写在前面之前介绍过使用EggNOG-mapper对非模式物种快速完成KEGG注释的推文https://mp.weixin.qq.com/s/kIf6C2u3FID3ZeLtsB4eZQ，不过毕竟EggNOG-mapper是第三方软件，而且注释结果仍然存在一个Gene ID对应多个KO Number的情况，虽然对富集结果影响似乎不会太大，但是影响多少肯定是会有。这里介绍KEGG官方提供的注释工具Ko
通用Mapper — 快速入门>>>上一系列我们介绍完了MybatisPlus的使用>>>接下来我们来介绍一下Mybatis中的最后一个内容–>通用Mapper***作用：替我们生成常用增删改查操作的 SQL 语句。***代码官方发布地址：https://gitee.com/free
https://gitee.com/free/Mapper/wikis/
二代测序的简介 第二代测序（Next-generation sequencing，NGS）又称为高通量测序（High-throughput sequencing），是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序，而二代测序开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序（Sequencing by Synthesis）。二代测序在DNA复制过程中通过捕捉新添加的碱
前 言随着癌症基因组学的进步，突变注释格式(MAF)正在被广泛接受并用于存储检测到的体细胞变异。癌症基因组图谱项目已经对30多种不同的癌症进行了测序，每种癌症的样本量都超过了200个。由体细胞变体组成的结果数据以突变注释格式的形式存储。只要数据是MAF格式，本包试图从TCGA来源或任何内部研究中以有效的方式总结、分析、注释和可视化MAF文件。实例解析1. 软件安装在安装这个软件maftools时，
Python2的字符串有两种：str 和 unicode；Python3的字符串也有两种：str 和 bytes。bytes可以是任何二进制数据，文本/图片/视频/音频等等。str就是文本。str与bytes互转b = b"example" # bytes object s = "example" # str object s2b = bytes(s, encoding = "utf8") # str to bytes s2b = str.encode(s)
原创
2022-03-29 15:29:49
382阅读
注释过程：这一步一般都需要手动去鉴定和校正，当然也可以利用一些软件来校正，运用这类过程的 软件 JIGSAW、 EVidenceModeler (EVM)和 GLEAN (以及后续软件 Evigan) 。 通过估计每一个来源的基因证据误差的类型和频率, 进而选择误差最小的结果 maker在基因组注释上，MAKER算是一个很强大的分析流程。能够识别
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2024-07-23 13:21:25
266阅读
该方法返回字符串中子字符串的索引位置。
str - 语法
str(str1,str2)
str1 - 这是需要搜索的字符串...
原创
2023-12-05 09:21:46
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使用BRAKER2进行基因组注释BRAKER2是一个基因组注释流程，能够组合GeneMark，AUGUSTUS和转录组数据。在使用软件之前，有几点需要注意下尽量提供高质量的基因组。目前随着三代测序价格下降，这一点问题不大。基因组命名应该简单，最好就是">contig1"或">tig000001"基因组需要屏蔽重复序列默认参数通常表现效果就很好，但是也要根据物种来一定要对注释结果进行检查
Python dict str()生成字典的可打印字符串表示。
str(dict) - 语法
str(dict)
dict - 这是字典。
str(d...
原创
2024-03-17 20:11:53
57阅读
parse_str - 语法
void parse_str ( string $str [, array &$arr ] )
它用于将字符串解析为变量
Sr...
原创
2024-03-09 09:10:11
59阅读
str_pad - 语法
str_pad(string,length,pad_string,pad_type)
它用于将字符串填充到新的长度。
Sr.No...
原创
2024-03-09 20:11:44
65阅读
str_split - 语法
array str_split ( string $string [, int $split_length=1 ] )
它用于将字符串转换为...
原创
2024-03-09 22:01:13
93阅读
str_ireplace - 语法
str_ireplace(find,replace,string,count)
它用于将字符替换为其他字符
Sr.No
参...
原创
2024-03-09 19:10:50
81阅读
Python基础教程：str、list
原创
2022-03-24 13:43:12
206阅读
Python字符串方法max()返回字符串字符串的最大字母字符。
max(str) - 语法
max(str)
str - 这是需要返...
原创
2024-03-15 19:13:00
70阅读
Python min()从字符串str返回最小字母字符。
min(str) - 语法
min(str)
str - 这是需要返回最小字母字...
原创
2024-03-15 20:12:23
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最近公司准备做pcb板缺陷检测，首先要用C++解析GerBer文件，我尝试了使用pcb-tools库：https://github.com/curtacircuitos/pcb-tools。完美配置了环境，接下来就是学习一些Kicad制作GerBer文件的规则解析对应Gerber文件。有个问题不太清楚：.GBL文件和.gbl文件是不是一个东西？GERBER FILE 目前常见到的有二种格式 RS-
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2024-04-20 18:20:36
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小谈 JavaScript 的 if 语句写法
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2015-07-17 16:38:00
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a = (
"str1; "
"{}"
).format("str2")
a = ("str1; " "str2")
print(a, type(a))
# (str str) = str
原创
2024-07-10 16:43:42
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字符串是任何计算机语言中最常见的数据类型，python中也不例外，因此熟练掌握字符串是学习python的必备技能。python中字符串三种定义方式str = 'wang'
str = "wang"
str = """wang"""字符串所有方法如下：['capitalize', 'casefold', 'center', 'count', 'encode', 'endswith',
'expand
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2023-05-30 20:57:26
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