更多代码请见:https://github.com/xubo245
基因数据处理系列
1.解释
SSW是一个更快的SW算法,并且提供了c语言lib和java的调用
代码:
论文:
2.代码:
3.结果:
遇到的问题:
原因:
-Djava.library.path 应该放在-jar前面
参考
更多代码请见:https://github.com/xubo245
基因数据处理系列
SSW是一个更快的SW算法,并且提供了c语言lib和java的调用
代码:
论文:
遇到的问题:
原因:
-Djava.library.path 应该放在-jar前面
参考
更多代码请见:https://github.com/xubo245基因数据处理系列1.解释测试自带Example
更多代码请见:https://github.com/xubo245基因数据处理系列1.解释先有java提供转换
需要注意的是如果使用avocado的命令行,fs和fq为hdfs路径,properties为本地路径:had
1.最大问题: 老报错的问题:hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/GRCH38Su
1.数据下载: avocaodo的test resource中2.预处理: cat Homo_sapiens_assembly19.fast
基因数据处理25之avocado安装下载:git clone https://github.com/bigdatagenom
更多代码请见:https://githu
基因数据处理6之BWA_MEM运行太长hadoop@Master:~/cloud/adam/xubo/data/te
更多代码请见:https://github.com/xubo245基因数据处理系列1.解释由于要生成新的score m
基因数据处理9之BWA处理速度太慢:hadoop@Mcnode1:~/clo
1.解决思路:正如基因数据处理91之disease的vcf2omim和dataProcessing的数据对不上描述
更多代码请见:https://github.com/xubo245基因数据处理系列1.解释SSW的评分矩阵是
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