生物信息学(bioinformatics)是生命科学与计算机科学、信息科学、数学、统计学、系统科学等多学科相互交融而成的新兴学科。
随着生命科学领域研究范式的变革,生物信息学已经从一门新兴交叉学科,发展成为催生生命科学领域新的研究方向和重大科学发现的重要原动力,也成为各国在生命健康和农业育种等领域竞争的核心焦点。
纵观生物信息学发展50 多年,其发展是非线性的、分阶段的,与之紧密相连的是生命科学和计算机科学的进步。传统生信的研究内容主要包括数据库构建、序列分析比对与基因功能预测、转录因子结合位点预测、进化分析、核糖核酸与蛋白质结构预测、基因调控网络构建等。随着后基因组时代以二代测序(NGS)技术为代表的一系列高通量研究方法的广泛应用,生信的研究重点逐渐转变为大数据解析、整合与可视化等方向。在生信数据分析的助力下,生命科学领域已经产生很多新的研究方向,如表观遗传修饰动态变化、染色质高级结构解析、单细胞检测与谱系分析等。在此基础上,生物信息学也迎来了前所未有的快速发展时期。
为更好地了解生物信息学发展的国际、国内新形势,把握学科发展前沿和基础研究与产业应用的突破口,在中国科学院与国家自然科学基金委员会的支持下,陈润生院士带领我国生物信息学研究领域的多位专家学者,基于长期积累的专业知识,并结合文献调研、信息检索、会议研讨和实地走访等形式,深入了解国内外生物信息学研究的现状与发展趋势等,在此基础上撰写了《中国生物信息学2035发展战略》——“中国学科及前沿领域发展战略研究( 2021—2035)”项目组编.北京 : 科学出版社,2024. 7]。本书的撰写得到贺福初院士、金力院士、康乐院士、李衍达院士、强伯勤院士、杨焕明院士、张春霆院士、赵国屏院士的大力支持与指导!
本书内容涵盖了生物信息学领域的基础资源与共性技术问题,如数据资源与数据库、算法与软硬件、人工智能(AI)与新信息技术、调控网络与生物建模等,组学数据解析、结构生物信息学、生物进化等生物信息学主要研究方向,以及生物信息学在医疗健康、农业、环境、生态、生物安全和空天科学等研究中的应用,分别从发展历史与驱动因素、国内研究基础与国际竞争力、发展态势与重大科技需求、未来5~15年的关键科学与技术问题、发展目标与优先发展方向的角度,对上述问题进行了逐一阐述。
作者:生物信息与育种,请关注同名微信公众号:生物信息与育种。