就基因家族工作做一简单介绍基本思路数据准备确定好研究的基因家族后(比如:NBS,MADS-box etc.),下面就可以下载相关数据。所研究物种的基因组序列; genome.fa所研究物种蛋白序列;pep.fa所研究物种gff文件目标基因家族的隐马科夫模型or RefSeq 对应基因家族的蛋白序列对应基因组信息可根据发表文章中提供的路径进行下载即可;对于隐马科夫模型可以从Pfam进行下载(比如:
RDD血缘的形成RDD血缘(RDD Lineage),也可以叫:RDD依赖关系图。当我们计算一个RDD时,会依赖一个或多个父RDD的数据,而这些父RDD又会依赖它自身的父RDD,这样RDD之间的依赖关系就形成了一个有向无环图(也叫DAG图),这些依赖关系被记录在一个图中,这就是RDD的血缘(也叫RDD Lineage)。RDD之间的依赖关系是如何产生的呢?其实这些依赖关系的产生是由于对RDD进行的
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2024-04-10 12:58:24
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# Spark血缘关系查看的科普文章
## 引言
在大数据处理的领域,Apache Spark 是一种广泛使用的分布式计算框架。它能够高效地处理大规模数据集,并提供类似于MapReduce的编程模型。对于维护数据的质量和可追踪性,"血缘关系"的概念变得尤为重要。本文将介绍Spark的血缘关系的基本概念,并提供代码示例来展示如何查看数据处理过程中的血缘关系。
## 什么是血缘关系?
血缘关系
1. 背景一个完整的数据生命周期,包含从数据源头的数据采集、计算、加工、转换和展示等多个核心步骤以及到最终的数据销毁、归档的全部流程。我们用一种类似人类社会的血缘关系来描述这种数据之间的流转关系——即数据血缘。数据血缘属于元数据的一部分,能够为数据的溯源、价值评估、质量评估、数据归档、数据标签以及数据热度分析等多个方面提供技术支持和基础数据支撑。通常,大数据任务面临多种异构数据源的接入,执行引擎多
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2024-01-12 09:00:47
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原创
2021-07-02 10:15:12
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原创
2022-01-19 10:53:57
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1 依赖和血缘关系RDD只支持粗粒度转换,即在大量记录上执行的单个操作。将创建RDD的一系列Lineage(血统)记录下来,以便恢复丢失的分区。RDD的Lineage会记录RDD的元数据信息和转换行为,当该RDD的部分分区数据丢失时,它可以根据这些信息来重新运算和恢复丢失的数据分区。(由于RDD中是不记录数据的,为了实现分布式计算中的容错 , RDD必须记录RDD之间的血缘关系)RDD之间的依赖关
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2024-07-18 23:36:14
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血缘关系时间限制: 1 Sec 内存限制: 128 MB题目描述我们正在研究妖怪家族的血缘关系。每个妖怪都有相同数量的基因,但是不同的妖怪的基因可能是不同的。我们希望知道任意给定的两个妖怪之间究竟有多少相同的基因。由于基因数量相当庞大,直接检测是行不通的。但是,我们知道妖怪家族的家谱,所以我们可以根据家谱来估算两个妖怪之间相同基因的数量。 妖怪之间的基因继承关系相当简单:如果妖怪C是妖怪A和B的
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2023-10-11 09:06:30
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随着数据仓库(DW)接入的表和建立的模型增多,元数据管理就变得越来越重要。元数据表血缘关系,俗称“表与表之间的关系”。良好的元数据管理,可以清晰和明确看出每张表和模型之前的关系。在没有工具之前,只能依靠手工维护,一旦脚本发生变化,手工维护遗漏或不及时的话,就会造成关系不准确。通过工具,当表数量上百、上千张的时候,通过分析表与表“血缘关系”,就能清楚知道每张表之间的关系,及时定位和溯源问题。笔者在X
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2023-10-10 21:05:45
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1、明确需求,确定边界在进行血缘系统构建之前,需要进行需求调研,明确血缘系统的主要功能,从而确定血缘系统的最细节点粒度,实体边界范围。例如节点粒度是否需要精确到字段级,或是表级。一般来说,表级粒度血缘可以解决75%左右的痛点需求, 字段级血缘复杂度较表级血缘高出许多,如果部门人数较少,可以考虑只精确到表级粒度血缘。常见的实体节点包括:任务节点、库节点、表节点、字段节点、指标节点、报表节点
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2023-10-16 09:39:52
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# Hive血缘关系简介
在Hive中,血缘关系是指表之间的依赖关系。当我们进行Hive查询时,Hive会根据表之间的血缘关系来构建执行计划。血缘关系不仅告诉Hive如何构建执行计划,还可以用来进行数据质量分析、数据追溯和数据集成等任务。本文将介绍Hive血缘关系的概念、作用以及如何通过代码示例来体现。
## 1. 血缘关系的概念
Hive中的血缘关系是指表与表之间的依赖关系。当我们创建一个
原创
2023-07-17 19:26:09
425阅读
MySQL血缘关系的描述
在数据处理和ETL(提取、转换、加载)过程中,我们常常需追踪数据的来源和去向,也就是所谓的“血缘关系”。血缘关系帮助我们了解数据流动的路径,从而能够高效地管理和调试数据。本文将详细分享如何解决MySQL中的血缘关系问题,包括环境配置、编译过程、参数调优、定制开发、调试技巧以及性能对比。
## 环境配置
首先,我们得为此项目配置一个适合的环境。下面是环境配置的具体步骤
**Python血缘关系:深入探究Python程序中的继承、多态和封装**
*“在Python的世界里,程序元素之间的血缘关系扮演着重要的角色。继承、多态和封装是Python中常见的血缘关系类型。本文将深入探究这些概念,并通过实例代码来说明它们的应用。”*
## 引言
在面向对象编程(Object-Oriented Programming,OOP)中,血缘关系是指一个类从另一个类继承属性和方
原创
2023-11-18 08:48:33
98阅读
# Java 血缘关系:探索代码之间的联系
在复杂的软件开发中,理解代码之间的关系是至关重要的。尤其是在使用 Java 这门编程语言时,我们常常需要追踪类和方法之间的调用关系,以增强代码的可维护性和可读性。本文将通过具体的概念和代码示例来探讨 Java 血缘关系,帮助开发者更好地理解代码层面的依赖与耦合。
## 什么是 Java 血缘关系?
Java 血缘关系通常指的是代码元素(如类、方法、
数据地图平台是字节跳动内部的大数据检索平台,每天近万的字节员工在此查找所需数据。数据地图通过提供便捷的找数,理解数服务,大大节省了内部数据的沟通和建设成本。数据血缘图谱介绍字节的数据可分为端数据和业务数据,这些记录往往需要通过加工处理才能产生业务价值。数据加工处理的流程一般是读取原始数据,进行数据清洗,再经过多种计算和存储,最终汇入指标、报表和数据服务系统。数据血缘描述了数据的来源和去向,以及数据
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2024-02-04 07:11:50
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# Java 血缘关系实现教程
## 前言
作为一名经验丰富的开发者,我将教会你如何实现 Java 中的“血缘关系”。首先,让我们看一下整个实现流程,并逐步学习每一步需要做什么以及需要使用的代码。
## 实现流程
```mermaid
journey
title Java 血缘关系实现流程
section 准备工作
开始 --> 编写基础类和接口 --> 创
原创
2024-07-08 06:26:54
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关系模型表中的几个词汇码模式图关系运算 关系模型:描述数据,数据联系,数据语义,一致性约束的概念公寓的集合。 表中的几个词汇属性 对应表中的列域 列的取值范围(相同数据类型的值的集合)元组 表中的行即为元组关系 由n个域笛卡尔积(即从每个域中抽取作为元组的一个分量)的子集组成的一张2维表称为关系。由于并非所有元组都有意义,所以只有那些有意义的元组的集合才是关系。说白了就是指数据库表。关系有3个
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2023-12-21 06:08:08
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### 数据治理背景 越来越多的企业建立起自己的数据仓库和分析平台。 随着数据的积累以及加工流程越来越复杂,企业对数据的管理变得越来越无力,容易出现数据孤岛、数据指标混乱等情况。对数据进行治理呼声越来越紧迫。 然而,数据治理是一个新课题,目前尚无明确的概念定义和方向。 这里,我们提出一套自己的数据治理方案,希望能引起一些共鸣和讨论。 ### 数据治理步骤:先理后治 ### 数据治理交付内容: 1、
数据血缘是元数据产品的核心能力,但数据血缘是典型的看起来很美好但用起来门槛很高的技术,只要你采买过元数据产品就知道了。这篇文章对数据血缘的特征、价值、用途和方法做了系统阐述:1、特征:归属性、多源性、可追溯及层次性2、价值:数据价值评估、数据质量评估及数据生命周期管理3、用途:合规需求、影响分析和质量问题分析、数据安全和隐私、迁移项目及自服务分析4、方法:自动解析、系统跟踪、机器学习方法及手工的收
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2023-10-26 17:21:55
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摘要:全链路数据血缘,指在数据的全生命周期内,数据与数据之间会形成各式各样的关系,贯穿整个数据链路中。
,作者: 你好_TT。什么是全链路数据血缘根据维基百科定义,数据血缘(Data Lineage)又叫做数据起源(Data Provenance)或者数据家谱(Data Pedigree)。其通常被定义为一种生命周期,主要包含数据的来源以及数据随时间移动的位置。数据血缘是数据资产的重要组成
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2024-08-23 10:35:52
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