0 说明
本文为研究java和matlab的混合编程，进行了详细的测试和探索，以解决linux环境下java程序调用matlab程序的一个应用。
linux端的环境 ：（运行java程序并调用windows环境下的Matlab生成的jar包文件）
l Linux ubuntu 3.5.0-17-generic
l java version "1.6.0_45"
l MCR_R2012a_glnx86_installer.zip
windows端的环境：（调试matlab程序，并使用javabuilder生成供java调用的jar包文件）
l win7 X86（32位）
l java version "1.6.0_27"
l matlab 2012a
l eclipse版本不限
（64位的方法雷同）
1 win7下安装vm和vmtool
在vm上安装win7（x86）32位；注意处理器是intel的。（amd处理器需要特殊处理，此处略）
2 win7下安装matlab
7.14.0.739 (R2012a)，需要虚拟光驱。
注意用standalone安装，可以参考crack路径下的install提示，安装完成后需要导入证书
3 Matlab查看需要的jdk版本
>> version -java
ans =Java 1.6.0_17-b04 with Sun Microsystems Inc. Java HotSpot(TM) Client VM mixed mode
4 win7下载和安装jdk
http://www.oracle.com/technetwork/java/javase/downloads/index.html
下载1.6的当前最高版本
配置：
新建 JAVA_HOME jdk路径
新建 CLASSPATH .;%JAVA_HOME%\lib;%JAVA_HOME%\lib\tools.jar
新建 PATH %JAVA_HOME%\bin;%JAVA_HOME%\jre\bin;
在matlab中输入!javac验证是否安装jdk成功
5 Matlab新建helloworld.m文件
function helloworld
% clc
info=char( 'MATLAB hello world!' );
disp(info);
在matlab中测试输入 helloworld将会打印出这句话。
6 Matlab新建java project
可以命令台输入 >> deploytool 调出ja
添加class和m等资源，按编译按钮，大概需要几分钟时间。
7 win7下测试java调用matlab
eclipse新建一个测试工程，导入生成的helloworld.jar和javabuilder.jar（注意系统版本对应）
测试结果如下
8 linux下载和安装mcr
下载mcr
(这里选择linux 32位的mcr X86)
http://www.mathworks.cn/products/compiler/mcr/index.html
安装mcr
installer_input.txt的字段，打开#开头的语句，并赋值
修改安装路径
agreeToLicense=yes
fileInstallationKey=38699-60149-36808-21840-05491
licensePath=/home/hadoop/mcr/lic_standalone.dat
修改日志路径
mode=silent
等等
（如果不行则用root命令进行安装）
如下提示则安装成功
(Jun 17, 2013 20:09:03) Assembling product list...
(Jun 17, 2013 20:09:16) The destination folder /hadoop/matlab does not exist. Would you like to create it?
(Jun 17, 2013 20:09:17) Installing Product: MATLAB Compiler Runtime 7.17
(Jun 17, 2013 20:11:12) Notes:
On the target computer, append the following to your LD_LIBRARY_PATH environment variable:
/hadoop/matlab/v717/runtime/glnx86:/hadoop/matlab/v717/bin/glnx86:/hadoop/matlab/v717/sys/os/glnx86:/hadoop/matlab/v717/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/native_threads:/hadoop/matlab/v717/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/server:/hadoop/matlab/v717/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386
Next, set the XAPPLRESDIR environment variable to the following value:
/hadoop/matlab/v717/X11/app-defaults
(Jun 17, 2013 20:11:12) Exiting with status 0
(Jun 17, 2013 20:11:12) End - Successful.
下载和安装jdk
可参考 http://developer.51cto.com/art/200907/135155.htm
配置jdk和mcr
>>vi .profile
export JAVA_HOME=/hadoop/jdk1.6.0_45
export JRE_HOME=/hadoop/jdk1.6.0_45/jre
export CLASSPATH=.:$JAVA_HOME/lib:$JRE_HOME/lib:$CLASSPATH
export PATH=$JAVA_HOME/bin:$JRE_HOME/bin:$PATH
#这些是jdk的环境变量
export LD_LIBRARY_PATH=$LD_LIBRARY_PATH:/hadoop/mcr/bin/glnx86/:/hadoop/matlab/v717/runtime/glnx86:/hadoop/matlab/v717/bin/glnx86:/hadoop/matlab/v717/sys/os/gln
x86:/hadoop/matlab/v717/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/native_threads:/hadoop/matlab/v717/sys/java/jre/glnx86/jre/lib/i386/server:/hadoop/matlab/v717/sys/java
/jre/glnx86/jre/lib/i386
export XAPPLRESDIR=$XAPPLRESDIR:/hadoop/matlab/v717/X11/app-defaults
#后面两个环境变量是matlab的配置路径，安装matlab完成后会自动提示。其他设置
vi ~/.bashrc
alias matlab='/usr/local/MATLAB/MATLAB_Compiler_Runtime/v717/bin/matlab'
matlab命令找不到libc.so.6，则sudo ln -s /lib/i386-linux-gnu/libc-2.15.so /lib/libc.so.6
matlab命令报matlab: No MATLAB executable for this machine architecture.错，
下载linux jdk x86（32位）
9 linux测试java调用matlab
用eclipse fat-jar对此进行打包后，注意将7中的javabuilder换成javabuilder\ja\glnx86路径下的jar文件
成功。
到此，java调用matlab程序的整个过程基本叙述结束。
