IBM全球网格大同盟(World Community Grid)和科学家们正在开展一项全球性的研究项目,旨在找出对抗寨卡病毒(Zika Virus)的候选药物。寨卡病毒是一种快速传播的病毒,世界卫生组织已经宣布将其列为全球紧急公共健康事件。


IBM和一个全球性的科学家团队邀请每个拥有电脑和安卓设备的人加入OpenZika项目。志愿者不需要投入时间、专业知识或金钱即可提供帮助;他们只需要在Windows、Mac、Linux或安卓设备上运行一个APP,在机器处于空闲状态时,该应用能够自动为科学家执行虚拟实验。


通过OpenZika项目,全球网格大同盟将驱动为对抗寨卡病毒(这种病毒与严重的神经紊乱有关)而开展的化合物虚拟实验,这种化合物是对抗寨卡病毒的药物的关键成分之一。由于比传统实验室的研究速度快得多,这个项目将针对寨卡病毒蛋白质和晶体结构模型从现有分子数据库中筛选化合物。筛选结果将与研究社区和普通公众快速分享。然后,最有可能的化合物会最终在合作方的实验室中进行测试。


对于OpenZika项目,全球网格大同盟正与位于巴西的Federal University of Goiás (戈亚斯联邦大学) 领导的全球研究人员团队合作,并由巴西的Oswaldo Cruz Foundation (Fiocruz); Rutgers University's New Jersey Medical School (罗格斯大学新泽西医学院);Collaborations Pharmaceuticals公司和Pharmaceutical Sciences at the University of California San Diego(加州大学圣迭戈分校药学院)提供支持。


巴西戈亚斯联邦大学讲授和OpenZika首席研究员Carolina H. Andrade博士说:“在全球网格联盟的志愿者的帮助下,我们在最初阶段便可计算和评估超过2,000万种化合物,并且未来若干阶段有可能达到9,000万种。在全球网格大同盟上运行OpenZika项目能够使我们快速扩展项目的规模,而这会加快我们获得对抗寨卡病毒药物研究的成果



北美气候的逐渐变暖将更有利于携带了寨卡病毒的蚊子——这种全球“旅行者”——滋生、感染并传播病毒,这使得针对该病毒的治疗变得更加迫在眉睫。

 

与此同时,其他抗病毒研究工作也给人们带来了新的希望。例如,IBM研究院和新加坡生物工程与纳米科技研究院宣布,他们已经发现了一种有助于阻断致命性病毒(寨卡病毒)感染的大分子。IBM也为控制其他疫情的爆发(如埃博拉病毒)提供了专业知识和资源。比如,IBM的全球网格大同盟也推出了埃博拉研究项目。


此外,IBM还帮助政府机构追踪疫情爆发状态。公司在塞拉利昂提供了一种公众交互和分析系统,帮助受埃博拉影响的社区直接与政府沟通相关问题。为了应对这种紧急公共健康问题的发生,IBM研究院还创建了基于专家意见的“热点地图”,该地图将公众舆情与报告的爆发地点关联了起来。此外,IBM科学家还开发了一个免费的开源工具,帮助科学家和公共健康专员创建、使用并研究新发传染病的地理和即时模型,例如
寨卡病毒。


作为公司专注于为社会问题提供创新解决方案的市民计划的一部分,IBM在2004年创建了全球网格大同盟,其中部分是基于IBM的SoftLayer云技术,同时通过利用志愿者电脑或安卓设备空闲的计算能力,从而为科学家免费提供巨量的超级计算能力。在过去11年间,80个国家中近75万人和470家机构使用超过三百万台电脑和移动设备,已经为全球网格大同盟二十多个至关重要的项目贡献了虚拟的超级计算能力,总价值超过5亿美元。


全球网格大同盟已帮助研究人员找到新型的儿童×××潜在治疗药物,发现了更高效的太阳能电池的新材料,还帮助发现了纳米技术如何更有效地实现水资源过滤处理。如果没有IBM全球网格大同盟提供的免费超级计算能力,可能许多科研项目可能无法展开。

为了开展这些计算实验,OpenZika研究人员使用了斯克里普斯研究所 (Scripps Research Institute) 欧森实验室开发的AutoDock VINA,这是一种广泛应用的虚拟筛选工具。从核心来看讲,全球网格大同盟是基于伯克利开放式网络计算平台 (BOINC) 而实现的。该开源平台是加州大学伯克利分校在美国国家科学基金会的支持下开发的。