存储结构方面：MyISAM每个MyISAM在磁盘上存储成三个文件.frm文件存储表定义、数据文件的扩展名为.MYD、索引文件的扩展名是.MYI；InnoDB所有的表都保存在同一个数据文件中，表的大小只受限于操作系统文件的大小，一般为2GB。 存储空间方面：MyISAM可被压缩，存储空间较小。支持三种不同的存储格式：静态表、动态表、压缩表；InnoDB需要更多的内存和存储，它会在主内存中建立其专用的缓冲池用于高速缓冲数据和索引。 事务支持方面：MyISAM强调的是性能，每次查询具有原子性,其执行数度比InnoDB类型更快，但是不提供事务支持；InnoDB提供事务支持事务。 表锁差异方面：MyISAM只支持表级锁；InnoDB支持事务和行级锁。 表主键：MyISAM允许没有任何索引和主键的表存在，索引都是保存行的地址。InnoDB如果没有设定主键或者非空唯一索引，就会自动生成一个6字节的主键。 增删改查操作方面：如果执行大量的SELECT，MyISAM是更好的选择。如果执行大量的INSERT或UPDATE，出于性能方面的考虑，应该使用InnoDB表。 外键方面：MyISAM不支持；InnoDB支持。