在Linux系统上安装LAMMPS是一个常见的需求，LAMMPS是一款用于分子动力学模拟的开源软件包。通过使用LAMMPS，用户可以模拟原子、分子和离子等粒子系统的动力学行为，以及研究材料、生物分子、聚合物等系统的性质。本文将介绍如何在Linux系统上安装LAMMPS。
首先，为了在Linux系统上安装LAMMPS，您需要确保已经安装了必要的编译工具和依赖项。常用的编译工具包括gcc、g++、m
原创
2024-04-02 09:48:35
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在Linux系统下进行LAMMPS并行安装是一个比较常见的任务，这是因为LAMMPS是一个用于分子动力学模拟的开源软件，而在大规模计算中通常需要并行运行来提高性能。在本文中，我们将介绍如何在Linux系统下安装LAMMPS并行版本。
首先，为了进行LAMMPS并行安装，你需要确保系统中已经安装了MPI（Message Passing Interface）。MPI是一种用于实现并行计算的通信协议，
原创
2024-05-30 10:45:03
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1. 辅助软件的安装(1) 所需软件包与安装准备下载地址可以到各个软件的官网上下载，也可以到百度云盘下载：https://pan.baidu.com/s/1bozAghT，注意：在安装时一定要手敲，千万不要复制粘贴，否者会有报错哟。apr-1.5.2.tar.gzapr-util-1.5.4.tar.gzcurl-7.52.1.tar.gz
完整配置CentOS6安装LAMP（Apache/MySQL/PHP）环境搭建教程作者：老左 2014-08-05 05:38博友热度 19,530 ℃ - 1条评论标签：CentOS LAMP, LAMP, LAMP环境搭建 (2 votes, average: 3.00 out of 5) 在很早的时候老左博客也分享过"LAMP一键安装包"的教程方法，但是有些时候
1.重要提示： 在本教程中使用的主机名为server1.example.com，IP 地址为 192.168.0.100 。这些设置会与具体安装的设置有所不同，所以你必须在你的安装过程中进行替代。 2.安装MySQL 5.0 打开终端，输入： yum install mysql mysql-server 然后为MySQL创建系统启动链接(这样在系统启动时，MySQL会自动启动)，
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2024-05-06 13:05:23
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Lammps支持的平台很多，可在windows、linux、Mac上运行。我平时用的lammps版本有两种：windows版和linux版，台式机和笔记本上安装的是windows串行版，主要用来写in文件和简单测试，如果代码没有问题就传到服务器，用linux并行版进行运算。Windows版和linux版的安装视频网上到处都能找到，不再详述，本文主要介绍lammps在苹果笔记本Macbook air
原创
2022-01-06 17:04:19
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Lammps支持的平台很多，可在windows、linux、Mac上运行。我平时用的lammps版本有两种：windows版和ubuntu版，台式机和笔记本上安装的是windows串行版，主要用来写in文件和简单测试，如果代码没有问题就传到服务器，用ubuntu并行版进行运算。Windows版和linux版的安装视频网上到处都能找到
原创
2022-04-29 15:26:31
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LAMMPS安装教程Tips：安装过程不难，细心仔细，遇到问题百度会帮你-----------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------------一.32位库环境配置打开Cen
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2024-04-25 22:52:41
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今天第一次在服务器上面玩Linux，因为Hyper-v的服务器，需要在虚拟机上面安装一个集成服务（类似于vmware的vmware tools），所以第一次去挂载与卸载。 挂载 很简单，摘抄一段挂接命令(mount) 首先，介绍一下挂接(mount)命令的使用方法，mount命令参数非常多，这里主要讲一下今天我们要用到的。 命令格式： m
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2024-05-04 18:43:54
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Caffe是一个清晰而高效的深度学习框架，其作者是博士毕业于UC Berkeley的贾扬清。Caffe是纯粹的C++/CUDA架构，支持命令行、Python和MATLAB接口；可以在CPU和GPU直接无缝切换。我在MacbookPro（无NVIDIA显卡）上大费周章地配置了Caffe的环境，并花了许多时间配置其python接口。一、下载Caffe github上的下载地址：https
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2024-01-09 16:33:16
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LAMMPS学习总结11、手册中说，Compute temp/region与执行温度调节的fix（fix nve/fix langevin等）命令一起使用，那么这个偏差将从每个原子中减去，剩余的热速度的温度调节将被执行，并且偏差将被添加回去。这是什么意思？？？？2、NEMD计算热导率的langvin控温法中，为什么两次langevin控温呢？而且第一次的fix 没有unfix就直接又fix了 这
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2024-04-25 18:07:33
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初始模型构建对于初始模型构建这一部分，大家可以各显神通，会编程的可以自己编程建模，不会编程的可以利用建模软件进行建模，例如用的最多的Materials Studio (MS)(虽然这是个收费软件，但是其中建模工具是免费的，相关教程百度很多)，将MS得到的模型文件导入OVITO软件，再利用OVITO软件可以导出LAMMPS软件可读的格式(简化版)：其中491为总原子数，2 为原子种类数目，xlo=0
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2024-06-07 18:04:39
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大家都清楚，在用lammps进行模拟计算前，建模这个步骤是必不少的。总的来讲，我们可以通过两种方法来完成建模操作。一是通过lammps的命令建模；二是通过外部的程序建模，然后用lammps的read_data 命令将模型读入。lammps命令建模的主要步骤可以描述为：用units 命令定义单位lattice 命令定义单胞region以及create_box命令定义区域和创建盒子create_ato
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2024-05-03 11:30:42
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#--------------------初始化（模拟基本信息介绍）--------------------
units metal #单位制，不同材料体系的单位如：质量，温度，时间
#在模拟之前应该确定是什么材料体系，金属metal，石墨烯或高分子等
dimension 3 #维度，设置模拟的维度，2代表二维如石墨烯；
boundary p p p #边界条件，p代表周期性，f固定边界,
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2024-03-15 12:04:31
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region命令用于定义一个空间几何区域。使用语法region ID style args keyword arg … ID = 待定义区域的ID style = delete / block / cone / cylinder / plane / prism / sphere / union / intersect delete = no args block args = xlo xhi yl
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2024-07-30 13:47:13
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LAMMPS学习总结41、聚合物驰豫平衡的技巧2、分子动力学时间尺度理解3、minimize或run命令就会出现错误：Atom sorting has bin size = 0.0原因4、MS的car文件转出的data自带的力场参数对应lammps什么单位？5、已经转换为标准格式的XYZ文件导入ISAACS中报错，提示格式错误，怎么回事？6、fix deform拉伸命令理解7、报错ERROR:
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2024-10-18 21:19:10
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一、LAMP概述二、安装与配置LAMP三、深入理解LAMP(yum)四、Xcache五、php-fpm一、LAMP概述LAMP: A:apache,M:mysql/Mariadb,P:php/perl/python httpd:接受用户的所有请求{动态/静态}；静态直接响应，动态资源为php脚本,对此类资源的请求，交给php来
一.什么是LAMP？LAMP环境是(Linux+Apache+ MySQL+PHP)一个缩写，是一组常用于来搭建动态网站或者服务器的开源软件，同时接触最多的还有LNMP(Linux+Nginx+ MySQL+PHP)环境架构，与它不同的是，一个是用阿帕奇作为网页服务，一个是用Nginx作为网页服务。这两个的区别及应用场景在这我就不在过多细说。二.LAMP搭建：（1）. 首先确保linux可以正常访
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2024-02-13 21:46:12
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本文主要是对Ubuntu下安装LAMMPS进行了详细的说明，并使用VMD对计算结果进行了可视化，最后分享了一些分子动力学计算的资源。
注：安装环境：Ubuntu 16.04 LTS，LAMMPS-14May16，MPICH3.2，FFTW3.3.4，VMD1.9.3LAMMPS（Large-scale Atomic/Molecular Massively
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2024-02-01 14:07:26
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文章目录1.列举常用的lammps自带函数2.如何进行应力-应变的计算及绘制应力云图3.如何计算均方位移MSD4.如何计算径向分布函数g(r )以及fix ave/time命令5.在lammps流体模拟中如何计算温度6.如何计算单个原子的体积、位移和总能量7.如何计算原子组的相互作用8.如何绘制温度云图、速度云图 1.列举常用的lammps自带函数1.xcm() 计算原子组中心坐标xcm(gro
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2024-03-18 10:51:48
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