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一条命令搞垮MongoDB实例

背景


Part1:写在最前

在副本集架构中,我们会经常通过rs.add(),rs.remove()命令来调整后台数据库架构,在本案例中,我们异常的触发到了一个MongoDBBUG,并尽快的找到了官方的人进行咨询。在生产环境中,我们做实例迁移,将研发自行维护的MongoDB副本集迁移至DBA管理,由于硬件和版本都不符合规范,因此我们对集群先进行了升级处理,又使用了rs.add()rs.remove()来完成数据库的迁移工作。

 

Part2:背景

在研发自行维护的数据库版本为2.6版本,我们先将数据库升级至3.4版本,并利用3.4版本的特性实现0 downtime开启认证。在研发的数据库原有架构中,存在离线节点,即hiddenno-vote节点。也正是因为这一特性,触发了MongoDB宕机。

实战

Part1:整体架构

原有集群为7节点副本集架构,其中2台为hidden节点,并且配置了no-vote参数。

 

Part2:迁移原理

我们利用新的机器使用rs.add()加入到原有副本集,在原有副本集的基础上添加了新的节点,待同步完成后,rs.remove()掉老的研发机器,完成实例迁移。

 

Part3:错误日志

在使用rs.remove时,我们提前写好了迁移文档,由于rs.remove()的速度很快,我们采取了直接rs.remove()多个节点的复制粘贴方式,这个也可能是后续导致crash的原因之一。

rs.remove()

2018-04-17T14:54:23.793+0800 I NETWORK  [conn163572] received client metadata from 192.168.1.100:16400 conn163572: { driver: { name: "PyMongo", version: "3.5.1" }, os: { type: "Linux", name: "CentOS 6.4 Final", architecture: "x86_64", version: "2.6.32-279.23.1.mi5.el6.x86_64" }, platform: "CPython 2.7.6.final.0" }
2018-04-17T14:54:23.811+0800 I NETWORK  [thread1] connection accepted from 192.168.1.101:57568 #163573 (73 connections now open)
2018-04-17T14:54:23.811+0800 I NETWORK  [conn163573] received client metadata from 192.168.1.101:57568 conn163573: { driver: { name: "PyMongo", version: "3.5.1" }, os: { type: "Linux", name: "CentOS 6.3 Final", architecture: "x86_64", version: "2.6.32-279.23.1.mi5.el6.x86_64" }, platform: "CPython 2.7.6.final.0" }
2018-04-17T14:54:23.818+0800 I -        [replication-25230] Invariant failure i < _members.size() src/mongo/db/repl/repl_set_config.cpp 620
2018-04-17T14:54:23.818+0800 I -        [replication-25230] 

***aborting after invariant() failure


2018-04-17T14:54:23.822+0800 I NETWORK  [thread1] connection accepted from 192.168.1.102:32210 #163574 (74 connections now open)
2018-04-17T14:54:23.822+0800 I NETWORK  [conn163574] received client metadata from 192.168.1.102:32210 conn163574: { driver: { name: "PyMongo", version: "3.5.1" }, os: { type: "Linux", name: "CentOS 6.3 Final", architecture: "x86_64", version: "2.6.32-279.23.1.mi5.el6.x86_64" }, platform: "CPython 2.7.6.final.0" }
2018-04-17T14:54:23.822+0800 I NETWORK  [thread1] connection accepted from 192.168.1.101:57569 #163575 (75 connections now open)
2018-04-17T14:54:23.823+0800 I NETWORK  [thread1] connection accepted from 192.168.1.103:50661 #163576 (76 connections now open)
2018-04-17T14:54:23.824+0800 I NETWORK  [conn163576] received client metadata from 192.168.1.103:50661 conn163576: { driver: { name: "PyMongo", version: "3.5.1" }, os: { type: "Linux", name: "CentOS 6.3 Final", architecture: "x86_64", version: "2.6.32-279.23.1.mi5.el6.x86_64" }, platform: "CPython 2.7.6.final.0" }
2018-04-17T14:54:23.830+0800 I NETWORK  [thread1] connection accepted from 192.168.1.101:57570 #163577 (77 connections now open)
2018-04-17T14:54:23.830+0800 I NETWORK  [conn163577] received client metadata from 192.168.1.101:57570 conn163577: { driver: { name: "PyMongo", version: "3.5.1" }, os: { type: "Linux", name: "CentOS 6.3 Final", architecture: "x86_64", version: "2.6.32-279.23.1.mi5.el6.x86_64" }, platform: "CPython 2.7.6.final.0" }
2018-04-17T14:54:23.832+0800 I NETWORK  [thread1] connection accepted from 192.168.1.104:41163 #163578 (78 connections now open)
2018-04-17T14:54:23.838+0800 F -        [replication-25230] Got signal: 6 (Aborted).

 0x7ffc3f0a41d1 0x7ffc3f0a3159 0x7ffc3f0a363d 0x7ffc3c0bf500 0x7ffc3bd4f8a5 0x7ffc3bd51085 0x7ffc3e2d7a8e 0x7ffc3ea5883c 0x7ffc3ea58999 0x7ffc3eb19b9d 0x7ffc3eaa2676 0x7ffc3e9c83e9 0x7ffc3e9b0032 0x7ffc3ea41bf7 0x7ffc3e3812f1 0x7ffc3ee25a5a 0x7ffc3ee28e53 0x7ffc3ee2932b 0x7ffc3f0185bc 0x7ffc3f01906c 0x7ffc3f019a56 0x7ffc3fdc7a00 0x7ffc3c0b7851 0x7ffc3be0511d
----- BEGIN BACKTRACE -----
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05000", "path" : "/lib64/libkrb5support.so.0", "elfType" : 3, "buildId" : "DAE2A7E4E8B37D43EF6839FF5D8E012AFCF21A69" }, { "b" : "7FC5BF902000", "path" : "/lib64/libkeyutils.so.1", "elfType" : 3, "buildId" : "8A8734DC37305D8CC2EF8F8C3E5EA03171DB07EC" }, { "b" : "7FC5C16E3000", "path" : "/lib64/libselinux.so.1", "elfType" : 3, "buildId" : "A287DC6B86A9823038F057105CE64671E0B392EC" } ] }}
 mongod(_ZN5mongo15printStackTraceERSo+0x41) [0x7ffc3f0a41d1]
 mongod(+0x1681159) [0x7ffc3f0a3159]
 mongod(+0x168163D) [0x7ffc3f0a363d]
 libpthread.so.0(+0xF500) [0x7ffc3c0bf500]
 libc.so.6(gsignal+0x35) [0x7ffc3bd4f8a5]
 libc.so.6(abort+0x175) [0x7ffc3bd51085]
 mongod(_ZN5mongo17invariantOKFailedEPKcRKNS_6StatusES1_j+0x0) [0x7ffc3e2d7a8e]
 mongod(+0x103683C) [0x7ffc3ea5883c]
 mongod(+0x1036999) [0x7ffc3ea58999]
 mongod(_ZNK5mongo4repl23TopologyCoordinatorImpl22shouldChangeSyncSourceERKNS_11HostAndPortERKNS0_6OpTimeERKNS_3rpc15ReplSetMetadataEN5boost8optionalINS8_18OplogQueryMetadataEEENS_6Date_tE+0x32D) [0x7ffc3eb19b9d]
 mongod(_ZN5mongo4repl26ReplicationCoordinatorImpl22shouldChangeSyncSourceERKNS_11HostAndPortERKNS_3rpc15ReplSetMetadataEN5boost8optionalINS5_18OplogQueryMetadataEEE+0xB6) [0x7ffc3eaa2676]
 mongod(_ZN5mongo4repl31DataReplicatorExternalStateImpl18shouldStopFetchingERKNS_11HostAndPortERKNS_3rpc15ReplSetMetadataEN5boost8optionalINS5_18OplogQueryMetadataEEE+0x59) [0x7ffc3e9c83e9]
 mongod(+0xF8E032) [0x7ffc3e9b0032]
 mongod(_ZN5mongo4repl12OplogFetcher9_callbackERKNS_10StatusWithINS_7Fetcher13QueryResponseEEEPNS_14BSONObjBuilderE+0x1E57) [0x7ffc3ea41bf7]
 mongod(_ZN5mongo7Fetcher9_callbackERKNS_8executor12TaskExecutor25RemoteCommandCallbackArgsEPKc+0x621) [0x7ffc3e3812f1]
 mongod(+0x1403A5A) [0x7ffc3ee25a5a]
 mongod(_ZN5mongo8executor22ThreadPoolTaskExecutor11runCallbackESt10shared_ptrINS1_13CallbackStateEE+0x1B3) [0x7ffc3ee28e53]
 mongod(+0x140732B) [0x7ffc3ee2932b]
 mongod(_ZN5mongo10ThreadPool10_doOneTaskEPSt11unique_lockISt5mutexE+0x14C) [0x7ffc3f0185bc]
 mongod(_ZN5mongo10ThreadPool13_consumeTasksEv+0xBC) [0x7ffc3f01906c]
 mongod(_ZN5mongo10ThreadPool17_workerThreadBodyEPS0_RKNSt7__cxx1112basic_stringIcSt11char_traitsIcESaIcEEE+0x96) [0x7ffc3f019a56]
 mongod(+0x23A5A00) [0x7ffc3fdc7a00]
 libpthread.so.0(+0x7851) [0x7ffc3c0b7851]
 libc.so.6(clone+0x6D) [0x7ffc3be0511d]
-----  END BACKTRACE  -----


Part4:问题分析

我们可以看到,在错误日志中存在如下内容:

Invariant failure i < _members.size() src/mongo/db/repl/repl_set_config.cpp 620

我们可以看到,在错误日志中存在如下内容:

Invariant failure i < _members.size() src/mongo/db/repl/repl_set_config.cpp 620

通过追寻源码,我们定位到该处逻辑:

1.png

透过invariant关键字,我们向上追寻,可以找到如下内容:

2.png

3.png

看完代码逻辑,我们认为报错的原因是由于批量rs.remove()引起,由于批量rs.remove(),代码逻辑中可以看出有一个判断:

const MemberConfig& ReplSetConfig::getMemberAt(size_t i) const

{ invariant(i < _members.size()); return _members[i]; }

例如,一个5节点的副本集,那么他的_id索引值为0,1,2,3,4。此时_members.size5 4 must <5逻辑是正确的。

但当我们使用rs.remove()命令删除超过1个节点成员时,例如同时删除_id=3_id=4的,那么此时副本集就只有3个成员,_members.size变为3

但是i值却依旧因为某些原因停留在44<3这个逻辑不对,导致了被删除节点abort退出crash。当然这个推论目前我们没有确切的证据。

 

Part5:Mongo官方人员答复

同时,我们搜索到了相关的mongoDB jira,留言了我们的疑问,官方的jira中也是其他网友遇到的问题。他们的情况比我们的要更明显一些,是由于no-vote节点rs.remove导致的

笔者案例中也确实存在no-vote节点。目前官方给出的答复计划在4.1版本中进行修复。

4.png5.png

6.png


官方jira连接

https://jira.mongodb.org/browse/SERVER-28079

 

Part6:规避方法

1.     将非投票节点升级为投票节点;

2.     请提前做好备份,以备不时之需。

——总结——

通过本文,我们了解到rs.remove()潜在可能导致mongoDB crash的场景,由于时间有限,且crash掉的机器本就是我们计划rs.remove()掉的节点,因此在笔者复现无果后,决定暂时放弃继续跟进这个issue。如果有网友遇到过类似的问题,且找到了根本原因和复现方式,可在博文下留言,笔者感激不尽!~由于笔者的水平有限,编写时间也很仓促,文中难免会出现一些错误或者不准确的地方,不妥之处恳请读者批评指正。喜欢笔者的文章,右上角点一波关注,谢谢~

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