https://cran.r-project.org/web/packages/poppr/vignettes/poppr_manual.htm...
原创
2022-03-18 10:57:17
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REFhttps://www.biostars.org/p/389208/https://github.com/YuLab-SMU/clusterProfiler/issues/155https://cran.r-project.org/web/packages/enrichR/vignettes/enrichR.htmlhttps://bioconductor.riken.jp/pa
原创
2023-11-02 11:30:03
123阅读
其实在Seurat v3官方网站的Vignettes中就曾见过该算法,但并没有太多关注,直到看
原创
2023-05-02 21:54:19
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Booting OpenBSD on a Flash Cardhttp://www.aetherwide.com/vignettes/20070604-1.html4 June 2007In building a pair of OpenBSD firewalls, I wanted to minimize points of failure. Hard drives are one of th
原创
2009-08-06 11:17:00
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maftools是一个R包,发布在bioconductor上,专门用于MAF文件中信息的可视化,链接如下https://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/maftools/inst/doc/maftools.html提供了非常多的可视化方案,用法也比较简便,首先读取MAF文件,代码如下> library(maftool
原创
2022-06-21 10:06:11
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pafr包的参考链接https://cran.r-project.org/web/packages/pafr/vignettes/Introduction_to_pafr.html首先用minimap2比对两个基因组这里我用NCBI下载的两个拟南芥基因组做演示下载两个基因组wget https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/genomes/all/GCF/000/001/7
原创
2022-03-28 10:23:09
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ComplexHeatmap其实是一个很全面的R包,它除了可以绘制简单热图还有其他复杂实用的热图,这里主要简单的介绍一下如何用这个R包来绘制简单热图 1. 首先按照http://bioconductor.org/packages/release/bioc/vignettes/ComplexHeatmap/inst/doc/s2.single_heatmap.html 创建一个测试数据
librar
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2023-12-19 13:59:17
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在之前的文章中,我们分享了多个基因差异分析的可视化,使用的是ggpubr这个R包,ggpubr在标记p值时,可以根据指定的差异分组自动添加组间的连线,非常方便,但是无法指定添加的p值的位置,在某些时候会缺乏灵活性,今天要介绍的是另外一个R包ggsignif,其帮助手册链接如下https://cran.r-project.org/web/packages/ggsignif/vignettes/i
原创
2022-11-30 12:45:49
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