContext;
13 import org.apache.hadoop.mapreduce.RecordReader;
14 import org.apache.hadoop.mapreduce.TaskAttemptContext;
15 import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileSplit;
16
17 public class WholeFileRecordReader extends RecordReader<NullWritable, BytesWritable> {
18
19 private FileSplit fileSplit;
20 private JobContext jobContext;
21 private NullWritable currentKey = NullWritable.get();
22 private BytesWritable currentValue;
23 private boolean finishConverting = false;
24
25 @Override
26 public NullWritable getCurrentKey() throws IOException, InterruptedException {
27 return currentKey;
28 }
29
30 @Override
31 public BytesWritable getCurrentValue() throws IOException, InterruptedException {
32 return currentValue;
33 }
34
35 @Override
36 public void initialize(InputSplit split, TaskAttemptContext context) throws IOException, InterruptedException {
37 this.fileSplit = (FileSplit) split;
38 this.jobContext = context;
39 context.getConfiguration().set("map.input.file", fileSplit.getPath().getName());
40 }
41
42 @Override
43 public boolean nextKeyValue() throws IOException, InterruptedException {
44 if (!finishConverting) {
45 currentValue = new BytesWritable();
46 int len = (int) fileSplit.getLength();
47 byte[] content = new byte[len];
48 Path file = fileSplit.getPath();
49 FileSystem fs = file.getFileSystem(jobContext.getConfiguration());
50 FSDataInputStream in = null;
51 try {
52 in = fs.open(file);
53 IOUtils.readFully(in, content, 0, len);
54 currentValue.set(content, 0, len);
55 } finally {
56 if (in != null) {
57 IOUtils.closeStream(in);
58 }
59 }
60 finishConverting = true;
61 return true;
62 }
63 return false;
64 }
65
66 @Override
67 public float getProgress() throws IOException {
68 float progress = 0;
69 if (finishConverting) {
70 progress = 1;
71 }
72 return progress;
73 }
74
75 @Override
76 public void close() throws IOException {
77 // TODO Auto-generated method stub
78
79 }
80 }
实现RecordReader接口,最核心的就是处理好迭代多行文本的内容的逻辑,每次迭代通过调用nextKeyValue()方法来判断是否还有可读的文本行,直接设置当前的Key和Value,分别在方法getCurrentKey()和getCurrentValue()中返回对应的值。
另外,我们设置了”map.input.file”的值是文件名称,以便在Map任务中取出并将文件名称作为键写入到输出。
- WholeFileInputFormat类
01 package org.shirdrn.kodz.inaction.hadoop.smallfiles.whole;
02
03 import java.io.IOException;
04
05 import org.apache.hadoop.io.BytesWritable;
06 import org.apache.hadoop.io.NullWritable;
07 import org.apache.hadoop.mapreduce.InputSplit;
08 import org.apache.hadoop.mapreduce.RecordReader;
09 import org.apache.hadoop.mapreduce.TaskAttemptContext;
10 import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat;
11
12 public class WholeFileInputFormat extends FileInputFormat<NullWritable, BytesWritable> {
13
14 @Override
15 public RecordReader<NullWritable, BytesWritable> createRecordReader(InputSplit split, TaskAttemptContext context) throws IOException, InterruptedException {
16 RecordReader<NullWritable, BytesWritable> recordReader = new WholeFileRecordReader();
17 recordReader.initialize(split, context);
18 return recordReader;
19 }
20 }
这个类实现比较简单,继承自FileInputFormat后需要实现createRecordReader()方法,返回用来读文件记录的RecordReader,直接使用前面实现的WholeFileRecordReader创建一个实例,然后调用initialize()方法进行初始化。
- WholeSmallfilesMapper
01 package org.shirdrn.kodz.inaction.hadoop.smallfiles.whole;
02
03 import java.io.IOException;
04
05 import org.apache.hadoop.io.BytesWritable;
06 import org.apache.hadoop.io.NullWritable;
07 import org.apache.hadoop.io.Text;
08 import org.apache.hadoop.mapreduce.Mapper;
09
10 public class WholeSmallfilesMapper extends Mapper<NullWritable, BytesWritable, Text, BytesWritable> {
11
12 private Text file = new Text();
13
14 @Override
15 protected void map(NullWritable key, BytesWritable value, Context context) throws IOException, InterruptedException {
16 String fileName = context.getConfiguration().get("map.input.file");
17 file.set(fileName);
18 context.write(file, value);
19 }
20 }
- IdentityReducer类
01 package org.shirdrn.kodz.inaction.hadoop.smallfiles;
02
03 import java.io.IOException;
04
05 import org.apache.hadoop.mapreduce.Reducer;
06
07 public class IdentityReducer<Text, BytesWritable> extends Reducer<Text, BytesWritable, Text, BytesWritable> {
08
09 @Override
10 protected void reduce(Text key, Iterable<BytesWritable> values, Context context) throws IOException, InterruptedException {
11 for (BytesWritable value : values) {
12 context.write(key, value);
13 }
14 }
15 }
这个是Reduce任务的实现,只是将Map任务的输出原样写入到HDFS中。
- WholeCombinedSmallfiles
01 package org.shirdrn.kodz.inaction.hadoop.smallfiles.whole;
02
03 import java.io.IOException;
04
05 import org.apache.hadoop.conf.Configuration;
06 import org.apache.hadoop.fs.Path;
07 import org.apache.hadoop.io.BytesWritable;
08 import org.apache.hadoop.io.Text;
09 import org.apache.hadoop.mapreduce.Job;
10 import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.input.FileInputFormat;
11 import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.FileOutputFormat;
12 import org.apache.hadoop.mapreduce.lib.output.SequenceFileOutputFormat;
13 import org.apache.hadoop.util.GenericOptionsParser;
14 import org.shirdrn.kodz.inaction.hadoop.smallfiles.IdentityReducer;
15
16 public class WholeCombinedSmallfiles {
17
18 public static void main(String[] args) throws IOException, ClassNotFoundException, InterruptedException {
19
20 Configuration conf = new Configuration();
21 String[] otherArgs = new GenericOptionsParser(conf, args).getRemainingArgs();
22 if (otherArgs.length != 2) {
23 System.err.println("Usage: conbinesmallfiles <in> <out>");
24 System.exit(2);
25 }
26
27 Job job = new Job(conf, "combine smallfiles");
28
29 job.setJarByClass(WholeCombinedSmallfiles.class);
30 job.setMapperClass(WholeSmallfilesMapper.class);
31 job.setReducerClass(IdentityReducer.class);
32
33 job.setMapOutputKeyClass(Text.class);
34 job.setMapOutputValueClass(BytesWritable.class);
35 job.setOutputKeyClass(Text.class);
36 job.setOutputValueClass(BytesWritable.class);
37
38 job.setInputFormatClass(WholeFileInputFormat.class);
39 job.setOutputFormatClass(SequenceFileOutputFormat.class);
40
41 job.setNumReduceTasks(5);
42
43 FileInputFormat.addInputPath(job, new Path(otherArgs[0]));
44 FileOutputFormat.setOutputPath(job, new Path(otherArgs[1]));
45
46 int exitFlag = job.waitForCompletion(true) ? 0 : 1;
47 System.exit(exitFlag);
48 }
49
50 }
这是是程序的入口,主要是对MapReduce任务进行配置,只需要设置好对应的配置即可。我们设置了5个Reduce任务,最终会有5个输出结果文件。
这里,我们的Reduce任务执行的输出格式为SequenceFileOutputFormat定义的,就是SequenceFile,二进制文件