WDL（Workflow Description Language）Broad Institute推出，描述流程。 解决的核心问题：复杂问题的执行和资源管理。将更多精力放在如何实现功能（如比对、处理、绘图等 ），而作业运行（执行顺序、软件版本记录等）交给WDL。 语法定义参考Python。 版本：d
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2022-05-31 23:00:08
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变量 WDL的变量不同于一般语言变量，应该叫“占位符”——一旦赋值之后，不能在后续运行中变化 “
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2022-06-01 10:58:30
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内置函数主要分为三大类： 输入输出：stdout, stderr,read_tsv 信息获取类：defined, glob, basename,
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2022-06-01 11:00:14
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WDL语言基本概念 两级结构：workflow, task runtime：镜像，memory等 output可以没有，如重命名
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2022-06-01 11:01:18
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WDL开发工具IDE介绍 vim-wdl插件：https://github.com/broadinstitute/vim-wdl Vscode插件：推荐 语法校验：WOMtool https://cromwell.readthedocs.io/en/stable/WOMtool/ 脚本实践 应用示例
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2022-09-01 09:56:29
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在`GATK4`的`best practice`中，不再像以前那样给出每个步骤对应的代码，而是直接给出了官方
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2022-06-21 05:40:12
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WDL可以使用本地、集群、云端三种模式来跑流程，本地运行是不需要服务器后台配置文件，而
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2022-06-01 10:58:12
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功能 使用BWA + GATK进行变异检测的最佳实践流程，且优化为按染色体切分，并行进行变异检测和BQS
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2022-06-01 11:00:55
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功能 输入（Pair End）测序序列文件，利用fastp进行QC和质量过滤（包括质量QC统计，Adapte
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2022-06-01 10:58:48
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简介TensorFlow是Google研发的第二代人工智能学习系统，能够处理多种深度学习算法模型，以功能强大和高可扩展性而著称。TensorFlow完全开源，所以很多公司都在使用，但是美团点评在使用分布式TensorFlow训练WDL模型时，发现训练速度很慢，难以满足业务需求。经过对TensorFlow框架和Hadoop的分析定位，发现在数据输入、集群网络和计算内存分配等层面出现性能瓶颈。...
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2021-05-12 09:21:04
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给一起学习基因组云计算的小伙伴推荐一本书，《Genomics in the Cloud：Using Docker, GATK, and WDL in Terra》，作者是GATK社区管理员，2020年出版
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2022-09-01 09:57:19
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介 绍推荐系统（RSs）已经在工业界流行了十来年，在过去五年里，基于深度学习的方法在工业界得到了广泛应用，例如，Google 的 wide & deep 模型和 Airbnb 的《Real-time personalization using embeddings for search ranking》。在阿里电商平台，RSs 已经成为 GMV 和收入的关键引擎，并在丰富的电子商务场
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2021-03-31 19:05:32
361阅读
package com.wdl.day09;/** * @创建人 wdl * @创建时间 2021/8/12 * @描述 */public class ArrayPrintTest { public static void main(String[] args) { int[] arr =new int[]{1, 2, 3};
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2022-01-19 10:17:04
126阅读
package com.wdl.day07;/** * @创建人 wdl * @创建时间 2021/8/8 * @描述 */public class YangHuiTest { public static void main(String[] args) { int[][] yanghui = new int[10][];
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2022-02-09 10:41:04
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package com.wdl.day07;import java.util.Arrays;/** * @创建人 wdl * @创建时间 2021/8/9 * @描述 */public class BubbleSortTest { public static void main(String[] args) {
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2022-02-09 17:11:10
56阅读
package com.wdl.day09;/** * @创建人 wdl * @创建时间 2021/8/12 * @描述 */public class ArrayPrintTest { public static void main(String[] args) { int[] arr =new int[]{1, 2, 3}; System.out.println(arr);//地址值 char[] arr1 = {'a', 'b','
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2021-08-15 13:47:07
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一、简介 Wide & Deep Learning （以下简称 WDL）是解决点击率预估（CTR Prediction）问题比较重要的模型。WDL 在训练时，也面临着点击率预估领域存
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2021-06-13 21:31:16
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package com.wdl.day07;import java.util.Arrays;/** * @创建人 wdl * @创建时间 2021/8/9 * @描述 */public class BubbleSortTest { public static void main(String[] args) { int[] arr = {4, 0, 2, 5, 4, 8, 7, 8, -2, -9, 66}; for (int i = 0; i &l
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2021-08-10 11:07:09
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