# Python库BLAST：生物信息学中的序列比对工具
在生物信息学领域，序列比对是分析生物序列（如DNA、RNA或蛋白质）之间相似性的基本方法。BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是最常用的序列比对工具之一，它可以通过高效的算法在大规模数据集中寻找相似序列。为了简化使用BLAST的过程，Python社区开发了一些接口库，使用户能够通过简单的Pyth
原创
2024-08-18 04:11:45
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# Python BLAST算法
## 引言
BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）算法是一种非常常用的生物信息学工具，用于在大规模数据库中搜索与查询序列相似的序列。它是基于局部比对的算法，可以高效地找到相似性较高的序列。
本文将介绍BLAST算法的原理及其在Python中的实现。我们将使用NCBI提供的BLAST+软件，并使用Biopython库来
原创
2024-02-02 04:09:41
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# Python中的blast比对
## 什么是blast比对？
blast比对（Basic Local Alignment Search Tool）是一种用于在数据库中查找生物序列相似性的工具。blast比对适用于DNA、RNA和蛋白质序列的比对，可用于识别两个序列之间的相似性和同源性。它是生物信息学中非常重要的一种方法，被广泛应用于基因组学、进化学、蛋白质结构预测等领域。
## 如何使用
原创
2023-12-12 07:57:01
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# 如何利用Python实现BLAST结果分析
BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一种生物信息学工具，用于比较生物序列以发现相似性。当你获得BLAST的结果后，如何在Python中解析这些结果并从中提取有用的信息是生物信息学中的一个重要任务。本文将为你详细介绍如何使用Python分析BLAST结果。
## 整体流程概览
在开始之前，我们先来梳理
原创
2024-10-20 06:54:17
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# Python BLAST距离
## 引言
在生物信息学中，BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一种常用的序列比对算法，用于比较两个生物序列的相似性。在BLAST算法中，距离是一个重要的概念。距离可以量化两个序列之间的相似程度，从而确定它们在演化上的关系。
本文将介绍如何使用Python计算序列之间的BLAST距离，并提供相应的代码示例。我们将首
原创
2023-08-21 06:06:01
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# Python Blast 比对实现教程
## 1. 整体流程
下表展示了使用Python进行Blast比对的步骤和对应的代码：
| 步骤 | 描述 | 代码 |
| --- | --- | --- |
| 1 | 安装Biopython库 | `pip install biopython` |
| 2 | 准备比对序列和数据库 | - |
| 3 | 执行Blast比对 | `resul
原创
2023-12-10 11:39:28
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文章目录下载检查blast是否添加至环境路径使用blast合并fasta文件检查重名blast建库blast检索目标序列输出结果提取序列 下载通过NCBI FTP下载本地blast软件：https://ftp.ncbi.nlm.nih.gov/blast/executables/blast+/LATEST/ 对于Windows用户，直接下载exe可执行文件即可： 然后按照正常软件安装程序安装即可，
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2023-10-24 09:05:35
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1 兼职费用足够学费+生活费恰巧上学期间接过一些外包，恩，足够我的学费以及生活费，以及xx各种费用。主要干过以下几种：游戏外挂： 主要开发工具 为按键精灵，赚的不多，但是属于持续性收入，基本上可以覆盖整个游戏的生命周期，但随着监管力度增大，风险越来越高，本人已经退出这个行业。开发网站： 大学期间主要是WordPress还有Django撸了几个小站，搞搞前端基本就能过关，大概每个站能赚3-5千，投入
代码如下:
class Account(object):
account_type="Basic"
def __init__(self,name,balance):
"初始化一个新的Account实例"
self.name=name
self.balance=balance
def deposit(self,amt):
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2023-10-07 17:10:14
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Blast结果的详细解析 Posted on
2009 年 7 月 9 日
要使用程序对blast结果进行解析、分析，就必须对BLAST的结果形式有深入的了解，本篇文章将向你详细说明Blast结果的数据结构，供参考。这里的指的是blast默认的结果，也是我们应用最多的结果。 3.14.1. 结果文件的结构 一个BLAST的结果文件，大致结构如下： 每个blast结果文件都以
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2023-09-05 10:45:46
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自己实现了一个自动打卡的脚本文件，记录一下过程编写脚本的流程1.编写脚本
2.将脚本设置为定时启动
其实自己用的话，就是这两步，但是我后面多做了两件事
3.电脑设置定时提醒
4.将脚本打包成exe可执行文件编写脚本可凭本事吧！将脚本设置为定时启动定时启动任务可以在windows的任务计划程序添加要注意的是，如果程序只能在pycharm环境下运行，window执行任务时会失败的；因此要在cmd命令提
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2023-06-06 10:00:03
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前言最近在玩儿公主连结，之前也玩儿过阴阳师这样的游戏，这样的游戏都会有个初始号这样的东西，或者说是可以肝的东西。当然，作为一名程序员，肝这种东西完全可以用写代码的方式帮我们自动完成。游戏脚本其实并不高深，最简单的体验方法就是下载一个Airtest了，直接截几个图片，写几层代码，就可以按照自己的逻辑玩儿游戏了。当然，本篇文章不是要讲Airtest这个怎么用，而是用原始的python+opencv来实
一、列表1、idle使用（Mac）（1）代码自动补全 tab（2）回退代码语句 control+p 上一个代码 control+n 下一个代码2、列表就像是数组 列表是完备的python集合对象 且python的变量标识符没有类型。1 >>> movies = ["The Holy Grail","The life of brian"]
2 &g
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2024-03-11 16:16:43
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1. Blast （1）格式化数据库 主要参数： i 输入需要格式化的源数据库名称 p 文件类型，是核苷酸序列数据库（F nucleo
原创
2022-06-01 10:43:36
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## Python写脚本：实现自动化任务的利器
在当今数字化的时代，自动化已经成为一种趋势，能够提高效率并减少人为错误。而Python作为一种简单易学的编程语言，成为了自动化任务的首选工具之一。本文将介绍Python脚本的基本概念，并通过实例展示如何利用Python编写脚本来完成各种自动化任务。
### 什么是脚本？
脚本是一种由计算机程序编写的简单命令序列，用于执行一系列特定的任务。相比于
原创
2023-09-02 15:17:10
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python历史:于1989年开发完成，1991年发布第一个版本创始人： Guido van Rossum(荷兰人) python的特点：解释性：python是一种解释性语言，计算机直接运行.py脚本，在运行的时候将每个语句翻译成为cpu能过识别的机器码。 易于学习:关键字少，不需要大量的记忆。 可移植：能够较好的将python源代码跨平台在unix,linux,wi
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2023-08-11 07:45:53
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# 使用Python实现BLAST序列比对的指南
在生物信息学领域，BLAST（Basic Local Alignment Search Tool）是一种广泛使用的算法，用于比较生物序列。本文将为刚入行的小白开发者提供一个全面的指南，教会你如何使用Python实现BLAST序列比对的功能。我们将从整个流程开始，以及每一步所需的相关代码和解释。
## 流程概述
以下是实现BLAST序列比对的基
原创
2024-09-07 04:19:22
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好多朋友在入门python的时候都是以爬虫入手，而网络爬虫是近几年比较流行的概念，特别是在大数据分析热门起来以后，学习网络爬虫的人越来越多，哦对，现在叫数据挖掘了！其实，一般的爬虫具有2个功能：取数据和存数据！好像说了句废话。。。而从这2个功能拓展，需要的知识就很多了：请求数据、反爬处理、页面解析、内容匹配、绕过验证码、保持登录以及数据库等等相关知识，今天我们就来说说做一个简单的爬虫，一般需要的步
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2024-08-10 16:02:12
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之前电脑系统崩了，重装之后就直接安装Anaconda来使用Python语言(装的时候记得把添加路径勾上，不想装Anaconda可参考之前的Python环境搭建)，咱们还是先用Sublime来写脚本吧。在Sublime上使用Anaconda里的Python需要先配置插件，这个有百度经验，大概步骤如下：ctrl+shift+p-->打开Package Control输入ip--)选择Packag
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2023-08-20 09:03:09
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本文介绍怎样用Python写游戏辅助脚本主要实现方式是通过图片的对比，在游戏中就行点击。运行程序需要以下东西。PIL： 图片处理模块 （python3 换成了 pillow） 下载地址： https://www.lfd.uci.edu/~gohlke/pythonlibs/pywin32 ： 用来模拟点击用的 &n
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2023-05-24 21:35:12
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