JSONObject o1 = new JSONObject();
o1.put("key", 1);

JSONObject o2 = new JSONObject();
o2.put("key", 2);

JSONObject o3 = new JSONObject();
o3.put("key", 3);

JSONObject o4 = new JSONObject();
o4.put("key", 4);

JSONArray jsonArray =  new JSONArray();
jsonArray.add(o1);
jsonArray.add(o2);
jsonArray.add(o3);
jsonArray.add(o4);

List<JSONObject> jsonObjectList = new ArrayList<>();
//循环jsonArray中所有的jsonObject,把需要删除的jsonObject都添加进一个List<JSONObject> 保存起来
for (int k=0;k<jsonArray.size();k++){
    JSONObject jsonObject = (JSONObject) jsonArray.get(k);
    //自己根据条件判断是否需要删除,需要删除的jsonObject则添加进jsonObjectList
    jsonObjectList.add(jsonObject);
}

//循环List<JSONObject> 保存的jsonObject,使用remove直接删除jsonObject
for (int l=0;l<jsonObjectList.size();l++){
   jsonArray.remove(jsonObjectList.get(l));
}

System.out.println("删除元素后的jsonArray数据:"+jsonArray);