这是协作翻译的第四章,翻译完感觉挺有意思的,分享给大家一起看看。
4.更新OpenFOAM版本
4.1 版本管理
OpenFOAM以两种不同的方式分发。一种方式是使用Git仓库下载的仓库版本。仓库版本的版本号由附加的x标记,例如 OpenFOAM2.1.x。该版本会经常更新,并在某种程度上是开发版本。这个版本的更改和更新发布很快,但是,此版本中出现错误的可能性也更大。由于此发行版经常更新,因此在一个系统上安装的2.1.x版本的内容和另一个系统上安装的2.1.x版本可能会不同。因此,每个安装都有附加的信息来标记不同版本的OpenFOAM。版本号随附一个哈希码,以唯一地标识仓库版本的各个内部版本,请参见列表9。每当更新并重新编译OpenFOAM时,此哈希码都会更改。如果内部版本相同,则两个OpenFOAM安装处于相同级别。
Build : 2.1. x -9 d344f6ac6af
列表 9: 仓库版本的完整版本标识
除了仓库版之外,还有软件包版本。与仓库版本相比,这些更新的间隔时间更长。软件包发行版的版本号不包含x,例如OpenFOAM 2.1.1。与仓库版相反,所有相同版本号的安装都是相同的。由于发行周期较长,因此认为发行包不太容易出现软件错误。
这些软件版本有几种不同的类型。这些是针对广泛使用的Linux发行版(Ubuntu,SuSE和Fedora)的预编译软件包,也是一个源码包。可以将源代码包安装在可编译源代码的任何系统上(通常是运行Linux的各种计算机,例如高性能计算集群,甚至运行其他操作系统的计算机)。例如Mac OSX甚至是Windows).
4.2 检查更新
如果从仓库版本安装了OpenFOAM,则更新非常简单。要更新OpenFOAM时,只需使用Git来检查是否有更新的源文件。在终端中切换到OpenFOAM安装的根目录,然后执行git pull。
如果仓库中有较新的文件,Git会下载它们并显示已更改文件的摘要。如列表10所示。
user@host :∼$ cd $FOAM_INST_DIR
user@host :∼/ OpenFOAM$ cd OpenFOAM -2.1. x
user@host :∼/ OpenFOAM / OpenFOAM -2.1. x$ git pull
remote : Counting objects : 67 , done .
remote : Compressing objects : 100% (13/13) , done .
remote : Total 44 ( delta 32) , reused 43 ( delta 31)
Unpacking objects : 100% (44/44) , done .
From git :// github . com / OpenFOAM / OpenFOAM -2.1. x
72 f00f7 ..21 ed37f master -> origin / master
Updating 72 f00f7 ..21 ed37f
Fast - forward
.../ extrude / extrudeToRegionMesh / createShellMesh .C | 10 +-
.../ extrude / extrudeToRegionMesh / createShellMesh .H | 7 +-
.../ extrudeToRegionMesh / extrudeToRegionMesh .C | 157 ++++++++ - - - - -
.../ Templates / KinematicCloud / KinematicCloud .H | 6 +-
.../ Templates / KinematicCloud / KinematicCloudI .H | 7 +
.../ baseClasses / kinematicCloud / kinematicCloud . H | 47 ++++++ -
6 files changed , 193 insertions (+) , 41 deletions ( -)
列表 10: 有可用的更新
如果OpenFOAM是最新的,则Git也将输出相应的消息,如列表11:
user@host :∼/ OpenFOAM / OpenFOAM -2.1. x$ git pull
Already up -to - date .
列表 11: OpenFOAM是最新的
4.3 仅检查更新
如果您只想检查更新而没有实际进行更新,则可以使用特殊选项来调用Git(请参见列表12和13)。在这种情况下,Git仅检查仓库并显示其发现的结果,而不会实际进行任何更改。负责此操作的选项是--dry-run。注意,这里调用了git fetch而不是git pull。git pull调用git fetch下载远程文件,然后调用git merge将检索到的文件与本地文件合并。因此,检查更新实际上是通过git fetch完成的。
user@host :∼$ cd OpenFOAM / OpenFOAM -2.0. x/
user@host :∼/ OpenFOAM / OpenFOAM -2.0. x$ git fetch --dry - run -v
remote : Counting objects : 189 , done .
remote : Compressing objects : 100% (57/57) , done .
remote : Total 120 ( delta 89) , reused 93 ( delta 62)
Receiving objects : 100% (120/120) , 17.05 KiB , done .
Resolving deltas : 100% (89/89) , completed with 56 local objects .
From git :// github . com / OpenFOAM / OpenFOAM -2.0. x
5 ae2802 ..97 cf67d master -> origin / master
user@host :∼/ OpenFOAM / OpenFOAM -2.0. x$
列表 12: 仅检查更新–可用更新
user@host :∼$ cd OpenFOAM / OpenFOAM -2.1. x/
user@host :∼/ OpenFOAM / OpenFOAM -2.1. x$ git fetch --dry - run -v
From git :// github . com / OpenFOAM / OpenFOAM -2.1. x
= [ up to date ] master -> origin / master
user@host :∼/ OpenFOAM / OpenFOAM -2.1. x$
列表 13: 仅检查更新–最新
4.4 安装更新
在通过git pull下载更新后,需要编译更改的源文件才能更新可执行文件。这与安装OpenFOAM时所执行的方法相同。只需调用./Allwmake进行编译。该脚本可以识别更改,因此不会再次编译未更改的文件。因此,更新后进行编译所需的时间少于安装OpenFOAM时所需的时间。
4.4.1 工作流程
清单14显示了更新现有OpenFOAM安装所需的命令。但这仅适用于仓库版本(例如OpenFOAM-2.1.x)的更新。点版本(OpenFOAM的版本号中没有x)的更新方式与仓库版本的更新方式不同。为简单起见,可以将Point Release(OpenFOAM-2.1.0→OpenFOAM-2.1.1)的更新视为全新安装,请参见第3.6节。
将清单14中的前两个命令更改为OpenFOAM安装目录。然后,通过调用git pull下载最新的源文件。
wclean all这一句可以省略。但是,如果编译以某些错误结束,则此命令通常可以解决问题,请参见第4.5.2节。最后一条语句会编译源文件。如果以前未调用wclean all,则仅编译发生更改的文件。如果调用了wclean all,则将编译所有内容。这可能将花费更长的时间。
如果有足够的时间进行更新(例如整夜),则应在编译之前调用wclean all。在大多数情况下,这将确保更新源的成功编译。
cd $FOAM_INST_DIR
cd OpenFOAM -2.1. x
git pull
wclean all (可以省略)
./ Allwmake
列表 14: 更新现有的OpenFOAM安装的完整的工作流程
4.4.2 问题排查
如果编译报告了一些错误,则再次调用./Allwmake会很有帮助。这大大减少了成功操作的输出(译者注:成功编译的源文件将不再显示,只会在出错的位置显示错误信息),因此更容易找到编译器的实际错误消息。
4.5 更新问题
4.5.1 缺少安装包
如果对操作系统进行了升级,则可能会发生确实安装包的情况,这意味着在更新过程中已删除了一些相关的软件包(例如,如果需要这些软件包来编译OpenFOAM,但操作系统“认为”这些软件包不是必需的)。因此,如果在操作系统升级后重新编译OpenFOAM失败,则可能是缺少软件包的原因。
4.5.2 库的更新
库更新后,必须重新编译它们。否则,求解器将调用尚未编译的库函数。为了避免此问题,必须重新编译相应的库。
wclean all
列表 15: 使用wclean准备重新编译
一个更暴力的方式是重新编译整个OpenFOAM,而不是重新编译更新的库。
4.5.3 更新的源无法编译
在某些情况下,例如当源文件的组织发生变化时,源文件将无法立即编译。又或者,如果有其他未知原因导致无法编译源代码,则可以选择完全重新编译OpenFOAM。尽管编译OpenFOAM需要花费时间,但与跟踪所有错误相比,这可能花费的时间更少。
要重新编译OpenFOAM,需要重置源。有一个简单的命令可以解决此问题,而不是删除OpenFOAM并重新安装。如列表16所示:
git clean - dfx
列表 16: 使用git重置源
列表16中列出的命令使Git擦除没有跟踪的所有文件。这意味着所有不属于git-repository的文件都将被删除。在这种情况下,将重置为OpenFOAM的官方git仓库版本。git clean从当前目录开始递归删除所有不受版本控制的文件。选项-d表示还删除了未跟踪的文件夹。
执行列表16中的命令后,必须按照3.3节中的说明重新编译源。
4.5.4 自有代码无法运行
更新您的OpenFOAM的仓库版本会产生有趣的效果。当OpenFOAM的库更新时,它们的实现可能会更改。即使更新的代码与先前的代码完全兼容,更新后的编译库看起来也可能不同。因此,即使更新保持了代码的兼容性,更新也可能破坏二进制兼容性。因此,需要在基础OpenFOAM安装更新之后重新编译您自己的代码。
更新OpenFOAM之后加载丢失了二进制兼容性的库时会导致分段错误。发生这种情况是因为我们自己的求解器在启动时会动态加载所需的OpenFOAM库,但是库更新之后该库某些对象的内存布局已更改了。