MS氢气建模并转换为lammps data文件
前一次推文给出了氢气压缩模拟(lammps案例:npt系综练手,H2压缩模拟),有同学咨询氢气建模方法,本文简单介绍一下氢气建模步骤:
(1)在MS中新建模型文件,点击添加H原子按钮,在中间工作区连续点击2次,画出H2分子。
(2)使用AC模块建立含有500个氢气分子的模型。
(3)使用discover计算模块分配cvff力场。
需要注意的是MS 8.0以上版本没有discover模块,可使用forcite模块。
(4)添加力场后,导出模型文件为H.car。
(5)使用lammps自带的转换工具,将H.car转换为H.data文件。使用的命令为:
msi2lmp H -class I -frc cvff > data.h
使用本方法也可以进行其它其它气体或者聚合物的建模,更多教程请关注微信公众号:lammps加油站。
备注:本教程纯属学习交流,请支持正版软件。