Here are the steps to disable “Open in Windows Explorer” for everyone except site Owners.
On your SharePoint server go to the following folder and make a copy of the DefaultTemplates.ascx file. \Common Files\Microsoft Shared\Web Server Extensions\12\TEMPLATE\CONTROLTEMPLATES
Rename the copy of DefaultTemplates.ascx to CustomDefalutTemplates.ascx
Open CustomDefaultTemplates.ascx in Notepad and change the following line:
ID=”OpenInExplorer” Change PermissionString=”UseClientIntegration” to PermissionString=”MangeWeb”
Save the file
Reset IIS