前 言随着癌症基因组学的进步，突变注释格式(MAF)正在被广泛接受并用于存储检测到的体细胞变异。癌症基因组图谱项目已经对30多种不同的癌症进行了测序，每种癌症的样本量都超过了200个。由体细胞变体组成的结果数据以突变注释格式的形式存储。只要数据是MAF格式，本包试图从TCGA来源或任何内部研究中以有效的方式总结、分析、注释和可视化MAF文件。实例解析1. 软件安装在安装这个软件maftools时，
注释过程：这一步一般都需要手动去鉴定和校正，当然也可以利用一些软件来校正，运用这类过程的 软件 JIGSAW、 EVidenceModeler (EVM)和 GLEAN (以及后续软件 Evigan) 。 通过估计每一个来源的基因证据误差的类型和频率, 进而选择误差最小的结果 maker在基因组注释上，MAKER算是一个很强大的分析流程。能够识别
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2024-07-23 13:21:25
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二代测序的简介 第二代测序（Next-generation sequencing，NGS）又称为高通量测序（High-throughput sequencing），是基于PCR和基因芯片发展而来的DNA测序技术。我们都知道一代测序为合成终止测序，而二代测序开创性的引入了可逆终止末端，从而实现边合成边测序（Sequencing by Synthesis）。二代测序在DNA复制过程中通过捕捉新添加的碱
通用Mapper — 快速入门>>>上一系列我们介绍完了MybatisPlus的使用>>>接下来我们来介绍一下Mybatis中的最后一个内容–>通用Mapper***作用：替我们生成常用增删改查操作的 SQL 语句。***代码官方发布地址：https://gitee.com/free
https://gitee.com/free/Mapper/wikis/
写在前面之前介绍过使用EggNOG-mapper对非模式物种快速完成KEGG注释的推文https://mp.weixin.qq.com/s/kIf6C2u3FID3ZeLtsB4eZQ，不过毕竟EggNOG-mapper是第三方软件，而且注释结果仍然存在一个Gene ID对应多个KO Number的情况，虽然对富集结果影响似乎不会太大，但是影响多少肯定是会有。这里介绍KEGG官方提供的注释工具Ko
最近公司准备做pcb板缺陷检测，首先要用C++解析GerBer文件，我尝试了使用pcb-tools库：https://github.com/curtacircuitos/pcb-tools。完美配置了环境，接下来就是学习一些Kicad制作GerBer文件的规则解析对应Gerber文件。有个问题不太清楚：.GBL文件和.gbl文件是不是一个东西？GERBER FILE 目前常见到的有二种格式 RS-
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2024-04-20 18:20:36
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使用BRAKER2进行基因组注释BRAKER2是一个基因组注释流程，能够组合GeneMark，AUGUSTUS和转录组数据。在使用软件之前，有几点需要注意下尽量提供高质量的基因组。目前随着三代测序价格下降，这一点问题不大。基因组命名应该简单，最好就是">contig1"或">tig000001"基因组需要屏蔽重复序列默认参数通常表现效果就很好，但是也要根据物种来一定要对注释结果进行检查
1、软件及其特性 第一个写软件的人是Ada（Augusta Ada Lovelace）,在1860年代他尝试为Babbage（Charles Babbage）的机械式计算机写软件。尽管他们的努力失败了，但他们的名字永远载入了计算机发展的史册。 在1950年代，软件伴随着第一台电子计算机的问世诞生了。以写软件为职业的人也开始出现，他们多是经过训练的数学家和电子工程师。1960年代美国大学里...
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2007-12-17 11:23:00
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2017年下半年信息系统项目管理师上午综合知识真题试题：
14、GB/T 8566-2007《信息技术 软件生存周期过程》标准为软件生存周期过程建立了一个公共库框架，其中定义了三类过程，（）不属于CB/T 8566-2007定义的过程类别。
A、主要过程
B、支持过程
C、组织过程
D、工程过程参考答案：D
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2023-11-07 02:30:03
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共享软件：共享软件(Shareware)是以“先使用后付费”的方式销售的享有版权的软件。根据共享软件作者的授权，用户可以从各种渠道免费得到它的拷贝，也可以自由传播它。用户总是可以先使用或试用共享软件，认为满意后再向作者付费；如果你认为它不值得你花钱买，可以停止使用。您可以在本站的注册中心通过各种付款方式(在线付款、银行汇款等)注册您喜爱的软件。免费软件：免费软件(Freeware)是指用户可以无限
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2009-07-17 08:46:55
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关于灰色软件（Grayware）及其危害，你了解多少？. 2019-06-03灰色软件是一个棘手的安全问题。虽然与高频报道的“恶意软件”和“勒索软件”等术语相比，“灰色软件”略显耳生，但事实上，我们每个人都曾跟它有过亲密接触：例如，许多新系统中所提供的不为人熟知的应用程序，或是具备为人熟知的名称但却非官方提供的应用程序。灰色软件是一个棘手的安全问题。虽然与高频报道的“恶意软件”和“勒索软件”等术语
原创
2023-06-02 21:50:40
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软件随想: 软件 = 程序 + 软件工程 最近和几个同道谈论了一些程序，架构，软件的问题，大家身在此山中，绕来绕去，始终没有能有明确清晰的结论。我把一些想法写在这里，供专家指正。几乎所有程序员都知道“程序 ＝ 数据结构＋算法”这句名言。但是在实际的学习和工作中，也有不少人产生了疑问。 例如：1) 我写了二叉树的周游算法实现，在这里，二叉树是数据结构，周游的实现细节是算法。我写的C 程序就
原创
2010-11-27 20:55:00
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# 软件系统架构：IOC软件与OPI软件
在软件开发中，软件系统架构扮演着至关重要的角色。IOC（Inversion of Control）软件和OPI（Open Platform Interface）软件是两种常见的软件架构模式。本文将介绍IOC软件和OPI软件的概念、特点以及代码示例，帮助读者更好地理解这两种软件系统架构。
## IOC软件
IOC软件是一种基于控制反转的软件架构模式。在
原创
2024-06-28 05:40:27
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一、软件测试的目的是在最小的成本和最短的时间内，通过设计良好的测试规程和测试用例，系统地发现不同类别的错误。 二、软件测试的基本原则设计好的测试用例、不可能进行穷举测试、尽早开展测试、重点测试、定期进行检验与修正测试用例，并增加新的测试用例、测试依赖于系统环境、测试用例应该包含合理和不合理的输入条件。 测试过程模型V模型特点：1、对应瀑布模型的变种（自下到上）线性关系 
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2023-07-07 09:02:51
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技能 通用技能上： 1.基本计算机知识（操作系统，数据库，通讯协议原理，熟悉至少一门编程语言） 2.基本软件测试知识（各种测试理论，测试方法论，测试用例编写，缺陷界定标准，软件质量评估） 3.简单项目管理知识 产品、系统认知： 1.熟悉所测产品功能，能够将产品...
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2019-05-04 03:54:00
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NIST随机性测试
美国国家标准与技术研究所提供的测试，一共包括16种测试手段NIST下载与安装环境：Windows 11下载：NIST 官网链接点击download下载安装包Cygwin 官网链接点击setup-x86_64.exe下载安装包安装：NIST下载得到sts-2.1.2的压缩包，直接解压到文件夹。Cygwin下载的setup-x86_64.exe，双击进行安装step 1 点击下一页
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2023-12-20 20:14:17
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名字的可见性如果在程序的某个部分里建立了一个类型的名字，而其他人这个程序的另一个部分里也建立了相同的名字，那么该如何区分这种同名却不同的类型呢，Java中为了个一个类库生成不会与其他名字混淆的名字，Java设计者希望程序员反过来使用自己的Internet域名，这样就能保证这个名字是独一无二的，反转域名后句点用来代表子目录的部分。 运用其他构件如果想在自己的程序中使用已经定义好的类，你需要告诉编译器
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2024-09-18 10:29:31
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Fragment介绍及应用Fragment介绍Fragment应用如何创建Fragment加载Fragment的两种方式静态加载自动生成的Java文档自动生成的xml动态加载FragmentManger介绍add,remove,replace,hideFragment的声明周期 Fragment介绍Fragment是Android3.0后引入的一个新的API，他出现的初衷是为了适应大屏幕的平板电
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2024-06-03 21:43:31
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--可以参考这个BLOG上的文章
http://ixdba.blog.51cto.com/2895551/682555
http://www.doooor.com/forum.php?mod=viewthread&tid=3427
varnish (清漆) 和 squid类似
make web fly!!!
原创
2012-09-12 23:08:22
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目录博客技巧UltraEditEditplusNotepad++Q-Dir关快捷键关闭好压弹窗
原创
2022-03-22 17:39:41
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