基因组注释流程

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推荐一款高引超6000次的全基因组/全外显子组变异注释工具

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【基因组注释】ncRNA注释

1. ncRNA 非编码RNA(Non-coding RNA, ncRNA) 包括rRNA，tRNA，snRNA，snoRNA 和microRNA 等不编码蛋白质的RNA，它们转录后直接在RNA 水平上就能行使各自的生物学功能，并不需要翻译成蛋白质。 2. 软件 tRNA注释一般用tRNAscan

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外显子测序，也叫做外显子捕获测序。首先利用序列捕获技术将外显子区域的DNA捕获并富集，然后进行高通量测序。外

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从三大核酸数据库NCBI、Ensembl、UCSC 下载参考序列及注释文件 0.人类基因组版本对应关系 1.NCBI 人类基因组 GRCh38下载（默认）： ftp://ftp.ncbi.nih.gov/genomes/H_sapiens/ GRCh37下载： ftp://ftp.ncbi.nlm.

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简介外显子测序是指利用序列捕获技术将全基因组外显子区域DNA捕捉并富集后进行高通量测序的基因组分析方法。全外显子组测序仅需对全基因组的2%左右的区域进行测序，就能够得到超过95%的已知功能区域的信息，而这些区域涵盖了95%的孟德尔疾病致病突变以及多种疾病易感多态性位点。因此，全外显子组测序已经成为当前疾病相关基因检测的常用方法，广泛应用于寻找复杂疾病的致病基因和易感基因等。下面对外显子组测序数据的

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叶绿体基因组注释 PGA Geseq 叶绿体基因组注释genious

叶绿体基因组分析须要注意的地方（注释篇）上期我们讲了组装问题，在组装完成后，就需要对序列进行注释了，叶绿体基因组的注释通常是经过同源比对注释的，同源注释的软件比较多，针对叶绿体基因组注释的软件也有很多，但是目前还没有一款可以得到完美注释结果的软件，所以学会自己检查注释的正确与否很重要。由于基于的是同源比对，那么参考的选择十分的重要，这里要注意一点，不是已经发表的叶绿体基因组

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