数据空洞

Hi,我是阿昌,今天学习记录的是关于数据空洞的内容。

数据库占用空间太大,把一个最大的表删掉了一半的数据,怎么表文件的大小还是没变?

一个 InnoDB 表包含两部分,即:

  • 表结构定义
  • 数据

MySQL 8.0 版本以前,表结构是存在以.frm 为后缀的文件里。

MySQL 8.0 版本,则已经允许把表结构定义放在系统数据表中了。

因为表结构定义占用的空间很小,所以主要讨论的是表数据。


一、参数 innodb_file_per_table

表数据既可以存在共享表空间里,也可以是单独的文件。

这个行为是由参数innodb_file_per_table控制的:

  1. 这个参数设置为 OFF 表示的是,表的数据放在系统共享表空间,也就是跟数据字典放在一起;
  2. 这个参数设置为 ON 表示的是,每个 InnoDB 表数据存储在一个以 .ibd 为后缀的文件中。

MySQL 5.6.6 版本开始,它的默认值就是 ON 了。

==建议不论使用 MySQL 的哪个版本,都将这个值设置为 ON。

因为,一个表单独存储为一个文件更容易管理,而且在你不需要这个表的时候,通过 drop table 命令,系统就会直接删除这个文件。

而如果是放在共享表空间中,即使表删掉了,空间也是不会回收的。

所以,将 innodb_file_per_table 设置为 ON,是推荐做法。

在删除整个表的时候,可以使用 drop table 命令回收表空间。

但是,遇到的更多的删除数据的场景是删除某些行,这时就遇到了文章开头的问题:

表中的数据被删除了,但是表空间却没有被回收。


二、数据删除流程

先再来看一下 InnoDB 中一个索引的示意图。

在前面索引(上)和索引(下)中提到过,InnoDB 里的数据都是用 B+ 树的结构组织的。

mysql 空洞数据 数据库空洞率_mysql 空洞数据


假设,要删掉 R4 这个记录,InnoDB 引擎只会把 R4 这个记录标记为删除。

如果之后要再插入一个 ID 在 300 和 600 之间的记录时,可能会复用这个位置。

但是,磁盘文件的大小并不会缩小。

现在,已经知道了 InnoDB 的数据是按页存储的,那么如果我们删掉了一个数据页上的所有记录,会怎么样?

答案是,整个数据页就可以被复用了。但是,数据页的复用跟记录的复用是不同的

记录的复用,只限于符合范围条件的数据。比如上面的这个例子,R4 这条记录被删除后,如果插入一个 ID 是 400 的行,可以直接复用这个空间。但如果插入的是一个 ID 是 800 的行,就不能复用这个位置了。而当整个页从 B+ 树里面摘掉以后,可以复用到任何位置。

以图 1 为例,如果将数据页 page A 上的所有记录删除以后,page A 会被标记为可复用。这时候如果要插入一条 ID=50 的记录需要使用新页的时候,page A 是可以被复用的。如果相邻的两个数据页利用率都很小,系统就会把这两个页上的数据合到其中一个页上,另外一个数据页就被标记为可复用。

进一步地,如果用 delete 命令把整个表的数据删除呢?

结果就是,所有的数据页都会被标记为可复用。但是磁盘上,文件不会变小。

delete 命令其实只是把记录的位置,或者数据页标记为了“可复用”,但磁盘文件的大小是不会变的。

也就是说,通过 delete 命令是不能回收表空间的。这些可以复用,而没有被使用的空间,看起来就像是“空洞”。

实际上,不止是删除数据会造成空洞,插入数据也会。

如果数据是按照索引递增顺序插入的,那么索引是紧凑的。

但如果数据是随机插入的,就可能造成索引的数据页分裂

假设图 1 中 page A 已经满了,这时我要再插入一行数据,会怎样呢?

mysql 空洞数据 数据库空洞率_数据库_02

可以看到,由于 page A 满了,再插入一个 ID 是 550 的数据时,就不得不再申请一个新的页面 page B 来保存数据了。

页分裂完成后,page A 的末尾就留下了空洞(注意:实际上,可能不止 1 个记录的位置是空洞)。

另外,更新索引上的值,可以理解为删除一个旧的值,再插入一个新值。不难理解,这也是会造成空洞的。

也就是说,经过大量增删改的表,都是可能是存在空洞的。

所以,如果能够把这些空洞去掉,就能达到收缩表空间的目的。

而重建表,就可以达到这样的目的。


三、重建表

试想一下,如果现在有一个表 A,需要做空间收缩,为了把表中存在的空洞去掉,可以怎么做呢?

可以新建一个与表 A 结构相同的表 B,然后按照主键 ID 递增的顺序,把数据一行一行地从表 A 里读出来再插入到表 B 中。由于表 B 是新建的表,所以表 A 主键索引上的空洞,在表 B 中就都不存在了。

显然地,表 B 的主键索引更紧凑,数据页的利用率也更高。

如果我们把表 B 作为临时表,数据从表 A 导入表 B 的操作完成后,用表 B 替换 A,从效果上看,就起到了收缩表 A 空间的作用。

这里,你可以使用 alter table A engine=InnoDB 命令来重建表。

在 MySQL 5.5 版本之前,这个命令的执行流程跟我们前面描述的差不多,区别只是这个临时表 B 不需要自己创建,MySQL 会自动完成转存数据、交换表名、删除旧表的操作。

mysql 空洞数据 数据库空洞率_mysql_03

显然,花时间最多的步骤是往临时表插入数据的过程,如果在这个过程中,有新的数据要写入到表 A 的话,就会造成数据丢失。

因此,在整个 DDL 过程中,表 A 中不能有更新。

也就是说,这个 DDL 不是 Online 的。

而在 MySQL 5.6 版本开始引入的 Online DDL,对这个操作流程做了优化。


重建表的流程:

  1. 建立一个临时文件,扫描表 A 主键的所有数据页;
  2. 用数据页中表 A 的记录生成 B+ 树,存储到临时文件中;
  3. 生成临时文件的过程中,将所有对 A 的操作记录在一个日志文件(row log)中,对应的是图中 state2 的状态;
  4. 临时文件生成后,将日志文件中的操作应用到临时文件,得到一个逻辑数据上与表 A 相同的数据文件,对应的就是图中 state3 的状态;
  5. 用临时文件替换表 A 的数据文件。

mysql 空洞数据 数据库空洞率_mysql_04

可以看到,与图 3 过程的不同之处在于,由于日志文件记录和重放操作这个功能的存在,这个方案在重建表的过程中,允许对表 A 做增删改操作。

这也就是 Online DDL 名字的来源。


DDL 之前是要拿 MDL 写锁的,这样还能叫 Online DDL 吗?确实,图 4 的流程中,alter 语句在启动的时候需要获取 MDL 写锁,但是这个写锁在真正拷贝数据之前就退化成读锁了。为什么要退化呢?

为了实现 Online,MDL 读锁不会阻塞增删改操作。那为什么不干脆直接解锁呢?

为了保护自己,禁止其他线程对这个表同时做 DDL。而对于一个大表来说,Online DDL 最耗时的过程就是拷贝数据到临时表的过程,这个步骤的执行期间可以接受增删改操作。

所以,相对于整个 DDL 过程来说,锁的时间非常短。对业务来说,就可以认为是 Online 的。

需要补充说明的是,上述的这些重建方法都会扫描原表数据和构建临时文件。

对于很大的表来说,这个操作是很消耗 IO 和 CPU 资源的。

因此,如果是线上服务,你要很小心地控制操作时间。

如果想要比较安全的操作的话,推荐你使用 GitHub 开源的 gh-ost 来做。


四、Online 和 inplace

说到 Online,还要再和你澄清一下它和另一个跟 DDL 有关的、容易混淆的概念 inplace 的区别。

在图 3 中,把表 A 中的数据导出来的存放位置叫作 tmp_table。这是一个临时表,是在 server 层创建的。

在图 4 中,根据表 A 重建出来的数据是放在“tmp_file”里的,这个临时文件是 InnoDB 在内部创建出来的。

整个 DDL 过程都在 InnoDB 内部完成。对于 server 层来说,没有把数据挪动到临时表,是一个“原地”操作,这就是“inplace”名称的来源。所以,我现在问你,如果你有一个 1TB 的表,现在磁盘间是 1.2TB,能不能做一个 inplace 的 DDL 呢?答案是不能。

因为,tmp_file 也是要占用临时空间的。

重建表的这个语句 alter table t engine=InnoDB,其实隐含的意思是:

alter table t engine=innodb,ALGORITHM=inplace;

跟 inplace 对应的就是拷贝表的方式了,用法是:

alter table t engine=innodb,ALGORITHM=copy;

当你使用 ALGORITHM=copy 的时候,表示的是强制拷贝表,对应的流程就是图 3 的操作过程。但我这样说可能会觉得,inplace 跟 Online 是不是就是一个意思?

其实不是的,只是在重建表这个逻辑中刚好是这样而已。

比如,如果要给 InnoDB 表的一个字段加全文索引,写法是:

alter table t add FULLTEXT(field_name);

这个过程是 inplace 的,但会阻塞增删改操作,是非 Online 的。如果说这两个逻辑之间的关系是什么的话,可以概括为:

  1. DDL 过程如果是 Online 的,就一定是 inplace 的;
  2. 反过来未必,也就是说 inplace 的 DDL,有可能不是 Online 的。截止到 MySQL 8.0,添加全文索引(FULLTEXT index)和空间索引 (SPATIAL index) 就属于这种情况。

使用 optimize table、analyze table 和 alter table 这三种方式重建表的区别。

  • 从 MySQL 5.6 版本开始,alter table t engine = InnoDB(也就是 recreate)默认的就是上面图 4 的流程了;
  • analyze table t 其实不是重建表,只是对表的索引信息做重新统计,没有修改数据,这个过程中加了 MDL 读锁;
  • optimize table t 等于 recreate+analyze。

五、总结

现在你已经知道了,如果要收缩一个表,只是 delete 掉表里面不用的数据的话,表文件的大小是不会变的,还要通过 alter table 命令重建表,才能达到表文件变小的目的。重建表的两种实现方式,Online DDL 的方式是可以考虑在业务低峰期使用的,而 MySQL 5.5 及之前的版本,这个命令是会阻塞 DML 的,这个你需要特别小心。


假设现在有人碰到了一个“想要收缩表空间,结果适得其反”的情况,看上去是这样的:

  1. 一个表 t 文件大小为 1TB;
  2. 对这个表执行 alter table t engine=InnoDB;
  3. 发现执行完成后,空间不仅没变小,还稍微大了一点儿,比如变成了 1.01TB。

觉得可能是什么原因呢 ?

1、这个表已经重建过了,没啥空洞,现在在重建,innodb会给数据页一些预留空间,导致文件变大
2、表重建过程中,有大量更新,又产生了空洞